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        基因組醫(yī)學(xué)和公共衛(wèi)生中的新生兒測序

        基因組測序技術(shù)的快速發(fā)展已經(jīng)降低了遺傳分析的成本,以至于基因組規(guī)模測序可能在兒科護理中具有廣泛的可用性似乎是合理的?;蚪M測序為表現(xiàn)出單基因疾病癥狀的患者提供了強大的診斷方式,并且有機會在發(fā)病前檢測健康狀況。然而,在將這種技術(shù)廣泛應(yīng)用于兒科實踐之前,應(yīng)解決許多技術(shù),臨床,倫理和社會挑戰(zhàn)。本文概述了基因組醫(yī)學(xué)和公共衛(wèi)生聯(lián)盟中的新生兒測序,該聯(lián)合會正在研究新生兒基因組規(guī)模測序在診斷和篩查中的應(yīng)用。

        基因組醫(yī)學(xué)和公共衛(wèi)生中的新生兒測序

        通用新生兒篩查(NBS)是一項非常成功的公共衛(wèi)生計劃,通過早期診斷和管理包括罕見的先天性新陳代謝錯誤在內(nèi)的疾病來預(yù)防發(fā)病率和死亡率。1苯丙酮尿癥等癥狀在出生時臨床上并不明顯,但如果不及時治療,會導(dǎo)致嚴(yán)重的不可逆轉(zhuǎn)的傷害或死亡。2國家統(tǒng)計局通過及時的治療干預(yù),挽救了無數(shù)人的生命并極大地改善了兒童的生活質(zhì)量,并且使用串聯(lián)質(zhì)譜(MS / MS)等技術(shù)進步在國家統(tǒng)計局的擴展中發(fā)揮了重要作用。3,4

        分析基因組中的許多或所有基因的能力同時為基因組醫(yī)學(xué)提供了新的機會。疾病基因發(fā)現(xiàn)的基因組規(guī)模測序的能力是有據(jù)可查的,5和它被越來越多地應(yīng)用為疑似單基因病的兒童的診斷測試。6,7的基因組測序的有形潛在更廣泛地在醫(yī)學(xué)中,作為“個性化”或“精確”醫(yī)學(xué)的一部分8 沃爾特·吉爾伯特(Walter Gilbert)在1990年預(yù)示了這一點,他從DNA測序的指數(shù)增長中推斷出所有新生兒的基因組將在2030年或2040年進行測序?;蚪M測序有朝一日成為新生兒標(biāo)準(zhǔn)治療的一部分的想法被延續(xù)到今天對話:

        隨著我們更多地了解遺傳風(fēng)險因素的有效干預(yù)措施,并認(rèn)識到生命早期的干預(yù)措施提供了顯著的優(yōu)勢,在出生時確定這些信息將變得越來越有吸引力。-FS柯林斯,生命的語言:DNA和個性化醫(yī)學(xué)的革命。紐約:Harper Perennial(2010)

        這些預(yù)測提出了一些重要問題:基因組測序是否可以成為每個州執(zhí)行的通用標(biāo)準(zhǔn)NBS的一部分,取代傳統(tǒng)的生物化學(xué)測試,還是可以作為可選的補充劑提供?如何支付排序,以及如何獲得父母的知情同意?新生兒基因組測序?qū)和】涤惺裁从绊?它對諸如保護自治者不知道的權(quán)利等問題有何影響?

        在診斷設(shè)置中,基因組規(guī)模測序的目標(biāo)是識別為患者癥狀提供分子病因的遺傳變異。所有其他變體被認(rèn)為是偶然發(fā)現(xiàn)(或通過故意分析發(fā)現(xiàn)的次要發(fā)現(xiàn))。9這些額外的發(fā)現(xiàn)在預(yù)測能力和臨床可行性方面差異很大。不足為奇的是,有多少基因組信息應(yīng)在兒科設(shè)置常規(guī)返回,分歧10 - 14,兒童和他們的父母可能表達獨特的偏好。15,16因此,臨床實施的核心挑戰(zhàn)圍繞著職業(yè)責(zé)任和個人或父母選擇的界限,知情同意的最佳實踐和確定父母偏好,關(guān)于應(yīng)報告的發(fā)現(xiàn)類型的標(biāo)準(zhǔn),基因組信息的長期存儲,以便它可以在適當(dāng)?shù)臅r間采取行動,以及是否以及如何重新分析和重新解釋基因組數(shù)據(jù)。

