尋找一個城市的DNA 試試它的ATM
根據本周發(fā)表于美國微生物學會開放獲取期刊mSphere的一項研究,紐約市的自動取款機鍵盤有大量的微生物,但它們大部分來自正常的人類皮膚,家庭表面或食物痕跡。“我們的研究結果表明,ATM鍵盤可以整合來自不同來源的微生物,包括人類微生物組,食物以及適應空氣或表面的潛在新環(huán)境生物,”高級研究作者,基因組學中心主任Jane M. Carlton博士說。系統生物學,紐約大學生物學教授。“從ATM鍵盤獲得的DNA因此可以提供人類行為和微生物環(huán)境來源的記錄。”
在研究過程中 - 2014年6月和7月研究人員在紐約市研究微生物的更大努力的一部分 - 調查人員在紐約三個紐約自治市:曼哈頓,皇后區(qū)和布魯克林的八個街區(qū)的66臺ATM機上擦了幾個鍵盤。其中四臺機器位于室外。然后,在實驗室中,他們用16S擴增子測序研究樣品,用于鑒定和比較細菌; 和18S擴增子測序,用于鑒定寄生蟲,真菌和原生生物(其他微觀生物)。大多數樣本中發(fā)現的最豐富的細菌是來自Actinobacteria,Bacteroides,Firmicutes和Proteobacteria的正常人類皮膚微生物。家庭??傮w而言,細菌樣本的多樣性較低,并且沒有明顯的地理聚類。在18S測序中,研究人員發(fā)現了一些真菌和低水平的原生生物。
鍵盤上最常見的微生物來源是家用表面,如電視,洗手間,廚房和枕頭。研究人員發(fā)現了來自硬骨魚和軟體動物的微生物,以及一些鄰近自動取款機上的雞肉,這表明餐食殘留的DNA可能會留在人的手中,并在使用時轉移到ATM鍵盤上。
位于自助洗衣店和商店的ATM鍵盤具有最高數量的生物標記物,其中最突出的是乳酸桿菌(乳酸菌),其通常存在于分解植物或乳制品中。在曼哈頓的樣本中,研究人員觀察了生物標志物Xeromyces bisporus,一種與變質烘焙食品相關的食源性霉菌。“似乎有理由認為這種真菌可能是從最近處理烘焙食品的人那里轉移出來的,特別是在曼哈頓中城等通勤密集的地區(qū),附近有許多便利店和向商業(yè)工人出售這類食品的咖啡館, “卡爾頓說。
研究人員發(fā)現,在戶外與室內ATM之間的鍵盤沒有顯著差異。
由于紐約市每個ATM鍵盤最有可能每天被數百人使用(并且可能與來自不同城市表面的空氣,水和微生物接觸),因此本研究中獲得的微生物群落可能代表“平均”該研究的共同作者,紐約大學醫(yī)學院人類微生物組計劃副教授Maria Gloria Dominguez-Bello博士說,這個社區(qū)實際上匯集了來自不同來源的社區(qū)。
研究人員表示,地點之間相對缺乏多樣性可能是由于定期清理機器,這會消滅一些微生物,以及游客使用ATM,來自其他地方的通勤者等。接下來,他們將研究城市貓,狗,老鼠,鴿子和蟑螂中的微生物。
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