牦?;蚪M測(cè)序
由中國(guó)蘭州大學(xué)領(lǐng)導(dǎo)的國(guó)際研究團(tuán)隊(duì)完成了雌性家牦牛的基因組序列。
作為西藏的標(biāo)志性象征,牦牛,Bos gr,是中國(guó)青海省生活在高海拔地區(qū)的西藏人最重要的馴化物種,可以提供肉類和其他基本資源,如牛奶,運(yùn)輸,干糞燃料,并隱藏帳篷住宿。
牦牛具有許多解剖學(xué)和生理學(xué)特征,使它們能夠生活在高海拔地區(qū),包括高代謝,急性感覺(jué),令人印象深刻的覓食能力,心臟和肺部增大,以及當(dāng)面對(duì)相對(duì)較低的氧氣條件時(shí)肺部缺乏血管收縮。
研究人員使用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)雌性家牦牛的基因組進(jìn)行了測(cè)序?;蚪M數(shù)據(jù)產(chǎn)生2,657Mb草牦牛基因組組裝,覆蓋率為65倍。他們還對(duì)來(lái)自同一牦牛的新鮮心臟,肝臟,腦,胃和肺組織的RNA樣品進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測(cè)序?;谵D(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),研究人員估計(jì)牦?;蚪M包含22,282個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因和220萬(wàn)個(gè)雜合SNP。結(jié)果發(fā)表在Nature Genetics上。
為了了解牦牛在高海拔地區(qū)的進(jìn)化適應(yīng)性,該團(tuán)隊(duì)對(duì)牦牛和牛進(jìn)行了比較基因組分析,這是一種通常生活在低海拔地區(qū)的密切相關(guān)的動(dòng)物。雖然牦牛和牛估計(jì)在490萬(wàn)年前分化,但許多牦牛和?;蛉匀环浅O嗨?,這兩種動(dòng)物共享45%的蛋白質(zhì)特性和99.5%的蛋白質(zhì)相似性。
然而,他們發(fā)現(xiàn)了與牦牛中感官知覺(jué)和能量代謝相關(guān)的不同基因擴(kuò)增。
研究人員還發(fā)現(xiàn)了與細(xì)胞外環(huán)境和低氧應(yīng)激相關(guān)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域的富集。特別是,他們發(fā)現(xiàn)牦牛中與缺氧和營(yíng)養(yǎng)代謝相關(guān)的直系同源基因經(jīng)歷了正向選擇和快速進(jìn)化。
關(guān)于牦牛高海拔適應(yīng)性的研究可能有助于改善目前對(duì)人類高原反應(yīng)和其他缺氧相關(guān)疾病的理解,治療和預(yù)防。此外,牦?;蚪M為加速這種重要?jiǎng)游锏呐D毯腿忸惿a(chǎn)的遺傳改良提供了寶貴的資源。
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