        基因組測序在無癥狀新生兒中的應(yīng)用加劇了許多這些挑戰(zhàn),并暴露了關(guān)于非傷害性,善行性,自主性和保護每個孩子開放未來的深層社會問題。17 - 19此外,在實施人口層面之前,必須考慮這種篩查的經(jīng)濟學(xué)。盡管快速基因組測序所需的技術(shù)特征似乎是可行的,但在可預(yù)見的未來,對每個無癥狀人的變異譜的解釋仍將是勞動密集型的,并且對未來疾病的臨床有用預(yù)測可能難以實現(xiàn)。認(rèn)識到這些趨勢,Eunice Kennedy Shriver國家兒童健康與人類發(fā)展研究所(NICHD),國家人類基因組研究所和罕見疾病研究辦公室于2010年12月舉辦了一次研討會,以確定跨國立衛(wèi)生研究院研究議程的要素,以便為可能的應(yīng)用提供信息。新的基因組技術(shù)對國家統(tǒng)計局和兒童健康的影響(https://www.nichd.nih.gov/about/meetings/2010-retired/ Documents / Newborn_Research_Agenda.pdf)。一致的發(fā)現(xiàn)是需要一致地檢查與新生兒期測序相關(guān)的技術(shù),臨床,社會和倫理問題。隨后,NICHD和國家人類基因組研究所發(fā)布了一個籌資機會,以建立一個聯(lián)合體,以有限但有意識的方式探索利用基因組信息擴大我們對新生兒期間發(fā)現(xiàn)的疾病的認(rèn)識的機會。公共衛(wèi)生NBS或新生兒的臨床測序。該聯(lián)盟稱為基因組醫(yī)學(xué)和公共衛(wèi)生新生兒測序(NSIGHT),正在解決三個關(guān)鍵的研究問題:

        對于目前在新生兒中篩查的疾病,基因組測序如何復(fù)制或增加已知的NBS結(jié)果?測序可以取代目前的篩選方式嗎?

        基因組測序可以提供哪些關(guān)于新生兒目前未篩查的病癥的知識?

        從與新生兒臨床護理相關(guān)的基因組測序中可以學(xué)到哪些額外的臨床信息?

        2014年,通過使用獨特的研究設(shè)計(表1和圖1),資助了4組在不同臨床環(huán)境中探索新生兒測序。每項研究還包括審查道德,法律和社會因素的目標(biāo)。本文探討了3種不同臨床環(huán)境中新生兒測序的一些挑戰(zhàn),描述了這4個項目,并將這項研究納入NBS當(dāng)前和未來戰(zhàn)略以及臨床護理環(huán)境中新生兒測序的背景下。

        新生兒測序研究的臨床設(shè)置:診斷,預(yù)防和預(yù)測

        進行基因組測序的環(huán)境會影響其技術(shù)性能,產(chǎn)量和潛在的益處和危害。在診斷背景下,新生兒測序與任何其他基因診斷模式非常相似,并且提供分子診斷的能力取決于許多因素,包括遺傳結(jié)構(gòu),表型表達性,基因座異質(zhì)性和已知病癥所占的病例比例,突變譜,可通過測序檢測的變體類型,以及在患者中進行的測定的質(zhì)量。相反,基因組測序在無癥狀新生兒中的應(yīng)用基本上取決于基因型的能力以預(yù)測當(dāng)前或未來的疾病狀態(tài)。從而,

        NICU嬰兒患者群體中的測序?qū)?dāng)前的分子診斷策略擴展到基因組規(guī)模,而健康嬰兒的測序則針對預(yù)防未來疾病,更類似于在公共衛(wèi)生環(huán)境中進行的當(dāng)前NBS。通過預(yù)測疾病和指導(dǎo)出現(xiàn)的臨床情景的管理策略,混合基因組信息的預(yù)測,生殖,診斷,治療和預(yù)后價值,序列信息還可用于指導(dǎo)患者終生的護理。NSIGHT項目在研究使用基因組規(guī)模測序的臨床方案中有所不同,跨越下述區(qū)域。

