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        研究人員開發(fā)了一個數(shù)據(jù)庫 以幫助鑒定細菌感染的關(guān)鍵基因
        
			
        
				2019-11-20 10:30:59
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        傳染病是由能夠進入，定植和在宿主生物體內(nèi)生長的病原微生物引起的，從而產(chǎn)生感染。近年來，細菌感染在全球范圍內(nèi)呈上升趨勢，但細菌致病機理的許多機制仍知之甚少?？紤]到以下事實，這是高度相關(guān)的，因為新的抗微生物療法的發(fā)展很大程度上是基于對這些感染背后機制的最新了解。由細菌基因編碼的蛋白質(zhì)負責(zé)成千上萬的生化過程，這些過程對于病原體的有效繁殖至關(guān)重要。但是，許多研究表明，為了鑒定這些基因，需要有關(guān)感染宿主真實病例中細菌發(fā)生情況的體內(nèi)信息。體外研究，即 在實驗室中用細胞和細菌培養(yǎng)物重建的那些，后來并不總是與體內(nèi)研究的數(shù)據(jù)相關(guān)。這是由于以下事實：產(chǎn)生感染所必需的病原細菌基因取決于所定植生物體的環(huán)境。
        

        研究人員開發(fā)了一個數(shù)據(jù)庫 以幫助鑒定細菌感染的關(guān)鍵基因
        

        巴塞羅那自治大學(xué)生物化學(xué)和分子生物學(xué)系以及基因組調(diào)控中心(CRG)的一組研究人員創(chuàng)建了BacFITBase數(shù)據(jù)庫。根據(jù)體內(nèi)實驗的結(jié)果，研究人員系統(tǒng)地表征了與宿主細胞入侵和感染有關(guān)的細菌基因。進行的所有實驗均基于一種名為轉(zhuǎn)座子誘變的技術(shù)，該技術(shù)將稱為轉(zhuǎn)座子的DNA片段轉(zhuǎn)移至生物體的致病基因，從而使其失活。這樣，就可以直接觀察到它們在感染中的作用，研究人員可以確定對于特定宿主生物感染哪些是必需的。因此，該數(shù)據(jù)庫將使鑒定目標(biāo)蛋白變得更加容易，這些目標(biāo)蛋白可幫助抵抗傳染病并加速新型抗菌劑的開發(fā)。
        

        該數(shù)據(jù)庫包含90,000多個條目，其中包含有關(guān)特定致病細菌基因及其在五個不同宿主物種中對體內(nèi)感染狀況的貢獻的信息。它包括有關(guān)總共15種細菌的信息(腸炎沙門氏菌，流感嗜血桿菌，化膿性鏈球菌，牙齦卟啉單胞菌的兩個變體，鳥分枝桿菌，大腸桿菌的三個變體，空腸霍亂弧菌，空腸彎曲桿菌，肺炎克雷伯氏菌，沙門氏菌和不動桿菌parahaemolyticus)和五個模型脊椎動物(牛，豬，母雞，小鼠和兔子)，并具有10種不同組織的信息。
        
			

			
          
        
			
        
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