真菌依靠細(xì)菌來(lái)調(diào)節(jié)其生殖機(jī)器的關(guān)鍵組成部分
為了更好地了解有益生物(共生體)如何在寄主世代之間傳播,研究人員調(diào)查了生活在宿主內(nèi)部的細(xì)菌(內(nèi)共生體)對(duì)真菌宿主繁殖的作用,以及它們調(diào)節(jié)的生殖基因。細(xì)菌內(nèi)共生菌Burkholderia被認(rèn)為是共生的,其中兩種生物都受益于結(jié)合,但預(yù)計(jì)它們是與它們的土壤真菌宿主Rhizopus microsporus的寄生相互作用進(jìn)化而來(lái)。研究人員發(fā)現(xiàn),建立對(duì)繁殖控制的內(nèi)生菌可能是這種進(jìn)化過(guò)渡的關(guān)鍵。利用該模型,研究人員還生成了第一個(gè)早期真菌有性繁殖的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集,并發(fā)現(xiàn)了對(duì)這一過(guò)程至關(guān)重要的基因。
在沒(méi)有Burkholderia endobacteria的情況下,Rhizopus真菌不能作為植物病原體,它不能無(wú)性繁殖,研究人員現(xiàn)在發(fā)現(xiàn),端粒菌也可以調(diào)節(jié)其有性生殖。這項(xiàng)工作揭示了一組知之甚少的含油或產(chǎn)油真菌,以及這種共生相互作用對(duì)這些潛在的大規(guī)模生物柴油生產(chǎn)真菌的影響。
在可遺傳的共生主義中,主人們?cè)谑来g傳遞有益的共生體。然而,這種關(guān)系的起源往往是對(duì)立的,寄生蟲(chóng)首先需要在與宿主合作之前確保自己的傳播。利用植物病原真菌Rhizopus microsporus(Rm)和Burkholderia endobacteria之間的共生關(guān)系,由康奈爾大學(xué)的研究人員和聯(lián)合基因組研究所的科學(xué)家共同開(kāi)展了一項(xiàng)DOE科學(xué)用戶(hù)設(shè)施辦公室,以了解對(duì)抗性如何 - 發(fā)生了互惠轉(zhuǎn)型。根霉是一種真菌的作物病原體,包括候選生物能源原料向日葵和玉米,以及一部分產(chǎn)油的粘多糖菌群,其中鮮為人知。康奈爾大學(xué)的團(tuán)隊(duì)培養(yǎng)并試驗(yàn)了真菌和細(xì)菌,而DOE JGI團(tuán)隊(duì)對(duì)一個(gè)宿主基因組(Rm ATCC 52813)進(jìn)行了測(cè)序和注釋?zhuān)鳛?000個(gè)真菌基因組項(xiàng)目的一部分。
正如2017年11月29日出版的Nature Communications報(bào)道,研究小組發(fā)現(xiàn),這種真菌高度依賴(lài)于伯克霍爾德氏菌(Burkholderia endobacteria),無(wú)論是性還是無(wú)性繁殖。這種依賴(lài)性與共生進(jìn)化的成癮模型一致;在這種情況下,內(nèi)生菌控制ras2-1的表達(dá),ras2-1是一種對(duì)生殖發(fā)育至關(guān)重要的基因,使真菌依賴(lài)于細(xì)菌的持續(xù)存在。通過(guò)研究Rm-Burkholderia共生模型,該團(tuán)隊(duì)能夠在真菌王國(guó)的幾個(gè)分支中重建生殖途徑,在早期真菌中產(chǎn)生第一個(gè)有性生殖的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集,以找到真菌中的性相關(guān)基因。他們還揭示了所有粘多糖的保守候選基因,這些基因似乎參與鑒定對(duì)這種真菌生殖途徑至關(guān)重要的信息素。
如果沒(méi)有共生的Rm-Burkholderia關(guān)系,Rhizopus既不是植物病原體,也不能輕易繁殖。到目前為止,所有在真菌中發(fā)現(xiàn)的內(nèi)共生菌已被證明可顯著影響宿主脂質(zhì)代謝。由于這些產(chǎn)油真菌是替代燃料的潛在可持續(xù)來(lái)源,因此了解真菌 - 細(xì)菌關(guān)系可以闡明這些相互作用如何影響粘多糖的脂質(zhì)生成及其工業(yè)用途。
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