鳥的DNA有助于解釋亞馬遜河流在進(jìn)化中的作用
當(dāng)年輕的博物學(xué)家阿爾弗雷德·R·華萊士于1848年離開英格蘭探索新世界時(shí),他在亞馬遜地區(qū)的一個(gè)重要觀察結(jié)果是,大型河流對(duì)某些動(dòng)物物種,特別是靈長類動(dòng)物和鳥類來說是無法逾越的障礙。更有趣的是,他注意到密切相關(guān)的物種經(jīng)常占據(jù)河流兩側(cè)的森林,但它們從未被發(fā)現(xiàn)在一起。
事實(shí)上,亞馬遜鳥類中有數(shù)百個(gè)跨河對(duì)的例子,這是地球上任何其他地方都看不到的現(xiàn)象。通常棲息在巴西里奧內(nèi)格羅河下游森林中的大約240種鳥類中,近三分之一被另一側(cè)密切相關(guān)的物種所取代。例如,在左岸你會(huì)看到帶有紅喉的黑斑巴貝克(Capito niger)。在右岸,你只會(huì)看到與橙色喉嚨密切相關(guān)的Guilded Barbets(Capito auratus)。
自從我1999年第一次訪問該地區(qū)以來,亞馬遜河就讓我著迷,并成為我作為熱帶生物學(xué)家研究的主要焦點(diǎn)。華萊士所描述的替代模式讓我著迷,并花了無數(shù)個(gè)小時(shí)研究鳥類分布圖。
然而,盡管多年的研究,進(jìn)化生物學(xué)家仍然不確定河流在亞馬遜河的物種形成過程中所扮演的角色。河流會(huì)產(chǎn)生新物種嗎?或者只是作為次要障礙,為其他地方形成的物種提供自然界限?所有這些成對(duì)的譜系是否同時(shí)發(fā)生分歧,除以共同的障礙?或者每個(gè)物種都遵循自己的進(jìn)化路徑?
當(dāng)我們開始探索仍然是亞馬遜流域最原始地區(qū)之一的Rio Negro時(shí),這些問題引導(dǎo)了我的同事和我。就像早期自然主義者進(jìn)行的探險(xiǎn)一樣,我們的長途旅行涉及到達(dá)偏遠(yuǎn)地區(qū)。但我們配備了計(jì)算機(jī),數(shù)字圖像,GPS設(shè)備,數(shù)字錄音機(jī)和液氮,以使我們的樣品保持在非常低的溫度,直到我們可以在實(shí)驗(yàn)室中進(jìn)行遺傳分析。我們的計(jì)劃是使用來自河對(duì)岸的鳥類的組織樣本來評(píng)估它們的進(jìn)化歷史。
從一個(gè)物種演變?yōu)閮蓚€(gè)物種
通過觀察不同銀行之間個(gè)體之間的遺傳分化程度,現(xiàn)代自然主義者能夠追蹤自這些人群開始其獨(dú)立進(jìn)化歷史以來已經(jīng)過去了多少時(shí)間。生物學(xué)家無法達(dá)成共識(shí)的是這些河流在它們目前分裂的物種的進(jìn)化歷史中起了什么作用。
一個(gè)顯而易見的可能性是,祖先物種的范圍被新形成的河流解剖,隔離了大塊的森林。截止種群將緩慢變化并彼此區(qū)分。如果有足夠的時(shí)間,他們的差異將變得非常大,以至于他們不再認(rèn)識(shí)對(duì)方作為配對(duì)和養(yǎng)育后代的潛在配偶 - 他們將成為不同的物種。這個(gè)想法被稱為河流障礙假說。這是為什么亞馬遜流域有這么多物種的最古老的解釋。
另一種模式表明,河流是次要障礙。根據(jù)這一想法,雖然它們目前對(duì)于確定物種的地理界限很重要,但河流與祖先種群的初始分離無關(guān)。
但是,這里很難不提出最明顯的問題。鳥類進(jìn)行史詩般的長距離遷徙,能夠從極地到極地旅行。亞馬遜流域,即使是大型河流,如何在世界范圍內(nèi)成為障礙?鳥類不能簡單地過河,與親人團(tuán)聚,避免成為兩個(gè)不同的物種?
