設(shè)計師生物傳感器可以檢測微生物的抗生素產(chǎn)生
北卡羅來納州立大學(xué)的研究人員設(shè)計了設(shè)計師生物傳感器,可以檢測出感興趣的抗生素分子。生物傳感器是在大腸桿菌等微生物中產(chǎn)生抗生素的“工廠”的第一步。
大環(huán)內(nèi)酯類是一組天然存在的小分子,可具有抗生素,抗真菌或抗癌作用。的抗生素紅霉素是一個例子-它是由土棲細(xì)菌產(chǎn)生大環(huán)內(nèi)酯。研究人員有興趣使用這些天然抗生素和生產(chǎn)它們的微生物來開發(fā)新的抗生素;然而,產(chǎn)生抗生素大環(huán)內(nèi)酯類的微生物只產(chǎn)生少量有限的抗生素。
“我們的最終目標(biāo)是設(shè)計微生物來制造這些抗生素的新版本供我們使用,這將大大減少新藥測試和開發(fā)所需的時間和金錢,”生物有機(jī)化學(xué)副教授Gavin Williams說。北卡羅來納州和描述該研究的論文的相應(yīng)作者。“為了做到這一點,我們首先需要能夠檢測微生物產(chǎn)生的目標(biāo)抗生素分子。”
威廉姆斯和他的團(tuán)隊使用了一種天然存在的分子開關(guān) - 一種叫做MphR的蛋白質(zhì) - 作為它們的生物傳感器。在大腸桿菌中,MphR可以檢測正在攻擊大腸桿菌的微生物分泌的大環(huán)內(nèi)酯類抗生素的存在。當(dāng)MphR感知抗生素時,它會啟動抗性機(jī)制來抵消抗生素的作用。
研究人員創(chuàng)建了一個龐大的MphR蛋白變體庫,篩選出它們在存在所需大環(huán)內(nèi)酯時能夠開啟熒光綠色蛋白生成的能力。他們測試了MphR已經(jīng)識別的針對紅霉素的變體,并發(fā)現(xiàn)一些MphR變體將其檢測能力提高了十倍。他們還成功地測試了針對與紅霉素不密切相關(guān)的大環(huán)內(nèi)酯類的變體,例如泰樂菌素。
“基本上我們已經(jīng)選擇并改進(jìn)了MphR傳感器系統(tǒng),增加了識別我們感興趣的分子的靈敏度,”威廉姆斯說。“我們知道我們可以定制這種生物傳感器,它會檢測出我們感興趣的分子,這將使我們能夠快速篩選出數(shù)百萬種不同的菌株。這是我們創(chuàng)造抗生素高通量工程的第一步。大量的遺傳修飾菌株和微生物變體庫,以便找到產(chǎn)生所需產(chǎn)量所需分子的少數(shù)菌株和變體。“
該研究發(fā)表在ACS合成生物學(xué),由美國國立衛(wèi)生研究院(GM104258)和北卡羅來納州立大學(xué)創(chuàng)新基金資助。研究生Yiwei Li,前研究生Christian Kasey,前本科生Mounir Zerrad和弗吉尼亞聯(lián)邦大學(xué)化學(xué)教授T. Ashton Cropp為這項工作做出了貢獻(xiàn)。
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