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        新版人類(lèi)蛋白質(zhì)圖譜
        
			
        
				2019-01-24 12:04:24
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			  來(lái)源：
			
        
		
        
				
		
        
			
        今天，推出了第15版人類(lèi)蛋白質(zhì)圖譜。新版本包括來(lái)自不同來(lái)源的數(shù)據(jù)，這使得可以對(duì)RNA和蛋白質(zhì)水平的組織譜進(jìn)行比較。仔細(xì)觀察人體組織或細(xì)胞中的健康和疾病狀況，可以了解更多信息，從而改善醫(yī)療保健。為了進(jìn)行這種比較，研究人員首先需要了解人體是如何建立的。一種方法是分析轉(zhuǎn)錄組。這意味著研究哪些基因被激活以在組織或細(xì)胞樣品中產(chǎn)生蛋白質(zhì)。
        

        新版人類(lèi)蛋白質(zhì)圖譜
        

        人類(lèi)生物學(xué)分三個(gè)步驟構(gòu)建; 從DNA到RNA再到蛋白質(zhì)。需要將DNA代碼復(fù)制到RNA中，然后讀取以制作蛋白質(zhì)。檢測(cè)和計(jì)數(shù)蛋白質(zhì)分子非常復(fù)雜，科學(xué)家們需要不同的方法來(lái)確保數(shù)據(jù)的有效性。一種方法是分析轉(zhuǎn)錄組以計(jì)算從特定基因的DNA中復(fù)制的RNA分子的量，從而產(chǎn)生從樣品中期望的蛋白質(zhì)的圖片。計(jì)數(shù)RNA分子比計(jì)算蛋白質(zhì)分子更容易。
        

        人類(lèi)蛋白質(zhì)圖譜包括基于超過(guò)25 000種針對(duì)超過(guò)17 000種獨(dú)特蛋白質(zhì)的抗體的蛋白質(zhì)組分析，并結(jié)合涵蓋所有20 000種人類(lèi)蛋白質(zhì)編碼基因的轉(zhuǎn)錄組分析。4月11日發(fā)布的新地圖集還包括來(lái)自多個(gè)來(lái)源的主要數(shù)據(jù)，可以進(jìn)行比較。
        

        - 人類(lèi)蛋白質(zhì)圖譜的新版本在繪制不同人體組織中的轉(zhuǎn)錄組方面取得了顯著進(jìn)步。這些數(shù)據(jù)是我們?cè)贑halmers進(jìn)行的大部分代謝模型的基礎(chǔ)。因此，我對(duì)這一進(jìn)展感到非常興奮，人類(lèi)蛋白質(zhì)圖譜肯定會(huì)成為我們向更好的診斷和精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)發(fā)展的重要資源，生物學(xué)和生物工程系的Jens Nielsen教授說(shuō)。
        

        此次發(fā)布會(huì)附有分子系統(tǒng)生物學(xué)的一篇文章，描述了轉(zhuǎn)錄組資源，重點(diǎn)是從Broad Institute，Boston，US(GTEx)和Human Protein Atlas生成的數(shù)據(jù)集之間的比較。與人類(lèi)蛋白質(zhì)圖譜相比，GTEx數(shù)據(jù)集包括大多數(shù)重疊的1600個(gè)樣本，但在某些情況下是獨(dú)特的組織。已經(jīng)包括來(lái)自28個(gè)GTEx組織的RNA-seq數(shù)據(jù)以及人類(lèi)蛋白質(zhì)圖譜中的相應(yīng)組織，以允許人類(lèi)蛋白質(zhì)圖譜和GTEx數(shù)據(jù)集之間的直接比較。
        

        - 將GTEx數(shù)據(jù)集納入人類(lèi)蛋白質(zhì)Atlas數(shù)據(jù)庫(kù)使其更加全面，并且令人放心的是，基于兩個(gè)獨(dú)立數(shù)據(jù)集的基因組織分類(lèi)存在顯著重疊，項(xiàng)目主任MathiasUhlén教授說(shuō)。人類(lèi)蛋白質(zhì)圖譜項(xiàng)目。
        

        發(fā)表在Molecular Systems Biology上的文章討論了公開(kāi)可用的人類(lèi)轉(zhuǎn)錄組資源以及這些數(shù)據(jù)庫(kù)在各種應(yīng)用中的可能用途，例如構(gòu)建用于分析健康和疾病背景下的細(xì)胞和組織功能的基因組規(guī)模代謝模型。
        
			

			
          
        
			
        
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