海水的DNA分析僅在一天內(nèi)檢測到百分之80的魚類
日本的一個研究小組利用一種新技術(shù),通過分析海水中的DNA樣本來識別居住在當(dāng)?shù)氐亩喾N魚類,并證明這種方法比目測觀察更準(zhǔn)確,更有效。該研究由日本科學(xué)技術(shù)戰(zhàn)略基礎(chǔ)研究項目的一部分進(jìn)行,包括學(xué)術(shù)研究員山本智(神戶大學(xué)人類發(fā)展與環(huán)境研究生院),MASUDA Reiji副教授(京都大學(xué)),ARAKI Hitoshi教授(北海道大學(xué)),KONDOH Michio教授(龍谷大學(xué)),項目助理教授MINAMOTO Toshifumi(神戶大學(xué)人類發(fā)展與環(huán)境研究生院)和兼職副教授MIYA Masaki(自然歷史博物館和研究所生態(tài)與環(huán)境科學(xué)系主任) ,千葉)。
直到最近,對魚類的海洋調(diào)查依賴于潛水或捕獲根據(jù)外觀對魚類進(jìn)行分類的方法。除了需要大量人力之外,這些方法還依賴于魚類分類的專業(yè)知識。新的解決方案,以調(diào)查問題最近引起關(guān)注:環(huán)境DNA metabarcoding,一個方法可同時檢測多個品種。該方法通過收集和分析海水中魚類釋放的DNA(環(huán)境DNA或eDNA)來識別魚類。到目前為止,研究人員只能對這種方法的有效性進(jìn)行有限的確認(rèn),因為它只在區(qū)域得到證實數(shù)量有限的魚類。在諸如日本海岸等許多不同魚類棲息地的地方,使用傳統(tǒng)方法收集的數(shù)據(jù)有限。由于結(jié)果無法與以前的數(shù)據(jù)進(jìn)行比較,因此eDNA元編碼的有效性仍未得到證實。
該研究小組在京都府的Maizuru灣使用了eDNA元編碼。在應(yīng)用這種方法進(jìn)行一天的實地調(diào)查后,他們能夠從海水樣本中檢測到128種魚類。在140個視覺調(diào)查中觀察到的超過60%的物種跨越14年,包括在這128個品種中。不包括僅在某些年份遷移到舞鶴灣的魚類品種,這一比例上升至近80%。他們還檢測到無法通過肉眼觀察確認(rèn)的魚類。研究人員認(rèn)為,這種方法是他們第一次能夠通過肉眼觀察發(fā)現(xiàn)某些難以識別的魚類幼蟲。
這些研究結(jié)果表明,即使在具有許多不同魚類的區(qū)域,eDNA metabarcoding也使研究人員能夠在短時間內(nèi)對多個地區(qū)的魚進(jìn)行調(diào)查。這種方法可用于監(jiān)測大面積外來物種的入侵,擴大魚類分布的調(diào)查,以及用于難以進(jìn)入的區(qū)域,如深海,地下湖泊,危險污染水域以及禁止采集標(biāo)本的保護(hù)區(qū)。
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