對狗基因組的分析將提供對人類疾病的洞察力
根據(jù)由基因組分析中心(TGAC)領(lǐng)導的一項新研究,犬類基因組的非編碼RNA是研究人類疾病的重要模型,是進化和生物醫(yī)學研究的重要起點。今天在PLOS ONE上發(fā)表的一項新研究揭示了狗基因組中microRNAs的改進注釋,以進一步了解其生物學作用。為將來研究生物醫(yī)學,進化和重要動物(包括狗,牛,馬和豬)的馴化提供平臺。
微小RNA(miRNA)是小的非編碼RNA分子,其在調(diào)節(jié)動物和植物中的基因表達中起關(guān)鍵作用。使用最新的狗基因組裝配和九種不同狗組織的小RNA序列,包括皮膚,血液,卵巢和睪丸,來自TGAC的科學家已經(jīng)鑒定出91種新型miRNA。
這一發(fā)現(xiàn)提供了一個重要的機會,不僅可以增強我們對miRNA如何調(diào)節(jié)用于研究人類疾病的重要模型物種中的各種生物過程的理解,而且可以導致進一步的類似研究miRNA在動物馴化中的作用。來自TGAC脊椎動物和健康基因組學的首席研究員Luca Penso Dolfin博士說:“由于miRNA在編排各種細胞過程中非常重要,因此發(fā)現(xiàn)這91種新型miRNA是探索其潛在重大影響的重要起點?;蛘{(diào)控。“
總體而言,Penso-Dolfin博士分析了811個miRNA:91個新的microRNA序列和720個保守的(即,對其他生物共有)。在這些保守的基因座中,207個先前未被鑒定為犬microRNA。
Penso-Dolfin博士補充說:“我們的結(jié)果代表了我們對狗基因組知識的明顯改善,為進一步研究基因調(diào)控的進化以及microRNA對病理狀況的貢獻鋪平了道路。我們現(xiàn)在正在尋找額外的狗和各種農(nóng)場動物的數(shù)據(jù),將microRNA發(fā)現(xiàn)與其在馴化中可能發(fā)揮的作用的研究結(jié)合起來。“
家犬Canis familiaris是狼(Canis lupus)馴化的結(jié)果,它起源于大約1萬年前。從那以后,人工選擇了數(shù)百種犬種,導致形態(tài)和行為變異程度非常高。自從狗出現(xiàn)以來,它與人類共享環(huán)境,已經(jīng)暴露于類似的病原體,因此代表了人類疾病研究的重要模型系統(tǒng)。
最新的Canine基因組構(gòu)建和注釋的發(fā)布,CanFam3.1提供了一個機會,可以增強我們對狗模型系統(tǒng)中組織間基因調(diào)控的理解。
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