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        病毒喜歡耕種區(qū)域到自然區(qū)域
        
			
        
				2019-04-29 10:44:04
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        與非農(nóng)業(yè)地區(qū)相比，農(nóng)業(yè)地區(qū)受病毒性流行病的影響更大。這是一項(xiàng)國際研究的結(jié)果，該研究是法國 - 南非在西開普省和卡馬格地區(qū)的植物區(qū)合作的一部分。這些結(jié)果于2018年1月發(fā)表在ISME Journal上，這是一本微生物生態(tài)學(xué)雜志。
        

        病毒喜歡耕種區(qū)域到自然區(qū)域
        

        農(nóng)業(yè)對植物病毒在環(huán)境中的分布和流行具有相當(dāng)大的影響。在農(nóng)業(yè)區(qū)，病毒感染的頻率明顯高于自然區(qū)。這是由Camargue(法國)和西開普省(南非)的國際科學(xué)家團(tuán)隊(duì)進(jìn)行的一項(xiàng)研究的結(jié)論，其結(jié)果于1月份在ISME期刊上發(fā)表。
        

        CIRAD植物病毒學(xué)研究人員Philippe Roumagnac解釋說：“與作物品種一樣，遺傳上相似的生物聚集和集中，助長了流行病。”該研究還表明，就微生物的生物多樣性而言尚未開發(fā)的“天然隔室”含有大量病毒。“與農(nóng)業(yè)用地相鄰的地區(qū)可以使我們更好地了解植物病害的出現(xiàn)，”他說。
        

        雖然50%的新出現(xiàn)的植物病害是病毒，但仍然缺乏對植物病毒多樣性的了解。據(jù)官方統(tǒng)計(jì)，到目前為止，已經(jīng)對大約1,400種植物病毒進(jìn)行了表征和分類。這個(gè)數(shù)字可能遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于植物病毒的真正多樣性，最近對陸地和海洋生態(tài)系統(tǒng)的探索表明了這一點(diǎn)。而且，這個(gè)數(shù)字無疑在兩個(gè)層面上被扭曲了。首先，病毒的描述幾乎完全基于極少數(shù)的農(nóng)業(yè)植物物種進(jìn)行，其次，大多數(shù)病毒僅在宿主出現(xiàn)癥狀后才被表征。“因此，我們對植物病毒世界的了解在多樣性方面仍然非常局部，但在農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)層面的分布方面也是如此，”CIRAD的植物病毒學(xué)研究員Denis Filloux說。“缺乏知識是我們理解農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)全球功能，以及新植物病毒病出現(xiàn)中風(fēng)險(xiǎn)因素的定義和量化或解決這些疾病的策略設(shè)計(jì)的障礙。”剩余待鑒定的大多數(shù)病毒存在于人類活動(dòng)很少的區(qū)域。
        

        為了達(dá)到這個(gè)結(jié)果，科學(xué)家采用了一種新的病毒宏基因組學(xué)方法。“Metagenomics是一種對填充給定環(huán)境的微生物的所有基因組進(jìn)行高通量測序的方法，”Philippe Roumagnac解釋說。“例如，它使我們能夠進(jìn)入病毒體，換句話說，所有病毒序列都包含在宿主生物體或含有幾種潛在宿主的樣本中。”
        

        自2009年以來，植物病理學(xué)中出現(xiàn)了新一代宏基因組學(xué)研究，不僅可以分析生態(tài)系統(tǒng)或生物體的整體基因組，還可以將病原體序列與宿主和/或地理位置直接聯(lián)系起來。 。空間宏基因組學(xué)的這項(xiàng)原始研究通過揭示許多被分析的植物是病毒感染的，徹底改變了植物病毒分布的觀點(diǎn)。
        
			

			
          
        
			
        
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