研究人員詳述了有史以來發(fā)現(xiàn)的最大蛋白質之一
生活在南極冰冷水域的細菌通過抓住冰面而生存下來。埃因霍溫科技大學(TU / e),女王大學(加拿大)和耶路撒冷希伯來大學(以色列)的一組研究人員詳細介紹了細菌用來做這種活動的蛋白質 - 一種可延伸的錨。非常特別,因為600納米,它是迄今為止已經確定結構的最大蛋白質之一。也是有用的,因為如果你想要防止這種情況,例如在以類似方式抓住人體細胞的病原菌中,有關細菌如何附著自身的知識是有幫助的。
人們一直認為這種蛋白質包含在Marinomonas promoryiensis細菌的體內,有助于防止細菌在南極冰冷的水域中凍結。直到幾年前才發(fā)現(xiàn)這種叫做MpAFP的蛋白質實際上位于細菌表面,作為一種“粘附素”,一種固定在表面上的錨,在這種情況下是冰面上方的水。
巨型格式
由Ilja Voets博士(TU / e)和Peter Davies教授(女王)領導的研究人員現(xiàn)已在Science Advances雜志的一篇出版物中詳細介紹了這種蛋白質的整體結構。“這是第一個這樣的粘附素,”主要作者Shuaiqi Guo(Phil)說,他作為加拿大的博士生從事這項研究,從那時起一直在埃因霍溫工作。“此外,它是有史以來最詳細的蛋白質之一。在600納米的長度上,與大多數(shù)2至15納米的蛋白質相比,它是一個巨大的。”
拼圖游戲
由于體積龐大,需要采用不同的方法。蛋白質通常以相同的構型結晶 - 固化 - 因此可以使用X射線衍射確定它們的結構。“我們將蛋白質切成五個部分并用不同的方法進行研究,”Voets說。“除了X射線衍射,我們還使用了X射線散射,這是我們在埃因霍溫的專業(yè)領域和核磁共振。”然后他們把所有碎片放在一起就像一個拼圖游戲。
合作關系
他們發(fā)現(xiàn)每塊蛋白質都有自己的功能。并且這種蛋白質可以幫助細菌在這些極端條件下生存得很好,盡管與想象的不同。蛋白質能夠與水中的“硅藻”結合,這些微生物能夠光合細菌所需的氧氣。由于這種結合,這些生物體停留在水的表面,因此在那里存在最多的光 - 共生關系。
預防依戀
這項工作的一個可能的應用是開發(fā)確保細菌不能實際抓住某些表面的方法。“例如,我們看到實際的'夾持'發(fā)生在蛋白質極端的一小部分,”Voets說。“致病細菌以同樣的方式附著在它們引起感染的人體細胞上。現(xiàn)在我們知道它們如何附著自己,我們應該能夠找到一種方法來阻止它。”
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