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        特定癌癥中發(fā)現(xiàn)新型生物標志物

        冷泉港實驗室(CSHL)的科學家已經確定了一類特定的生物標志物,可以說明患者癌癥的侵襲性。“毫無疑問,幾十個或幾百個突變導致癌癥,幾乎可以在任何腫瘤中找到,”CSHL研究員Jason Sheltzer博士說。“這就是為什么令人驚訝地發(fā)現(xiàn)這些突變在早期良性癌癥以及真正具有攻擊性,高度惡性的癌癥中均勻分布。”換句話說,導致癌癥的突變實際上并沒有告訴你關于誰將最終存活以及誰將最終死于癌癥的事情。

        特定癌癥中發(fā)現(xiàn)新型生物標志物

        這就是為什么Sheltzer博士開始尋找可以確定癌癥患者預后的其他易于識別的因素。根據(jù)eLife發(fā)表的一篇論文(“與癌癥患者預后相關的突變和拷貝數(shù)改變的系統(tǒng)鑒定”),他的團隊不僅追蹤每位患者的結果 - 無論是恢復還是悲劇 - 而且還仔細研究了基因位點通常與致癌突變相關。“癌癥的成功治療決策取決于對患者風險的準確評估。為了提高我們對致命惡性腫瘤的分子改變的理解,我們分析了已知結果患者的17,879例腫瘤的基因組譜。我們發(fā)現(xiàn)幾乎所有癌癥驅動基因的突變都包含非常少的患者預后信息。然而,這些相同驅動基因中的拷貝數(shù)改變(CNA)具有顯著的預后能力。研究人員寫道,當控制分期,分級,TP53狀態(tài)和完全非整倍性時,局灶性CNA與更廣泛的改變相關,并且許多驅動基因中的CNA仍然是預后。“通過對獨立患者隊列進行薈萃分析,我們確定了特定癌癥類型中強大的預后生物標志物,并且我們證明這些變化的一部分也賦予了特定的治療漏洞??傊?,我們的分析為癌癥生物標志物鑒定建立了全面的資源,并強調了基因拷貝數(shù)分析在評估臨床風險中的重要性。““雖然良性和侵襲性腫瘤的突變類型沒有太大差異,”Sheltzer博士說,“當我們觀察這些相同基因的拷貝數(shù)變化時,我們發(fā)現(xiàn)了非常顯著的差異。”

        通常,人類細胞中的遺傳信息分布在23對染色體中的兩個拷貝中。然而,癌細胞經常獲得或失去染色體。

        Sheltzer博士解釋說:“許多癌癥而不是基因的兩個拷貝,將有三個拷貝,四個拷貝,五個拷貝,或者只有一個拷貝的基因。” “我們研究了這些拷貝數(shù)改變與癌癥患者發(fā)生的關系之間的關系,并發(fā)現(xiàn)了一種強烈的關系。”

        他現(xiàn)在希望開展一項前瞻性分析,在診斷后多年密切研究新的癌癥患者。這可以突出顯示哪種類型的拷貝數(shù)變化與哪些結果相關聯(lián)。“這將是我們學習所學知識并將其轉化為臨床有用工具的第一步,也可以讓患者安心,”Sheltzer博士說。

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