新的生物信息學(xué)工具識(shí)別和分類CRISPR-Cas系統(tǒng)

旨在提高實(shí)用性和可用性日益多樣化的CRISPR-Cas基因組編輯系統(tǒng),新的CRISPRdisco自動(dòng)管道可以幫助研究人員識(shí)別CRISPR重復(fù)和中科院基因在基因組裝配。免費(fèi)軟件提供標(biāo)準(zhǔn)化、高通量分析方法,檢測(cè)CRISPR重復(fù)和準(zhǔn)確地分配類,類型和子類型,CRISPR日?qǐng)?bào)》發(fā)表的一篇文章中所描述的。

CRISPR發(fā)現(xiàn)(CRISPRdisco)起源于Rodolphe Barrangou的北卡州立大學(xué)的實(shí)驗(yàn)室,博士CRISPR雜志的主編。Barrangou博士和他的同事亞歷山德拉?？藙诶鸑C州立大學(xué)羅利和詹姆斯•亨利,AgBiome,達(dá)勒姆,數(shù)控,合著文章題為“CRISPRdisco:一個(gè)自動(dòng)化管道CRISPR-Cas發(fā)現(xiàn)和分析的系統(tǒng)。”

在這項(xiàng)研究中,研究人員使用CRISPRdisco識(shí)別和分類可能從NCBI RefSeq CRISPR-Cas系統(tǒng)2777年完整的基因組數(shù)據(jù)庫。他們強(qiáng)調(diào)的重要性,能夠區(qū)分完整和不完整的CRISPR系統(tǒng)和確定潛在的完整和功能之間的聯(lián)系CRISPR-Cas系統(tǒng)體內(nèi)和CRISPR-Cas多樣性硅片。重要的是,這個(gè)平臺(tái)通過GitHub是現(xiàn)成的,我可以讓新手和描述CRISPR-Cas系統(tǒng)各種基因組數(shù)據(jù)集。

“新生物信息學(xué)工具、程序和數(shù)據(jù)庫是有助于推動(dòng)CRISPR革命,我們很樂意提供一個(gè)論壇來驗(yàn)證這些重要的平臺(tái),”凱文·戴維斯說,博士CRISPR雜志的執(zhí)行編輯。

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