        NICU中的診斷測序

        III級和IV級NICU治療許多遺傳性疾病的新生兒,包括代謝紊亂20和先天性畸形。21,22確實,遺傳性疾病和先天性異常是死亡的新生兒重癥監(jiān)護病房的主要原因。23目前用于診斷NICU患者中可疑遺傳疾病的方法包括核型分析,染色體微陣列,單基因測試和基因組。在許多情況下,盡管進行了幾輪基因檢測,但病因診斷仍然難以捉摸,臨床基因組規(guī)模測序僅用于一小部分病例。如果在診斷過程的早期使用基因組測序,它可以提供更及時的確定性診斷,從而提高治療的精確度,無論是治療還是姑息治療,并提供關(guān)于預(yù)后和家庭復(fù)發(fā)風(fēng)險的答案。此外,序列數(shù)據(jù)可以幫助解釋早產(chǎn)兒常見的假陽性NBS結(jié)果,因為它們的器官系統(tǒng)不成熟,肝臟酶活性,長期腸外營養(yǎng)需求,24

        初步研究表明,遺傳性疾病新生兒的基因組測序可能會降低成本。7,25,26然而,吸收已經(jīng)通過關(guān)于模糊的結(jié)果,次級結(jié)果和潛在父母焦慮臨床解釋顧慮阻礙,經(jīng)濟因素,包括對第三方付款人的在不存在臨床效用和成本確定的數(shù)據(jù)的所述部分的電阻 - 由于高成本的機構(gòu)擔(dān)憂,有效性和訂購測試的困難。由于需要詳細(xì)的表型信息以便診斷實驗室進行最佳分析,因此該過程也變得復(fù)雜。遺傳性疾病的臨時基因組診斷在技術(shù)上可行,僅需26小時。27,28然而,成本與周轉(zhuǎn)時間成反比,成本與臨床效用的最佳平衡尚不清楚。雖然通過技術(shù)可以改善快速周轉(zhuǎn)時間的某些方面,但變體審查和臨床解釋標(biāo)準(zhǔn)所施加的限制將保持不變,包括臨床團隊與實驗室之間進行臨床基因組評估的溝通需求。鑒于未來對可保性和隱私的影響不明確,家長對測試的接受程度尚不清楚。最后,新生兒科醫(yī)生和家長對基因組信息的反應(yīng)需要進行更多的研究,并且仍然需要制定嚴(yán)格的框架,將這些信息轉(zhuǎn)化為新生兒重癥監(jiān)護病房的精準(zhǔn)護理計劃。

        公共衛(wèi)生環(huán)境中的預(yù)防性排序

        目前的NBS產(chǎn)生的假陰性結(jié)果很少,但確實會產(chǎn)生大量的誤報,伴隨著情感和經(jīng)濟成本。29例如,在通過MS / MS篩選的176 186個標(biāo)本的研究中,有51個真陽性,2個假陰性和454個假陽性,在轉(zhuǎn)診到代謝中心后最終被解決為非疾病。30基因組測序可作為多重二級篩選,通過區(qū)分假陽性結(jié)果與真實疾病并幫助非特異性生化譜的鑒別診斷,提高當(dāng)前MS / MS篩查試驗的特異性。測序也可以確認(rèn)識別條件通過其他篩選方法,31 - 33有助于提供預(yù)后和適當(dāng)?shù)闹委煟?4 - 37確定通過床邊血糖檢測,識別條件的病因38并提供與關(guān)于致病的變體可用于家庭測試信息的家庭。此類分析還可以增加對基因型和表型之間相關(guān)性的了解,并且可能揭示對假陽性的可能遺傳貢獻,例如由于攜帶者狀態(tài)或亞型變異導(dǎo)致的異常MS / MS篩選數(shù)據(jù)。這些目標(biāo)需要縱向隨訪以獲得臨床數(shù)據(jù)并檢查基因型 - 表型相關(guān)性,以最終確定遺傳變異的預(yù)測能力和臨床影響。

