新技術(shù)通過生物量測量微生物群落
北卡羅來納州立大學(xué)和卡爾加里大學(xué)的研究人員設(shè)計(jì)的一項(xiàng)新技術(shù)可以更深入地了解微生物群落的組成和活動 - 我們體內(nèi)和周圍的微觀生命。
新技術(shù)不是依賴于對某個(gè)樣本中存在的微生物數(shù)量的調(diào)查,而是試圖評估這些微生物的生物量 - 蛋白質(zhì)豐度 - 包括細(xì)菌,病毒和其他微小的生命形式。微生物群落在動植物健康和疾病以及重要的環(huán)境過程中發(fā)揮重要作用,如土壤和海洋中的有機(jī)物分解和養(yǎng)分循環(huán)。近年來,對這些社區(qū)的研究越來越廣泛。
曼努埃爾克萊納是北卡羅來納州植物和微生物生物學(xué)助理教授,也是報(bào)告研究報(bào)告的論文的作者,他說,評估微生物群落的差異可以比作鄰里人口普查和更深入研究之間的差異。那個(gè)社區(qū)。
“目前大多數(shù)微生物群落研究就像是對社區(qū)中存在的微生物類型的普查以及有多少微生物的普查,這提供了一些良好的基本信息,”Kleiner說。“我們正在尋找更深層次的東西,因此我們的技術(shù)可以比作采訪鄰居居民,以更多地了解他們是誰,他們做了什么以及他們?yōu)樯鐓^(qū)做出了多少貢獻(xiàn)。
“就微生物群落而言,這種更深層的外觀意味著檢查這些微生物的生物量 - 這為我們提供了更好的微生物活動和影響的線索。到目前為止,我們還沒有辦法量化微生物群落的個(gè)體成員。在質(zhì)量上。“
為了測試這種新方法,研究人員在實(shí)驗(yàn)室中培養(yǎng)了許多生物并計(jì)算了它們的細(xì)胞和蛋白質(zhì),然后將它們混合在一起以形成一個(gè)人工群落。
“我們創(chuàng)建了許多具有不同微生物分布的人工群落,以便我們可以測試我們是否得到了反映我們最初投入的微生物的結(jié)果,”Kleiner說。
結(jié)果表明,新方法的結(jié)果非常有效地反映了實(shí)際的微生物群落。
接下來,研究人員測試了Rocky Mountain堿性蘇打湖中的新方法,即含鹽量高和pH值較高的粘稠水體。他們在其中一個(gè)湖泊中發(fā)現(xiàn),這種新方法能夠識別出更常見的“計(jì)數(shù)”方法找不到的藻類。
研究人員還使用這種新方法檢查了現(xiàn)有的多個(gè)人口唾液數(shù)據(jù)集,發(fā)現(xiàn)微生物群落的變異比以前的研究顯示的要多得多。
“新方法給出了微生物群落結(jié)構(gòu)的完全不同的維度,”Kleiner說。“它不一定是'更好'的方法,而是一種可以更好地洞察這些社區(qū)的免費(fèi)方法。”
Kleiner補(bǔ)充說,該研究的所有數(shù)據(jù)都是公開的,因此其他研究人員可以自己測試新技術(shù)。
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