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        新的數(shù)字方法增強(qiáng)了對(duì)DNA化妝變化的理解

        科學(xué)家已經(jīng)開(kāi)發(fā)出一種計(jì)算方法來(lái)檢測(cè)DNA中的化學(xué)變化,突出細(xì)胞多樣性,并可能更好地了解癌癥。在歐洲研究中,發(fā)表在核酸研究中并涉及紐卡斯?fàn)柎髮W(xué),專家們建立了一種生物信息學(xué)方法,可用于造血,即干細(xì)胞血液形成的過(guò)程。關(guān)于如何在我們體內(nèi)形成不同細(xì)胞的信息在我們的基因組中編碼,該基因組由四個(gè)DNA字母組成。

        新的數(shù)字方法增強(qiáng)了對(duì)DNA化妝變化的理解

        每種細(xì)胞類型的特征在于其獨(dú)特的表觀基因,一個(gè)化妝即離開(kāi)基因組的“打開(kāi)”或“關(guān)閉”不同部分許多不同的蛋白質(zhì)組成的基因組的。使用不同的化妝品,一個(gè)人的相同基因組可編碼必要的信息,以發(fā)展所有不同的組織和器官。開(kāi)發(fā)的新方法允許自動(dòng)分析多個(gè)表觀基因組,以確定必要的化妝變化形成健康和患病細(xì)胞類型的基因組位置。

        疾病生物標(biāo)志物

        紐卡斯?fàn)柎髮W(xué)細(xì)胞醫(yī)學(xué)研究所研究員Daniel Rico博士說(shuō):“我們有技術(shù)來(lái)揭示不同的表觀基因組成,這產(chǎn)生了大量的數(shù)據(jù)。“我們可以認(rèn)真談?wù)摫碛^基因組學(xué)研究中的”大數(shù)據(jù)“。然而,主要的瓶頸是將所有這些數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為有用的信息,以深入了解生物機(jī)制。“我們開(kāi)發(fā)的新方法將使研究人員能夠識(shí)別基因組中的關(guān)鍵區(qū)域,這些區(qū)域根據(jù)細(xì)胞類型顯示差異化妝。“由于許多疾病與疾病特異性表觀基因組構(gòu)成有關(guān),因此該方法對(duì)于鑒定化妝品偏離健康狀態(tài)的基因組中的關(guān)鍵區(qū)域特別有用。“這將有助于開(kāi)發(fā)新的疾病生物標(biāo)志物,并有望為開(kāi)發(fā)針對(duì)表觀基因組的療法開(kāi)辟新的道路。”

        該方法允許整合各種表觀基因組數(shù)據(jù)集以對(duì)不同樣品進(jìn)行分類并自動(dòng)識(shí)別其中變化影響細(xì)胞類型定義的基因組區(qū)域?;蚪M化妝

        人類基因組是一個(gè)沉悶的字母序列,但由于表觀基因組的幫助它變得活著。

        基因組就像一本書(shū),其中字母相互跟隨,沒(méi)有空格,句號(hào)或逗號(hào)。讀這本書(shū)是非常困難的,完全不可能理解它。

        然而,通過(guò)簡(jiǎn)單地添加標(biāo)點(diǎn)符號(hào),我們可以閱讀并理解那些顯然是沉悶的字母序列的含義。

        這是表觀基因組完成的一項(xiàng)重大任務(wù),它由DNA上的化學(xué)變化組成,使我們和細(xì)胞能夠理解如何閱讀和解釋基因組。

        因此,研究表觀基因組對(duì)于了解發(fā)育如何能夠產(chǎn)生形成組織和器官的多種細(xì)胞類型非常重要,所有這些都是從單個(gè)細(xì)胞和單個(gè)基因組開(kāi)始的。

        表觀基因組還經(jīng)常參與解釋健康細(xì)胞在惡性轉(zhuǎn)化后如何產(chǎn)生腫瘤。但是,盡管迄今為止收集了大量數(shù)據(jù),但將基因組區(qū)域的化學(xué)變化和變化類型定位仍然是一個(gè)挑戰(zhàn)。

        這些化學(xué)變化在發(fā)育期間和整個(gè)生命過(guò)程中產(chǎn)生,作為外部因素的影響,例如生活方式,它們可以引發(fā)癌癥等疾病。識(shí)別表觀遺傳學(xué)生物標(biāo)志物是實(shí)現(xiàn)新的診斷和治療選擇的基礎(chǔ)。

        考慮到基因表達(dá)水平作為生物標(biāo)志物,使用它們的開(kāi)/關(guān)狀態(tài),已經(jīng)廣泛使用分子分類。

        這種方法可以讓研究人員識(shí)別那些參與調(diào)節(jié)開(kāi)/關(guān)基因狀態(tài)的區(qū)域,如生物開(kāi)關(guān)。這些區(qū)域可用作表觀遺傳生物標(biāo)志物,補(bǔ)充實(shí)際的分子分類。

        重要的發(fā)展

        該研究的共同第一作者,來(lái)自西班牙國(guó)家癌癥研究中心的Enrique Carrillo-de-Santa-Pau說(shuō):“這種方法的發(fā)展非常重要。

        “到目前為止,細(xì)胞類型之間的差異主要表現(xiàn)在開(kāi)啟或關(guān)閉的基因水平,這是表觀基因組調(diào)控的最終產(chǎn)物,但我們不知道這些基因的開(kāi)關(guān)在哪里(編碼于的表觀基因組)。

        “這種獲得的知識(shí)對(duì)于在細(xì)胞失去對(duì)癌癥等疾病的控制的情況下基于正確開(kāi)關(guān)的新療法是至關(guān)重要的。

        “了解這一級(jí)別的監(jiān)管將使我們?cè)趥€(gè)性化醫(yī)療議程中更進(jìn)一步。”

        希望這種方法能夠讓科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)新的表觀遺傳生物標(biāo)志物,這些生物標(biāo)志物可用于個(gè)性化醫(yī)學(xué)的診斷和治療。

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