        基因組測序也可以作為第一層篩選,特別是對于目前缺乏常規(guī)生化NBS方法的罕見疾病。在公共衛(wèi)生環(huán)境中,準(zhǔn)確選擇要篩選的疾病需要仔細(xì)考慮諸如發(fā)病年齡,嚴(yán)重程度,外顯率,可治療性,確認(rèn)性檢測和監(jiān)測機會等因素。有些遺傳病會履行當(dāng)初威爾遜和瓊格爾標(biāo)準(zhǔn)篩選,39 - 41但很多人不會。因此,需要可擴展的方法來確定哪些條件適合包含在公共健康檢查設(shè)置中。此外,鑒于幾乎每個人都可能成為少數(shù)罕見隱性疾病的載體,目前返回與載體狀態(tài)一致的結(jié)果的做法可能是不可持續(xù)的。

        使用NBS測序的一個重大挑戰(zhàn)是缺乏關(guān)于測序的分析和臨床性能作為預(yù)測性測試的數(shù)據(jù)。關(guān)于無癥狀人群的基因組測序的陽性或陰性預(yù)測價值知之甚少,這些人的疾病概率非常小。雖然從遺傳序列中最好地確定孟德爾疾病似乎是不言而喻的,但這種假設(shè)仍有待證明,可能并非如此。單基因疾病通常受到額外的和尚未鑒定的遺傳或環(huán)境因素的影響,而MS / MS測量通常更接近相關(guān)表型的分析物。即使對于研究最好的疾病,在解釋罕見變異方面也存在重大挑戰(zhàn)。最大化靈敏度的變體選擇算法必然犧牲特異性,導(dǎo)致由于不必要的醫(yī)學(xué)干預(yù)而導(dǎo)致的假陽性結(jié)果增加和潛在的下游危害。從基因組篩選結(jié)果中排除“具有不確定意義的變體”(根據(jù)定義具有較差的預(yù)測價值)的策略可能是必要的。從歷史上看,NBS對可預(yù)防疾病的關(guān)注導(dǎo)致對假陰性篩查結(jié)果的耐受性低。通過基因組測序,可能有必要將篩選范例從發(fā)現(xiàn)所有受影響的個體轉(zhuǎn)移到為大量潛在可治療的病癥找到最佳病例比例。從基因組篩選結(jié)果中排除“具有不確定意義的變體”(根據(jù)定義具有較差的預(yù)測價值)的策略可能是必要的。從歷史上看,NBS對可預(yù)防疾病的關(guān)注導(dǎo)致對假陰性篩查結(jié)果的耐受性低。通過基因組測序,可能有必要將篩選范例從發(fā)現(xiàn)所有受影響的個體轉(zhuǎn)移到為大量潛在可治療的病癥找到最佳病例比例。從基因組篩選結(jié)果中排除“具有不確定意義的變體”(根據(jù)定義具有較差的預(yù)測價值)的策略可能是必要的。從歷史上看,NBS對可預(yù)防疾病的關(guān)注導(dǎo)致對假陰性篩查結(jié)果的耐受性低。通過基因組測序,可能有必要將篩選范例從發(fā)現(xiàn)所有受影響的個體轉(zhuǎn)移到為大量潛在可治療的病癥找到最佳病例比例。

        基因組醫(yī)學(xué)中新生兒的預(yù)測性測序

        基因組醫(yī)學(xué)最廣泛的愿景,也可能是社會和實際原因中最具挑戰(zhàn)性的,涉及使用序列數(shù)據(jù)來指導(dǎo)患者終生的護理。基因組測序揭示了遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出傳統(tǒng)NBS范圍的信息。其中一些信息可能會導(dǎo)致醫(yī)療行動,但大多數(shù)信息不會產(chǎn)生問題,這些問題確實應(yīng)該報告哪些信息以及何時報告。42,43在患者出現(xiàn)遺傳病癥狀的情況下,可以設(shè)想變體數(shù)據(jù)用于將來的診斷分析。目前,我們解釋遺傳變異的能力主要局限于簡單的單基因和低聚條件。當(dāng)我們學(xué)習(xí)以臨床有用的方式使用多因素模型進行風(fēng)險分層或管理時,將會越來越多地獲得其他信息。在這一范圍內(nèi),基因組信息有可能提醒臨床醫(yī)生重新考慮家族病史或以新的方式解釋體檢結(jié)果,并有可能在其他家庭成員患病之前使其受益。藥物基因組學(xué)變體可以指導(dǎo)藥物的實時選擇和劑量,產(chǎn)生更安全和更有效的治療方法。在新生兒中檢測到的隱性攜帶者特征可以提醒父母注意遺傳風(fēng)險,這些風(fēng)險提供了對生殖計劃有價值的信息。復(fù)雜情況的常見變化可能會促使家庭對飲食和其他生活方式選擇更加警惕。最后,有可能自愿個人探索自己的基因組數(shù)據(jù)。

