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        研究人員組裝了歐亞鱸魚基因組
        
			
        
				2019-03-11 10:37:38
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        在最近發(fā)表在科學(xué)雜志G3：Genes，Genomes，Genetics上的一項研究中，愛沙尼亞生命科學(xué)大學(xué)的研究人員與圖爾庫大學(xué)的同事合作，組裝了歐亞鱸魚基因組。它比人類基因組小三倍，但含有約10億個核苷酸和超過23,000個基因。被調(diào)查的鱸魚起源于Rapla縣沼澤中部Loosalu湖的黑暗水域。研究結(jié)果使世界各地的科學(xué)家能夠更好地了解自然選擇的效果。
        

        研究人員組裝了歐亞鱸魚基因組
        

        歐亞鱸魚是一種很常見的魚類物種在愛沙尼亞和歐亞大陸。它的棲息地從不列顛群島到俄羅斯遠東地區(qū)。該物種可以在極端環(huán)境條件下生存并成功繁殖。因此，棲息地存在于貧營養(yǎng)的清水湖泊，波羅的海的咸淡水和酸性黑水沼澤湖泊中，其他魚類無法生存。然而，尚不知道什么遺傳機制有助于棲息地適應(yīng)這種不同的生活條件。
        

        鱸魚是水體食物鏈中的重要環(huán)節(jié)。此外，條紋魚對湖泊的甲烷循環(huán)產(chǎn)生巨大影響，通過改變食物鏈將湖泊的甲烷排放量減少近十倍。由于甲烷是比二氧化碳更有效的溫室氣體，因此鱸魚在減少全球變暖方面起著重要作用。“這就是為什么理解沼澤湖中鱸魚的適應(yīng)機制尤為重要的原因，那里的氧氣含量很低(富含腐殖質(zhì))，甲烷排放量最高，而鱸魚通常是唯一的魚類，”魚類學(xué)家說。 AntiVasemägi，瑞典農(nóng)業(yè)科學(xué)大學(xué)教授，愛沙尼亞生命科學(xué)大學(xué)高級研究員，領(lǐng)導(dǎo)該研究。
        

        根據(jù)Vasemägi的說法，組裝的基因組是一個重要的里程碑。“與先前研究的魚類相比，基因組具有很高的價值，因為我們使用了基于長DNA分子標(biāo)記的創(chuàng)新方法，并確定了短序列的序列，”Vasemägi說。
        

        該科學(xué)家說，應(yīng)用的方法允許快速，相對便宜和精確地對大型基因組進行測序，在此期間將基因組匹配的極其困難的任務(wù)分成數(shù)百萬個較小的謎題。因此，最終有可能進行涵蓋不同魚類全基因組的研究。Vasemägi補充說，掌握基因組大小的最簡單方法是將其測量結(jié)果轉(zhuǎn)化為人類。“如果你想象一個堿基對的長度是一毫米，那么鱸魚基因組可以從塔爾圖到達柏林，”他說，并補充說該研究小組的下一個任務(wù)是繪制基因組區(qū)域或路線上的公里帖子。塔爾圖到柏林，含有自然選擇的痕跡。
        

        更重要的是，棲息地是一種重要的商業(yè)開發(fā)魚類，也是休閑漁民中非常受歡迎的目標(biāo)。它在歐洲的許多地方廣泛種植。“對鱸魚基因組進行測序使科學(xué)家能夠繪制影響魚類生長速度，達到性成熟的時間，抗病能力和其他重要水產(chǎn)養(yǎng)殖特征的基因組區(qū)域，”水產(chǎn)養(yǎng)殖主席Riho Gross教授說。愛沙尼亞生命科學(xué)大學(xué)。“對鱸魚基因組進行測序?qū)⒑喕泵赖念愃蒲芯?，其中我們的棲息地的近親，黃鱸(拉丁名Perca flavescens)很普遍。棲息于溫帶歐亞大陸最成功和最普遍的魚類之一，“Vasemägi總結(jié)道。
        
			

			
          
        
			
        
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