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        科學(xué)家開發(fā)了一種新方法來了解DROSHA蛋白切割的位置和位置
        
			
        
				2019-06-26 09:40:45
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        我們身體的每個細胞都是一個復(fù)雜機制的管弦樂隊的結(jié)果，這些機制可以控制哪些基因在任何特定時間都被表達。部分地，這可能歸功于幾種類型的RNA分子的協(xié)調(diào)，例如microRNA(miRNA)?；A(chǔ)科學(xué)研究所(IBS)內(nèi)的RNA研究中心的研究人員開發(fā)了一種名為fCLIP-seq的新技術(shù)，該技術(shù)可分析由RNA切割蛋白DROSHA產(chǎn)生的miRNA片段。DROSHA調(diào)節(jié)了幾個過程，例如神經(jīng)元發(fā)育，骨髓形成和RNA病毒的抑制。因此，預(yù)計本研究將開辟新途徑，以了解DROSHA在這些重要生物現(xiàn)象中的作用。Molecular Cell提供了對這些發(fā)現(xiàn)的完整描述。
        

        科學(xué)家開發(fā)了一種新方法來了解DROSHA蛋白切割的位置和位置
        

        miRNA是基因調(diào)控的一個重要和古老的組成部分，它調(diào)節(jié)多達30-60%的哺乳動物蛋白編碼基因的表達，通常使它們沉默。超過2,000種miRNA存在于人體細胞中，在發(fā)育，細胞分化，細胞分裂，細胞死亡和癌癥發(fā)展中發(fā)揮著各種關(guān)鍵作用。成熟的miRNA是短RNA分子，長約22個核苷酸，源自多步驟過程，其開始于稱為初級miRNA(pri-miRNA)的較長RNA片段。DROSHA功能是將這些pri-miRNA切割成較短的片段。
        

        該研究是pri-miRNA上DROSHA切割位點的第一次基因組規(guī)模分析。“fCLIP-seq代表甲醛交聯(lián)，免疫沉淀和測序。通過用甲醛處理細胞，我們設(shè)法保持DROSHA與其RNA結(jié)合物之間的結(jié)合，這樣我們就可以研究DROSHA與其結(jié)合的位置和切割位置， “該研究的第一作者KIM Baekgyu解釋說。“這一結(jié)果不僅可以作為miRNA研究的良好數(shù)據(jù)庫，而且可以加深我們對miRNA生成的理解。”
        

        該研究小組在pri-miRNA上發(fā)現(xiàn)了數(shù)百個DROSHA切割位點，包括即使在世界上最大的miRNA數(shù)據(jù)庫miRBase中也未發(fā)現(xiàn)的新信息。
        

        有趣的是，IBS生物學(xué)家在DROSHA處理后發(fā)現(xiàn)了額外的miRNA末端修飾，預(yù)計這對miRNA生物發(fā)生的調(diào)節(jié)很重要，miRNA生物發(fā)生的失調(diào)通常與疾病有關(guān)，特別是與癌癥有關(guān)。
        

        此外，他們發(fā)現(xiàn)多種替代DROSHA切割模式，從相同的pri-miRNA前體開始產(chǎn)生不同的miRNA產(chǎn)物。僅在極少數(shù)miRNA中報告，IBS科學(xué)家發(fā)現(xiàn)這實際上發(fā)生在幾種情況下。
        

        該研究小組還發(fā)現(xiàn)，DROSHA可以切割數(shù)十種非pri-miRNA靶點，這表明DROSHA具有新的可能功能，可以進一步探索。
        
			

			
          
        
			
        
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