        如果有基因組序列數(shù)據(jù),家長將需要決定是否了解其他類別的信息,這些信息可能預(yù)測未來有關(guān)其孩子的事件,具有不同的確定性和干預(yù)能力,包括可能沒有的兒童期發(fā)病情況。直接干預(yù)或預(yù)防措施,成人發(fā)病的醫(yī)學(xué)上可行的條件,或隱性疾病的攜帶者狀態(tài)。研究表明,父母對他們孩子的遺傳變異感興趣,即使這些信息沒有明確的臨床效用[ 44],盡管這些偏好在很大程度上是在假設(shè)情景中引出的,可能并不反映現(xiàn)實生活中的選擇。

        基因組信息可以使家庭意識到其他未預(yù)料到的家族性風(fēng)險,包括父母在不知情的情況下攜帶的嬰兒中潛在可行的成人發(fā)病條件。然而,一些研究結(jié)果可能與專業(yè)指導(dǎo)不一致,即無癥狀未成年人的基因檢測通常只有在需要在成年之前進行鑒定以防止傷害并直接使兒童受益時才能進行。11,13,17在兒童中查詢二次發(fā)現(xiàn)的基因組規(guī)模數(shù)據(jù)的可能性引發(fā)了對結(jié)果返回的倫理界限的激烈爭論。已經(jīng)提出這樣的論點:對于家庭(例如,在不知不覺中處于危險中的父母)的益處,可能是關(guān)于兒童可行的成人發(fā)病條件的結(jié)果返回的決定中的有效考慮因素。45,46基因組規(guī)模測序和分析在新生兒可能會需要的電流的知情同意程序修改41,47與針對有限數(shù)量的條件的目標(biāo)屏幕進行比較。如果在整個人群中實施,基因組測序?qū)母旧细淖儺?dāng)代公共衛(wèi)生NBS程序,需要創(chuàng)新方法來促進父母的決策?;蛘?,這種測試可以通過自愿的自掏腰包測試來實現(xiàn)。

        擴大新生兒的基因組測序以包括廣泛的條件需要臨床提供者和父母之間的密切合作,類似于共享決策正在成為常態(tài)的其他醫(yī)學(xué)領(lǐng)域。48,49對信息披露標(biāo)準(zhǔn)的確定將成為臨床醫(yī)生和決策者的挑戰(zhàn),需要決策支持的發(fā)展,幫助家長確定他們想了解的信息。50支持父母決策所需的臨床互動將使這項活動超出當(dāng)前公共衛(wèi)生服務(wù)提供的范圍并進入臨床領(lǐng)域。如果要在公共衛(wèi)生環(huán)境中廣泛使用基因組規(guī)模測序,勞動力短缺可能會成為重大障礙,51這表明需要開發(fā)新的,更具可擴展性的材料和程序來傳達學(xué)習(xí)此類信息的潛在利益和風(fēng)險,并進行驗證,并部署??赡苄枰⑾到y(tǒng),使父母能夠隨著時間的推移從他們的孩子的基因組信息中請求某些結(jié)果,允許他們反復(fù)決定他們的價值觀和風(fēng)險觀念的變化,或者他們的孩子達到同意或同意的年齡。

