一項(xiàng)新的研究報(bào)告了人類精子微生物群的首次詳細(xì)描述，使用了一種新的RNA，該RNA排列了能夠區(qū)分精子RNA和細(xì)菌污染或定植的技術(shù)。

這項(xiàng)研究發(fā)表在2020年1月的《生殖與遺傳學(xué)》雜志上。研究表明，安排非目標(biāo)RNA序列有可能識(shí)別感染的存在，以及檢測(cè)精子的存在。因此，在對(duì)不孕不育人群進(jìn)行常規(guī)評(píng)估期間，這可能為更好和更個(gè)性化的護(hù)理提供機(jī)會(huì)。

RNA排序是一種遺傳技術(shù)，在這種技術(shù)中，RNA的數(shù)量和序列被發(fā)現(xiàn)使用下一代排序(NGS)技術(shù)。它基本上是對(duì)轉(zhuǎn)錄組的探索，是所有轉(zhuǎn)錄的dna RNA的總和，包括mRNA、tRNA和rRNA。這有助于將dna信息，或基因表達(dá)，與真正合成的蛋白質(zhì)聯(lián)系起來，這些蛋白質(zhì)決定了細(xì)胞的真正功能。它顯示了正在分析的樣本中的基因活動(dòng)水平——哪些基因?qū)嶋H上正在被轉(zhuǎn)錄，在什么水平上，在什么時(shí)期的堆棧活動(dòng)。這有助于發(fā)現(xiàn)細(xì)胞是如何工作的，哪些蛋白質(zhì)在不同的階段和不同的目的變得活躍，以及伴隨或先于疾病條件的一些變化。有許多基于RNA序列排列的技術(shù)，包括轉(zhuǎn)錄譜、SNP鑒定、RNA編輯和遺傳表達(dá)的差異分析。

排列RNA序列比排列dna序列更能捕捉基因數(shù)據(jù)的真實(shí)表達(dá)方式。例如，它可以通過顯示一個(gè)未知的基因在哪些組織中是活躍的來幫助理解它的作用。它展示了一個(gè)基因如何通過替代修飾等機(jī)制導(dǎo)致兩個(gè)或兩個(gè)以上不同的RNA序列，這是一個(gè)不可能安排dna序列的發(fā)現(xiàn)。它還可以展示RNA是如何被加工成具有不同功能的分子的，比如添加聚腺苷鏈或5"緩沖液。

最初基于桑格排序，RNA排序緩慢、昂貴且不確定——盡管桑格的方法在當(dāng)時(shí)是一項(xiàng)不可思議的創(chuàng)新。只有隨著NGS等新技術(shù)的出現(xiàn)，RNA序列的排列才變得切實(shí)可行，而且非常有用。

NGS是多生產(chǎn)高產(chǎn)的保護(hù)傘術(shù)語，它排列序列技術(shù)可以很容易、準(zhǔn)確和廉價(jià)地排列dna和RNA序列。

這項(xiàng)研究是在韋恩州立大學(xué)醫(yī)學(xué)院、生育中心和馬薩諸塞大學(xué)阿姆赫斯特分校的合作下進(jìn)行的。

這項(xiàng)研究的目的是發(fā)現(xiàn)，將非目標(biāo)RNA序列排列成足夠敏感和特異性的序列，以檢測(cè)微生物的存在，而目前使用目標(biāo)培養(yǎng)的技術(shù)無法做到這一點(diǎn)。研究人員采集了85個(gè)精液樣本，并從精子中提取了RNA。這是按順序排列的，然后使用它的增強(qiáng)技術(shù)。不屬于人類基因組的RNA序列與微生物基因結(jié)合。這些讀數(shù)被用來創(chuàng)建在每個(gè)精液樣本中發(fā)現(xiàn)的微生物的圖像。

他們發(fā)現(xiàn)，所有的樣本都顯示出正常情況下在男性生殖范圍內(nèi)發(fā)現(xiàn)的細(xì)菌水平相似。這些來自11屬，4行。只有一個(gè)例外，它與所有剩余的微生物讀數(shù)有很大的不同。

具體地說，這個(gè)標(biāo)本中有大量的乳酸鏈球菌無乳桿菌和該物種的鏈球菌。S.無乳桿菌是一種細(xì)菌，與許多新生兒感染以及妊娠和分娩后發(fā)生的感染有關(guān)。它也是許多早產(chǎn)嬰兒死亡的原因。此外，它還會(huì)導(dǎo)致老年成人患者的嚴(yán)重感染。因此，精子中這種細(xì)菌的存在引起了相當(dāng)大的興趣。

目前，男性生殖器官中微生物的存在是通過培養(yǎng)技術(shù)來診斷的。然而，大多數(shù)通常被發(fā)現(xiàn)污染這一范圍的微生物在培養(yǎng)要求上都很挑剔，這意味著它們不能在通常的實(shí)驗(yàn)室條件下培養(yǎng)。

另一方面，安排RNA序列是一種更安全的技術(shù)，現(xiàn)在已經(jīng)得到了更廣泛的應(yīng)用，而且每天都在變得越來越普遍。這項(xiàng)技術(shù)的使用可能會(huì)更好地了解居住在人體中的細(xì)菌和其他微生物。研究人員說:“我們已經(jīng)證明，將人類精子RNA的非目標(biāo)序列排列起來，有可能提供微生物(細(xì)菌、病毒、古細(xì)菌)的特征。”這些信息通常是從側(cè)面成型的數(shù)據(jù)中恢復(fù)的，作為常規(guī)核酸排列順序的一部分。

臨床圖像顯示，S.無乳癥感染呈上升趨勢(shì)，比以往任何時(shí)候都更加嚴(yán)重。其他微生物也在新生兒和成人中引起更頻繁的感染。在這種情況下，研究人員斯蒂芬·克拉韋茨(Stephen Krawetz)說，“人類非目標(biāo)精子RNA排列數(shù)據(jù)序列，除了提供生育狀態(tài)外，還可以作為微生物狀態(tài)的診斷工具?！?/p>