海水樣本中的eDNA可以揭示深水魚種群的狀況
根據(jù)2016年11月16日在哥本哈根大學丹麥自然歷史博物館地理遺傳學中心Philip Francis Thomsen 的開放獲取期刊PLOS ONE中發(fā)表的一項研究，海水樣本中的環(huán)境DNA可提供有關深水魚類種群的準確信息。 ，丹麥和他的同事。極端和深水偏遠地區(qū)的魚類受到氣候變化和捕撈努力量增加的威脅，因此監(jiān)測人口非常重要。然而，監(jiān)測在后勤上可能很困難，目前依賴于入侵技術，如底拖網(wǎng)捕撈和不可靠的捕撈報告。因此需要更少侵入性，更可靠的監(jiān)測技術。
為了滿足這一需求，Thomsen及其同事評估了一種替代監(jiān)測技術，該技術依賴于對海水樣品中的環(huán)境DNA(eDNA)進行測序。他們在西南格陵蘭島附近的地點采集海水樣本，深度在188到918米之間，對這些樣本中的DNA進行測序，以確定存在的魚類。他們比較了這些結果，以捕獲通過在每個站點同時拖網(wǎng)獲得的數(shù)據(jù)。
Thomsen及其同事發(fā)現(xiàn)魚類生物量和豐度的數(shù)據(jù)與eDNA序列豐度相關。通過拖網(wǎng)和環(huán)境DNA技術鑒定了26個魚類家族，包括射線和大比目魚，相比之下，只有兩個家庭只在拖網(wǎng)捕撈中發(fā)現(xiàn)，三個僅在eDNA中發(fā)現(xiàn)。環(huán)境DNA采樣也檢測到格陵蘭鯊魚的豐度高于拖網(wǎng)，這可能表明該技術可以有效地檢測到可能逃避拖網(wǎng)捕撈的大型魚類。
環(huán)境DNA采樣需要進行進一步測試，以確定其作為監(jiān)測技術的有效性。盡管如此，作者表示他們的研究表明eDNA如何用于非侵入性監(jiān)測，商業(yè)捕魚以及評估氣候變化對這些偏遠生態(tài)系統(tǒng)生物多樣性的影響。
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