        基因組結(jié)果解釋的復(fù)雜性目前要求訓(xùn)練有素的遺傳學(xué)家和遺傳咨詢師提供指導(dǎo)和后續(xù)管理。隨著基因組醫(yī)學(xué)成為醫(yī)療保健領(lǐng)域的主流,更廣泛的醫(yī)療保健提供者將需要與遺傳信息相互作用,這可能越來越多地被視為影響未來狀況的眾多風(fēng)險因素之一; 報告必須清晰地構(gòu)建,使其對兒科醫(yī)生和初級保健提供者有用。隨著時間的推移,這種基因組信息的潛在使用將需要開發(fā)新的基礎(chǔ)設(shè)施來管理報告,再分析,存儲以及與電子健康記錄的集成。此類數(shù)據(jù)可用于個體的迭代表型分析以定義遺傳變體的臨床相關(guān)性。然而,52個檢測真陽性的益處,因此必須針對危害的大小相平衡。

        NSIGHT研究組,研究設(shè)計和關(guān)鍵問題得到解決

        NSIGHT聯(lián)盟的4名成員中的每一名都獨立設(shè)計和實施了研究設(shè)計,側(cè)重于不同的人群和研究問題(圖1和表1)。

        由布里格姆婦女醫(yī)院(BWH)和波士頓兒童醫(yī)院(BCH)在哈佛醫(yī)學(xué)院和貝勒醫(yī)學(xué)院領(lǐng)導(dǎo)的基于兒童期風(fēng)險和新生兒疾病項目的基因組序列篩查(圖1A)是一項隨機對照試驗評估為新生兒的父母和醫(yī)生提供基因組測序信息的影響(clinicaltrials.gov標(biāo)識符NCT02422511))。該研究正在招募一組健康新生兒,這些新生兒在產(chǎn)后期接近BWH Well Baby Nursery和BWH NICU的一群患病新生兒以及BCH的ICU。在每個隊列中,新生兒被隨機分配到對照組(常規(guī)NBS結(jié)果和詳細(xì)的家族史)或?qū)嶒灲M(除常規(guī)NBS之外的基因組測序和詳細(xì)的家族史)。對家長和醫(yī)生進行調(diào)查,以評估基因組信息對幾個關(guān)鍵領(lǐng)域的影響,包括態(tài)度和偏好,醫(yī)療保健利用,健康行為和意圖,決策滿意度以及對家庭的心理社會影響。53

        由Rady兒童基因組醫(yī)學(xué)研究所和兒童慈善醫(yī)院領(lǐng)導(dǎo)的急性III新生兒項目的2天基因組結(jié)果的臨床和社會影響,研究在2個大型IV-NICU上使用快速全基因組測序(WGS)(?兒童醫(yī)院每年入院1000人(圖1B)。WGS適用于新生兒重癥監(jiān)護病房的罕見遺傳性疾病的診斷,包括將臨時診斷的最短時間縮短至26小時,將變異檢測的分析靈敏度和特異性提高至> 99.5%,并獲得美國食品和藥物管理局批準(zhǔn)報告臨時如果死亡迫在眉睫,那么對于新生兒科醫(yī)生進行口頭診斷,診斷將為實施可能改變結(jié)果的治療提供信息。27,28目前的研究是一項前瞻性,隨機化的診斷工具的對照試驗中,成本效益,并且在2個新生兒重癥監(jiān)護室(clinicaltrials.gov標(biāo)識符快速WGS的心理影響 NCT02225522)。作為本研究的一部分,醫(yī)生和家長接受調(diào)查,了解他們對快速獲得WGS結(jié)果的風(fēng)險和益處的看法。

        由加州大學(xué)舊金山分校(UCSF)和合作機構(gòu)領(lǐng)導(dǎo)的新生兒血斑DNA測序改進和擴大新生兒篩查(NBSeq)項目的目標(biāo)是評估外顯子組測序在公共衛(wèi)生NBS中的潛在應(yīng)用通過使用干血斑(DBS)(圖1C)。該項目探討了外顯子組測序在國家統(tǒng)計局中增強或取代現(xiàn)有MS / MS技術(shù)的可行性。外顯子組測序在加州大學(xué)舊金山分校對來自所有在過去十年中發(fā)現(xiàn)患有代謝紊亂的加利福尼亞新生兒的死亡鑒定檔案DBS以及MS / MS篩查中的假陽性樣本進行。來自新生兒DBS的序列數(shù)據(jù)54在臨床診斷為免疫缺陷病的50名患者的隊列中也被詢問,以確定作為NBS的一部分的DBS測序是否可以促進非嚴(yán)重聯(lián)合免疫缺陷免疫缺陷的早期診斷和最佳管理。關(guān)注國家統(tǒng)計局潛在擴張的利益相關(guān)者觀點,觀點和價值偏好正在通過焦點小組進行評估。55此外,正在研究圍繞在國家統(tǒng)計局中潛在使用基因組規(guī)模分析的法律和憲法問題。56

