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        研究蛋白質(zhì)RNA網(wǎng)絡(luò)的新方法
        
			
        
				2019-02-25 09:53:04
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        對(duì)于他們的重要任務(wù)，所有RNA分子都需要蛋白質(zhì)作為結(jié)合伴侶。德國(guó)癌癥研究中心(Deutsches Krebsforschungszentrum，DKFZ)的科學(xué)家和歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室(EMBL)的同事開(kāi)發(fā)出了第一種分析細(xì)胞整個(gè)RNA蛋白網(wǎng)絡(luò)組成的方法。這種新方法現(xiàn)已發(fā)表在科學(xué)期刊Cell上。
        

        研究蛋白質(zhì)RNA網(wǎng)絡(luò)的新方法
        

        RNA分子在每個(gè)細(xì)胞中執(zhí)行重要任務(wù)，信使RNA(mRNA)有助于將存儲(chǔ)在DNA中的遺傳信息轉(zhuǎn)化為蛋白質(zhì)。然而，存在許多其他未翻譯成蛋白質(zhì)的 RNA分子。事實(shí)上，人類(lèi)細(xì)胞中只有5%的RNA是mRNA。
        

        對(duì)于它們的許多功能，RNA分子必須與蛋白質(zhì)相互作用。有時(shí)，不同類(lèi)型的RNA與特定蛋白質(zhì)結(jié)合形成高度復(fù)雜的分子機(jī)器，最好的例子是發(fā)生蛋白質(zhì)合成的核糖體。
        

        “我們每個(gè)細(xì)胞都有一個(gè)巨大的相互作用的RNA和蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)，但我們對(duì)這個(gè)網(wǎng)絡(luò)的確切成分知之甚少。我們想了解哪些蛋白質(zhì)與RNA結(jié)合，以及細(xì)胞類(lèi)型之間的差異，或者在細(xì)胞受到壓力的情況下，我們現(xiàn)在開(kāi)發(fā)了一種方法，使我們能夠第一次對(duì)此進(jìn)行研究，“來(lái)自DKFZ的Jeroen Krijgsveld說(shuō)。
        

        到目前為止，這種分析只能針對(duì)一類(lèi)RNA進(jìn)行，即mRNA。mRNA是指導(dǎo)蛋白質(zhì)序列的模板。使用現(xiàn)有方法無(wú)法檢測(cè)蛋白質(zhì)與所有其他所謂的非編碼RNA類(lèi)型的相互作用，其中一些僅僅已知數(shù)年。“非編碼RNA遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過(guò)mRNA分子，它們滿(mǎn)足各種監(jiān)管目的”Krijgsveld解釋說(shuō)。
        

        與EMBL的同事一起，Krijgsveld現(xiàn)已成功開(kāi)發(fā)出一種稱(chēng)為XRNAX的方法，用于分析所有RNA類(lèi)與細(xì)胞蛋白的相互作用。使用XRNAX，科學(xué)家們也可以做出定量陳述：他們不僅可以看到什么蛋白質(zhì)結(jié)合RNA，還能看到什么程度。通過(guò)這種方式，他們能夠觀察到當(dāng)細(xì)胞暴露于毒素時(shí)RNA結(jié)合如何發(fā)生變化。此外，通過(guò)這種新方法，研究小組發(fā)現(xiàn)了數(shù)百種以前不知道與RNA結(jié)合的蛋白質(zhì)。
        

        “使用XRNAX，我們能夠測(cè)量蛋白質(zhì)和RNA之間的所有相互作用，這是以前沒(méi)人能測(cè)量的。” 解釋了開(kāi)發(fā)XRNAX的Jakob Trendel。“許多蛋白質(zhì) - RNA相互作用被懷疑是導(dǎo)致疾病的根本原因，包括癌癥，肌萎縮側(cè)索硬化癥或HIV等病毒感染。現(xiàn)在我們有辦法看待它們。”
        
			

			
          
        
			
        
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