簡短的回答顯然不是。對(duì)于許多森林棲息物種而言,河流確實(shí)似乎是不可逾越的障礙。實(shí)驗(yàn)表明,許多鳥類無法在開闊的風(fēng)景中飛行一百碼,更不用說穿越幾公里長的亞馬遜河。
測試河流在鳥類進(jìn)化中的作用
我們的第一步是在上游映射這些對(duì)替換的確切位置。眾所周知,所研究的所有對(duì)都在較低的里奧內(nèi)格羅(Rio Negro)周轉(zhuǎn),在一些地方的范圍可達(dá)10公里。然而,上游河流更窄,更換模式變得更加復(fù)雜,涉及小河流。
當(dāng)種群之間的差異相對(duì)較大時(shí) - 如羽毛圖案,顏色或歌曲對(duì)通常被認(rèn)為是不同的物種。當(dāng)差異微妙時(shí) - 例如大小或羽毛色調(diào)或色調(diào) - 鳥類學(xué)家傾向于將它們視為不同的亞種。無論是物種對(duì)還是亞種對(duì),生物學(xué)家都將它們稱為“成對(duì)分類群”。
我們詳細(xì)調(diào)查了74對(duì)分類群,其范圍被Rio Negro及其最大支流Rio Branco的各種組合劃分。這兩條河流都是數(shù)十種鳥類的生物地理屏??障。經(jīng)過十多年的實(shí)地考察,以及巴西和美國主要博物館和館藏的貢獻(xiàn),我們的團(tuán)隊(duì)獲得了幾乎所有鳥類和亞種的分布和遺傳數(shù)據(jù),這些物種和亞種在河的兩邊都有所不同。
我們推斷,如果一條河流解剖了景觀并同時(shí)分離了許多鳥類群體,那么這些群體應(yīng)該呈現(xiàn)大致相似的分歧時(shí)期。如果河流充當(dāng)次要障礙,對(duì)可能會(huì)出現(xiàn)一整套年齡段。在這種情況下,對(duì)可能比目前約束其分布的河流更舊,因?yàn)楦鶕?jù)該模型,一個(gè)物種的原始分裂不依賴于河流的出現(xiàn)。
我們使用經(jīng)過時(shí)間校準(zhǔn)的分子數(shù)據(jù)來近似計(jì)算出我們的74對(duì)相關(guān)鳥類中的每一只在進(jìn)化上分別走向它們的方式。一些基因以可預(yù)測的穩(wěn)定速率發(fā)生突變,使科學(xué)家們能夠估計(jì)自任何一對(duì)生物體發(fā)散以來所經(jīng)歷的時(shí)間。他們的基因組變化越多,他們共享共同祖先的時(shí)間就越長。這就像看研究人員所說的“分子鐘”。
當(dāng)我們觀察鳥類樣本的分子鐘時(shí),我們發(fā)現(xiàn)分歧事件并未在特定的時(shí)間范圍內(nèi)聚集。相反,它們的范圍從0.2到800萬年前。因此,目前由共同屏障劃分的所有禽類對(duì),例如黑人或布蘭科,都不太可能是由這些河流的起源產(chǎn)生的。
此外,地貌數(shù)據(jù)表明這些河流最近建立了現(xiàn)在的位置。Rio Negro的大約日期大約是一百萬年,而Rio Branco顯然更近,約為20,000年。因此,兩條河流似乎都比它們目前劃分的大多數(shù)鳥類都要年輕得多,支持二級(jí)接觸屏障模型:今天的河流保持了邊界,但時(shí)間表明它們不能負(fù)責(zé)最初分離大多數(shù)鳥類對(duì)我們學(xué)習(xí)了。
另一方面,里約黑人似乎確實(shí)有百萬年的歷史。我們的模型不能拒絕在這個(gè)年齡段發(fā)生的12對(duì)鳥類分類群的常見多樣化事件,其DNA表明它們在過去的百萬年內(nèi)發(fā)生了分歧。因此,盡管研究的大多數(shù)對(duì)的起源可能與河流的起源無關(guān),但特別是Rio Negro可能是某些物種的主要障礙。
我們在Science Advances上發(fā)表的新研究提供了令人信服的證據(jù),證明亞馬遜河流可能具有雙重進(jìn)化作用。根據(jù)河流障礙假說的提出,它們可以作為某些譜系的主要障礙。但更常見的是,它們是大多數(shù)鳥類譜系的次要障礙。這些結(jié)果僅來自亞馬遜地區(qū)的一個(gè)重要區(qū)域,而其他盆地的類似研究將我們的結(jié)果置于更廣泛的背景下。
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