科學(xué)家們找到了提高CRISPR效率的方法
科學(xué)家已經(jīng)開發(fā)出一種方法來提高Duchenne肌營(yíng)養(yǎng)不良癥(DMD)中CRISPR基因編輯的效率,這項(xiàng)研究可能對(duì)優(yōu)化其他疾病的基因療法產(chǎn)生影響。該發(fā)現(xiàn)源于UT西南大學(xué)的研究,其中在小鼠和人類細(xì)胞上使用單切基因編輯技術(shù)來糾正DMD的常見突變,DMD是肌營(yíng)養(yǎng)不良蛋白(一種對(duì)肌肉功能至關(guān)重要的蛋白質(zhì))喪失引起的致命疾病。
在測(cè)試該技術(shù)的同時(shí),科學(xué)家發(fā)現(xiàn)調(diào)整CRISPR基因編輯組分的劑量可以顯著改善編輯基因產(chǎn)生的肌營(yíng)養(yǎng)不良蛋白的數(shù)量。他們進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),組分的最佳比例根據(jù)編輯的DNA部分而變化。
“由于我們測(cè)試的抗肌萎縮蛋白基因的其他缺陷的部件CRISPR,這可能是重要的調(diào)整我們的公式以獲得最佳效果,”埃里克·奧爾森博士,誰領(lǐng)導(dǎo)發(fā)表的研究報(bào)告說科學(xué)進(jìn)展。“這種新的見解進(jìn)一步促進(jìn)了CRISPR作為Duchenne療法的應(yīng)用,也許還有許多其他疾病。”
意想不到的發(fā)現(xiàn)
研究人員使用的基因編輯技術(shù)需要兩種成分 - 一種稱為Cas9的酶,可切割DNA,一種指導(dǎo)RNA,其作用類似于分子GPS裝置,可將Cas9導(dǎo)入待編輯基因組中的特定DNA序列。
Olson博士的實(shí)驗(yàn)室開發(fā)了一種編輯肌營(yíng)養(yǎng)不良蛋白基因缺陷部分的方法,將Cas9加載到腺相關(guān)病毒(AAV)中,這是一種無害的病毒,用于將編輯成分傳遞到細(xì)胞中。還將指導(dǎo)RNA加載到AAV中以將Cas9引導(dǎo)至其突破DNA的突變。
編輯過程繞過突變并使肌纖維產(chǎn)生肌營(yíng)養(yǎng)不良蛋白,Olson博士在大型哺乳動(dòng)物,小鼠和人類細(xì)胞的先前研究中記錄了陽(yáng)性結(jié)果。
在這些研究中,研究小組使用標(biāo)準(zhǔn)的1比1的Cas9和指導(dǎo)RNA來幫助恢復(fù)肌肉中的肌營(yíng)養(yǎng)不良蛋白產(chǎn)生至正常值的90%以上。
在針對(duì)該基因不同部分的新研究中,他們發(fā)現(xiàn)1比1的比例不起作用:當(dāng)輸送到血流中時(shí),抗肌萎縮蛋白的產(chǎn)生僅恢復(fù)到正常值的5%。
通過反復(fù)試驗(yàn),科學(xué)家發(fā)現(xiàn)使用10比1的指導(dǎo)RNA與Cas9的比例可以對(duì)肌營(yíng)養(yǎng)不良蛋白基因的特定片段進(jìn)行最佳編輯。在CRISPR劑量的四周內(nèi),在具有共同DMD突變的小鼠中約90%的肌肉和心臟纖維中肌營(yíng)養(yǎng)不良蛋白的產(chǎn)生得以恢復(fù)。
“這很令人驚訝,”該研究的第一作者Yi-Li Min博士說。“我們總是使用等量的兩種病毒來提供指導(dǎo)RNA和Cas9,并沒有考慮改變比例。”
有缺陷的外顯子
DMD是男孩中最常見的致命遺傳疾病,導(dǎo)致肌肉和心臟衰竭,并在30年代早期導(dǎo)致過早死亡。隨著肌肉退化,患者被迫坐輪椅,最終因?yàn)殡跫p弱而進(jìn)入呼吸器。盡管科學(xué)家們已經(jīng)知道,構(gòu)成長(zhǎng)肌營(yíng)養(yǎng)不良蛋白基因的79個(gè)外顯子中的任何一個(gè)缺陷都會(huì)導(dǎo)致這種情況,但是沒有有效的治療方法存在。
Olson博士發(fā)表了多項(xiàng)研究,他的實(shí)驗(yàn)室在DNA的戰(zhàn)略要點(diǎn)進(jìn)行單一切割,以糾正突變。包括他最新研究的重點(diǎn)是刪除外顯子44,他的實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)創(chuàng)建了針對(duì)DMD患者中五種最常見缺陷的CRISPR技術(shù),占全球約一半的病例。外顯子44的臨床治療位于該基因最常見的突變熱點(diǎn)之一,可能使約12%的患者受益。
這些技術(shù)尚未被批準(zhǔn)用于臨床用途,但是Olson博士的團(tuán)隊(duì)在去年發(fā)表科學(xué)研究表明外顯子51上的CRISPR編輯阻止了狗的DMD進(jìn)展后,朝著這個(gè)目標(biāo)邁出了重要的一步。
在基因編輯的幾周內(nèi),缺失的蛋白質(zhì)在整個(gè)身體的肌肉組織中恢復(fù),包括92%的心臟矯正和58%的膈肌,即呼吸所需的主要肌肉??茖W(xué)家估計(jì)需要15%的閾值才能顯著幫助患者。
該實(shí)驗(yàn)室正在對(duì)狗進(jìn)行長(zhǎng)期研究,以測(cè)量肌營(yíng)養(yǎng)不良蛋白水平是否保持穩(wěn)定,并確?;蚓庉嫑]有不良副作用。
Olson博士希望下一步超越狗只是一項(xiàng)臨床試驗(yàn),這將是UT西南大學(xué)基因治療計(jì)劃旨在在未來幾年內(nèi)推出以應(yīng)對(duì)眾多致命的兒童疾病的幾項(xiàng)試驗(yàn)。
“我們?cè)谂R床上使用之前還有更多工作要做,”奧爾森博士說,“但看到我們走了多遠(yuǎn),我們感到非常興奮。”
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