        北卡羅來納大學(xué)教堂山分校的北卡羅來納州新生兒外顯子組測序用于通用篩選研究評估了兩組唾液樣本的外顯子組測序:兒童和嬰兒患有通過標(biāo)準(zhǔn)NBS確定的病癥和一群健康的新生兒,他們的父母接近產(chǎn)前參與(圖1D)。家長將使用電子決策輔助來協(xié)助做出有關(guān)外顯子組測序的決定。57在親自考察訪問提供了知情同意書后,那些誰接受測序?qū)⒔邮諄碜?ldquo;下一代測序新生兒篩查(NGS-NBS)”,在兒童期發(fā)病醫(yī)學(xué)可操作的條件有關(guān)的基因的面板效果。58家長還將參加一項關(guān)于是否通過使用電子決策輔助(clinicaltrials.gov標(biāo)識符NCT02826694)了解其子女中3種類型的其他基因組發(fā)現(xiàn)的決策的隨機試驗。該研究旨在了解父母如何思考和考慮不同類別的信息,59并結(jié)合縱向定量調(diào)查,該研究將揭示父母決定學(xué)習(xí)的結(jié)果范圍,回歸這些結(jié)果的問題以及決策的后果和結(jié)果披露。

        跨領(lǐng)域聯(lián)盟活動

        雖然研究項目涉及不同的研究問題并且具有獨特的研究設(shè)計,但是4個NSIGHT小組參與了聯(lián)盟活動,這些活動建立在每個站點的優(yōu)勢基礎(chǔ)上,并協(xié)調(diào)數(shù)據(jù)收集以改進交叉分析(表2)。道德,法律和社會影響工作組匯集了每個項目關(guān)于臨床醫(yī)生,家庭,付款人和其他利益相關(guān)者的反應(yīng)的觀點; 父母知情同意和決策; 和對公共衛(wèi)生的影響NBS計劃。19,60通用數(shù)據(jù)元素工作組負(fù)責(zé)創(chuàng)建在4個研究組中收集的一組通用數(shù)據(jù)元素,以實現(xiàn)數(shù)據(jù)共享和組合數(shù)據(jù)分析。“成果和措施”工作組審查了每個小組使用的標(biāo)準(zhǔn)化工具,以評估利益相關(guān)者對新生兒測序的反應(yīng),以促進跨聯(lián)合體分析。NSIGHT聯(lián)盟正與新生兒篩查轉(zhuǎn)化研究網(wǎng)絡(luò)(NBSTRN)協(xié)調(diào)中心密切合作,該中心位于美國醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)和基因組學(xué)學(xué)院。NBSTRN是NICHD的Hunter Kelly新生兒篩查研究計劃的一部分,旨在建立一個共享的研究基礎(chǔ)設(shè)施,以支持NBS的研究人員,提供了一種機制,以增加對目前作為常規(guī)NBS的一部分的條件的理解,或者可能是未來的篩選候選者。NBSTRN資源,工具和專家網(wǎng)絡(luò)用于基于人群的新篩選技術(shù)試驗和篩選條件的自然歷史研究。NSIGHT Consortium調(diào)查員還與其他國立衛(wèi)生研究院資助的聯(lián)盟保持密切聯(lián)系,包括臨床測序探索研究聯(lián)盟61和臨床基因組資源聯(lián)盟。62

        鄭重聲明:本文版權(quán)歸原作者所有,轉(zhuǎn)載文章僅為傳播更多信息之目的,如有侵權(quán)行為,請第一時間聯(lián)系我們修改或刪除,多謝。

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