研究人員使用蒼蠅對(duì)哺乳動(dòng)物DNA進(jìn)行取樣并開發(fā)出一種哺乳動(dòng)物監(jiān)測(cè)工具
已經(jīng)提出無脊椎動(dòng)物腸道中的哺乳動(dòng)物DNA檢測(cè)用于研究哺乳動(dòng)物多樣性，但仍然存在某些問題。通過顯示哺乳動(dòng)物DNA在喂食后1-4天持續(xù)存在于暴露的腸道中并開發(fā)與哺乳動(dòng)物DNA條形碼結(jié)合的引物來解決這些問題，所述引物可以區(qū)分相似的哺乳動(dòng)物物種，但不與流蠅DNA結(jié)合。
根據(jù)全球哺乳動(dòng)物評(píng)估，該計(jì)劃收集全世界哺乳動(dòng)物物種的狀況和威脅數(shù)據(jù)，大多數(shù)哺乳動(dòng)物熱帶地區(qū)的物種要么受到威脅，要么鮮為人知。對(duì)熱帶哺乳動(dòng)物缺乏了解可歸因于用于檢測(cè)和研究的低效和勞動(dòng)密集型工具。用于哺乳動(dòng)物檢測(cè)的傳統(tǒng)工具包括解密在森林中徒步旅行時(shí)遇到的足跡和糞便，以及使用金屬絲籠和網(wǎng)。從道德角度來看，后者正變得越來越不可接受。哺乳動(dòng)物監(jiān)測(cè)工具箱的最新成員是攝像機(jī)捕獲。但相機(jī)陷阱需要清晰的照片。與人類不同，其他一些動(dòng)物可以更容易地在森林中找到其他哺乳動(dòng)物，特別是當(dāng)這些哺乳動(dòng)物是它們的獵物時(shí)。隨著DNA測(cè)序技術(shù)的現(xiàn)代進(jìn)步，
蒼蠅 - 在餐桌上嗡嗡作響的肉類以及熱帶森林中野生動(dòng)物的糞便，傷口或尸體，可能比其他無脊椎動(dòng)物更好地采集哺乳動(dòng)物DNA，因?yàn)樗鼈冊(cè)谒蓄愋椭卸加蟹沁x擇性的攝食習(xí)慣棲息地 他們?cè)谖故硶r(shí)專注于糞便DNA的能力是另一個(gè)好處。大黃蜂(Chrysomya megacephala)是一種被稱為東方茅廁(如圖)的粉虱，是第一種也是最豐富的無脊椎動(dòng)物物種，它們來自馬來西亞半島熱帶森林中的哺乳動(dòng)物尸體。
在攝取過程中，通常將蠅蛆消耗的哺乳動(dòng)物的DNA片段化成小塊。這引起了關(guān)于粉虱衍生DNA作為哺乳動(dòng)物監(jiān)測(cè)工具的適用性的兩個(gè)主要問題。它們是：哺乳動(dòng)物DNA在粉虱的內(nèi)臟中持續(xù)多久?應(yīng)該針對(duì)哪個(gè)特定的哺乳動(dòng)物DNA片段進(jìn)行檢測(cè)，以最大限度地提高成功檢測(cè)的機(jī)會(huì)
為解決第一個(gè)問題，在馬來亞大學(xué)博物館動(dòng)物學(xué)實(shí)驗(yàn)室飼養(yǎng)了一群螢火蟲。在解剖腸道之前，將蒼蠅饑餓一段固定的時(shí)間。實(shí)驗(yàn)表明，母牛DNA在成蟲后的腸道中持續(xù)存在一至四天。這表明應(yīng)該在捕獲后一天內(nèi)提取DNA用于蠅蛆腸，以便檢測(cè)足夠數(shù)量和質(zhì)量的哺乳動(dòng)物DNA。
解決第二個(gè)問題 - 目標(biāo)哪個(gè)DNA片段?研究人員選擇設(shè)計(jì)針對(duì)線粒體DNA DNA條形碼片段的引物，這些片段可以區(qū)分相似的哺乳動(dòng)物物種。研究小組設(shè)計(jì)的引物(標(biāo)簽)與哺乳動(dòng)物DNA條形碼的短片段結(jié)合，但不與螢火蟲的DNA結(jié)合。這些引物允許復(fù)制DNA(在稱為PCR的過程中)，以構(gòu)建足夠數(shù)量的拷貝，可由DNA測(cè)序儀讀取。通過引物擴(kuò)增的DNA條形碼靶區(qū)域足夠短，以便在攝入的哺乳動(dòng)物DNA的片段中檢測(cè)并通過高通量DNA測(cè)序儀進(jìn)行測(cè)序。然而，它包含足夠的信息，以便能夠區(qū)分甚至那些相似的哺乳動(dòng)物物種。
目前，密歇根州博物館動(dòng)物學(xué)研究所的研究人員正在比較成功的哺乳動(dòng)物檢測(cè)，從森林中采集的蠅蛆與籠中陷阱，霧網(wǎng)，相機(jī)陷阱，毛發(fā)陷阱和糞便樣本中檢測(cè)到的哺乳動(dòng)物。
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