利用基因組學(xué)來拯救瀕危物種
目前,許多受威脅和瀕臨滅絕的物種都被囚禁。他們的管理主要集中在保持人口可行(人口統(tǒng)計學(xué)和遺傳學(xué))以及盡可能與野生祖先種群相似。為了實現(xiàn)這些目標,圈養(yǎng)種群通常在優(yōu)先級最高的育種計劃中進行管理。但是,育種計劃所依據(jù)的信息往往不完整或缺失。這導(dǎo)致育種計劃產(chǎn)生通常不正確的,潛在危險的假設(shè),即創(chuàng)始人不相關(guān),這可能導(dǎo)致無意的近親繁殖。
瀕臨滅絕的米沙鄢疣豬
基因組技術(shù)開辟了許多機會,這些技術(shù)在商業(yè)動物育種領(lǐng)域獲得的經(jīng)驗可以潛在地改善保護育種計劃。研究人員探討了極度瀕危的米沙鄢疣豬(Sus cebifrons)的基因組技術(shù)的機會。這個物種是菲律賓特有的,主要生活在內(nèi)格羅斯島和班乃島。在歐洲和美國的動物園中存在兩種這種物種的圈養(yǎng)種群。這些圈養(yǎng)人群的創(chuàng)始人分別來自內(nèi)格羅斯和班乃。目前這兩個種群是分開管理的,因為兩個島嶼種群之間的分裂程度存在不確定性。此外,由于缺乏關(guān)于創(chuàng)始人相關(guān)性的信息,目前在圈養(yǎng)種群中存在近親繁殖程度的不確定性。
在這項研究中,有7種全基因組可供選擇,2種來自Negros個體,5種來自Panay。在混合分析中,研究人員發(fā)現(xiàn)了兩個島嶼群體最近分裂的證據(jù)。然而,與其他豬種相比,他們還發(fā)現(xiàn)過去和近期近親繁殖水平較高,遺傳多樣性水平較低。對該物種歷史人口統(tǒng)計的分析表明,兩個嚴重的瓶頸可能導(dǎo)致歷史近親繁殖和低水平的遺傳多樣性。最近的近親繁殖很可能是由于每個圈養(yǎng)人群中創(chuàng)始人之間的某種程度的相關(guān)性造成的。
目前,極端低的遺傳多樣性和近期近親繁殖的跡象可能會威脅到圈養(yǎng)種群的生存能力?;趥€體的人口統(tǒng)計歷史的相似性,合并兩個育種計劃可能是謹慎的,以便增加總?cè)︷B(yǎng)人口的可行性和重新引入的可能性。
廣泛的應(yīng)用
這項研究的結(jié)果表明,基因組工具確實對保護管理非常有用。隨著目前的發(fā)展速度和相關(guān)的較低成本,預(yù)計基因組技術(shù)將在不久的將來變得可用于保護生物學(xué)的廣泛應(yīng)用。實施這些技術(shù)可以使瀕臨滅絕的物種如米沙鄢疣豬獲得更好的知識育種管理。
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