組成腸道微生物組是一個(gè)由宿主驅(qū)動(dòng)的項(xiàng)目
烘烤酵母面包需要起始劑,哺乳動(dòng)物腸道也是如此,它們首先被母親的微生物群落定殖,然后隨著時(shí)間的推移獲得更多的微生物。這些腸道微生物群落對(duì)于保持健康和抗擊疾病非常重要,這就是為什么美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院于2008年發(fā)起的人類微生物群項(xiàng)目正在通過(guò)測(cè)序和組裝參考目錄來(lái)研究填充人體的微生物群落。這涉及美國(guó)能源部(DOE)聯(lián)合基因組研究所(JGI)的研究人員。
當(dāng)HMP開始實(shí)施時(shí),亞利桑那大學(xué)的DOE JGI合作者Howard Ochman專注于一個(gè)單獨(dú)但相關(guān)的問(wèn)題:確定腸道微生物組是否受宿主或飲食等環(huán)境因素的影響更大。在11月16日在線發(fā)表于PLoS Biology的研究中,Ochman及其同事,包括前DOE JGI科學(xué)家Phil Hugenholtz,現(xiàn)任澳大利亞昆士蘭大學(xué)澳大利亞生態(tài)基因組學(xué)中心主任,研究了幾種靈長(zhǎng)類動(dòng)物的腸道微生物群落并進(jìn)行了比較它們是兩個(gè)人的腸道微生物群。結(jié)果表明,宿主,而不是飲食或地理等環(huán)境因素,對(duì)這些微生物群落的構(gòu)成影響最大。
使用從非洲本土收集的糞便樣本,Ochman和他的同事對(duì)幾種靈長(zhǎng)類動(dòng)物 - 東部和西部低地大猩猩,倭黑猩猩和三種黑猩猩亞種 - 的腸道中的微生物群落進(jìn)行了測(cè)序,以確定它們的成分構(gòu)成,并將結(jié)果與來(lái)自人類采集的樣本。他們發(fā)現(xiàn)腸道微生物群落是物種特異性的,并且在進(jìn)化時(shí)間尺度上跟蹤它們的宿主。即使腸道社區(qū)受到諸如疾病等因素的干擾,這種進(jìn)化信號(hào)似乎也是可辨別的。
“宿主系統(tǒng)發(fā)育是決定巨猿腸道微生物群微生物組成的最重要因素,”Ochman和他的同事們?cè)谒麄兊难芯恐械贸鼋Y(jié)論,并補(bǔ)充說(shuō)這一發(fā)現(xiàn)與之前的觀點(diǎn)形成鮮明對(duì)比,即飲食是控制靈長(zhǎng)類動(dòng)物腸道微生物的最重要因素。 “。
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