研究人員發(fā)現(xiàn)了一些乳腺癌的新基因特征和預后價值
研究人員發(fā)現(xiàn)了一種具有某些乳腺癌預后價值的基因特征。這一發(fā)現(xiàn)還有助于更好地理解病理血管生成、癌癥和其他疾病期間血管異常增殖的分子機制。
這項發(fā)表在《公共科學圖書館》(PLOS)上的研究,結合了對視網(wǎng)膜病變相關基因的研究,將其作為血管生成模型,并分析了公共乳腺癌數(shù)據(jù)庫中該基因的轉錄表達譜。
這項研究由圣保羅化學研究所(IQ-USP)大學的研究人員與加拿大多倫多安大略省癌癥研究所(OICR)合作進行,由圣保羅研究基金會(FAPESP)支持。
確定我們有一套乳腺癌基因的表現(xiàn)在品牌與腫瘤病理d’angiogenèse程度,使她成為更健壯且預后基因簽名的血管生成是先前確定的簽名,看到通常發(fā)現(xiàn)血管生成和腫瘤之間的相關性。?
里卡多·佐丹諾,IQ-USP教授,血管生物學實驗室主任,該研究的合著者
在這項研究中,巴西研究人員在健康和患病的視網(wǎng)膜中發(fā)現(xiàn)了153個基因。從這個列表中,他們列出了149個等效的人類基因。這一結果是與加拿大研究小組合作進行的一項簽名基因研究的基礎,該研究使用了一個包含乳腺癌患者信息的數(shù)據(jù)庫。結論是,參與病理血管生成的11個主要基因在預后價值方面表現(xiàn)最好。
病理血管生成在乳腺癌和視網(wǎng)膜病變中很常見。
這兩種疾病共享這一過程,血管生成是癌癥發(fā)展的主要原因,這一事實促使我們試圖在視網(wǎng)膜病變和乳腺癌之間建立聯(lián)系。
joao Carlos setubal, usp生物信息學實驗室的負責人,也是這篇文章的合著者
根據(jù)研究人員的說法,這項研究的重點是乳腺癌,因為這種疾病有許多可獲得的特征。“考慮到患者之間的巨大差異,我們不得不接觸到大量的公共特征。乳腺癌就是這樣。大約有2000名患者可以獲得基因圖譜。
他補充說,生物信息學對于找到基因特征至關重要。與加拿大OICR的研究人員合作,對實驗室產(chǎn)生的特性進行了復雜的計算處理。該研究的另一位合著者羅德里戈·瓜里斯基·德蘇薩(Rodrigo Guarischi de Sousa)是一名博士生。在本研究的這一部分中,他得到了FAPESP對保羅·c·布特羅斯(Paul C. Boutros)領導的海外研究機構OICR的資助。
布特羅斯目前是加州大學洛杉磯分校(UCLA)人類遺傳學部門的一名研究人員。Guarischi de Sousa目前在巴西最大的診斷醫(yī)療公司DASA工作。
研究人員計劃尋找這種簽名的應用程序,特別是在乳腺癌結算應用程序中。佐丹奴說:“我們的下一個目標是繼續(xù)研究癌癥的血管生成。”“我們感興趣的是在這個列表中列出基因,這些基因可能是開發(fā)新藥物或現(xiàn)有藥物的新應用的目標。”
發(fā)現(xiàn)乳腺癌的預后基因為簽字進行長期研究的結果,由交易所研究國家科學和技術發(fā)展理事會(一級),自2010年起,當Giordano)已開始研究(transcriptome rna表達)和(40g)蛋白表達的視網(wǎng)膜血管病理。
“由于這項研究,我們的實驗室使用了一個小鼠模型來研究視網(wǎng)膜病變。小鼠模型非常重要,很難研究血管形成的外部活組織。佐丹奴說:“這個模型使我們能夠通過調(diào)節(jié)氧氣水平來誘導視網(wǎng)膜病變,并在實驗室中研究血管生成?!?/p>
采取科學家們提取了血液的小鼠血管生理上的差異,以驗證發(fā)生在健康人的瘢痕、排卵,增加胎盤中(例如)和病理性血管疾病的一部分,(比如癌癥或者關節(jié)炎)。
佐丹奴說:“我們觀察了內(nèi)皮細胞(血管內(nèi)的填充物)在血管生成的兩種屬中表達的基因,總是尋找在一種屬中表達的基因多于另一種屬的基因?!?/p>
實驗的一個關鍵因素是含有新生幼鼠的房間里氧氣的變化。在氧氣含量為75%的房間里,老鼠患上了視網(wǎng)膜病變,而在環(huán)境空氣中(氧氣含量為20%),視網(wǎng)膜發(fā)育正常。
氧和細胞之間的關系最近成為新聞。William Kaelin、Peter Ratcliffe和Gregg Semenza獲得了2019年諾貝爾生理學或醫(yī)藥學獎,以研究細胞如何感知和適應不斷變化的氧氣可用性。
重要的是要認識到血管生成基因特征的臨床應用可能不同于BRCA1原位基因的應用。2013年,美國演員安吉麗娜·朱莉(angelina Jolie)在接受基因檢測后接受了預防性雙乳房切除術,證明她攜帶了BRCA1基因突變,因此有87%的乳腺癌風險。
“BRCA1是一個基因組基因,”setubal說?!坝羞@種基因突變的女性患乳腺癌的風險更大,但不一定會?!边@種基因突變的存在有助于預測疾病的外觀。我們在已證實的研究承諾中所描述的簽名,可以預測乳腺癌在實際發(fā)生后的發(fā)展。
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