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        ATCC推出參考質(zhì)量基因組序列的新數(shù)據(jù)庫(kù)以協(xié)助生物學(xué)研究
        
			
        
				2019-10-08 10:06:56
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			  來(lái)源：
			
        
		
        
				
		
        
			
        ATCC推出了新的ATCC Genome Portal，這是一個(gè)公開的參考質(zhì)量基因組序列數(shù)據(jù)庫(kù)，與經(jīng)過(guò)身份驗(yàn)證的ATCC生物材料相匹配，這將有助于研究人員滿懷信心地解釋和再現(xiàn)其結(jié)果。該門戶網(wǎng)站最初以廣泛使用的細(xì)菌菌株的250個(gè)基因組序列啟動(dòng)，實(shí)現(xiàn)了ATCC的“增強(qiáng)認(rèn)證計(jì)劃”，該計(jì)劃是“ 難以置信的2020年計(jì)劃”旨在提高生物研究可重復(fù)性的五項(xiàng)核心承諾中的第一項(xiàng)。
        

        ATCC推出參考質(zhì)量基因組序列的新數(shù)據(jù)庫(kù)以協(xié)助生物學(xué)研究
        

        當(dāng)前公開可用的基因組序列缺乏真實(shí)性，質(zhì)量，完整性或可追溯性，這會(huì)損害結(jié)果。由于缺乏用于開發(fā)和驗(yàn)證參考質(zhì)量基因組序列的標(biāo)準(zhǔn)化方法，這一問(wèn)題更加嚴(yán)重。
        

        ATCC通過(guò)開發(fā)用于生成參考質(zhì)量基因組的標(biāo)準(zhǔn)化工作流程來(lái)解決此問(wèn)題。從低合格的經(jīng)過(guò)驗(yàn)證的ATCC材料開始，并使用標(biāo)準(zhǔn)化的下一代測(cè)序和雜交組裝方法，ATCC通過(guò)將高精度的短讀本與超長(zhǎng)讀本的支架功能相結(jié)合，產(chǎn)生了完整的參考質(zhì)量基因組。此工作流程的每個(gè)步驟均經(jīng)過(guò)嚴(yán)格的質(zhì)量控制分析，以確保進(jìn)入下一步的數(shù)據(jù)盡可能達(dá)到最高質(zhì)量—只有通過(guò)所有質(zhì)量控制標(biāo)準(zhǔn)的數(shù)據(jù)才發(fā)布到ATCC基因組門戶。
        

        為了使科學(xué)家能夠準(zhǔn)確地解釋其結(jié)果并與計(jì)算機(jī)模擬模型進(jìn)行深入的關(guān)聯(lián)，他們需要獲得經(jīng)過(guò)嚴(yán)格驗(yàn)證的參考基因組，這些參考基因組與可靠的生物材料相關(guān)聯(lián)。通過(guò)我們的增強(qiáng)身份驗(yàn)證計(jì)劃，我們已經(jīng)確定了現(xiàn)有公開數(shù)據(jù)的主要挑戰(zhàn)，并開發(fā)了一種用于提高參考基因組序列質(zhì)量的解決方案。我們很高興能夠?yàn)榭茖W(xué)界提供這種資源。
        

        研究人員可以下載高質(zhì)量的基因組序列，以用于生物信息學(xué)分析，查看帶注釋的數(shù)據(jù)以及使用自己的數(shù)據(jù)搜索基因組。ATCC將在可用的其他基因組不斷更新門戶。
        
			

			
          
        
			
        
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