植物DNA如何避免紫外線輻射的破壞
如果來自太陽的紫外線輻射會損害人體DNA導(dǎo)致健康問題,紫外線輻射是否也會破壞植物DNA?答案是肯定的,但由于植物不能從陽光下進入或在防曬霜上涂抹,因此它們具有超強的DNA修復(fù)套件。今天,2015年諾貝爾獎獲得者,醫(yī)學(xué)博士,博士,UNC醫(yī)學(xué)院實驗室已經(jīng)發(fā)表了一項關(guān)于植物中這種強大的DNA修復(fù)系統(tǒng)的精致研究,該研究非常類似于人類和其他動物的修復(fù)系統(tǒng)。
該研究發(fā)表在Nature Communications上,是整個多細胞生物的第一張修復(fù)圖。它揭示了與人類相比,“核苷酸切除修復(fù)”系統(tǒng)在植物的活性基因中的效率更高。而這種效率取決于白天/黑夜的周期。
“這些研究結(jié)果促進了我們對所有生物體中常見的DNA修復(fù)機制的理解,也可能具有實際應(yīng)用,”共同通訊作者Ogun Adebali博士說,他是Sancar實驗室的博士后研究員。
第一作者,Sancar實驗室博士后研究員Onur Oztas博士說:“植物中的DNA損傷會影響其生長和發(fā)育,因此提高切除修復(fù)系統(tǒng)可能是提高作物產(chǎn)量的良好策略。”
Sancar,Sarah Graham Kenan生物化學(xué)和生物物理學(xué)教授,因其對切除修復(fù)的研究而獲得2015年諾貝爾化學(xué)獎,現(xiàn)在人們普遍認為切除修復(fù)是生物體內(nèi)DNA修復(fù)的主要機制 - 包括修復(fù)紫外線損傷。此修復(fù)系統(tǒng)的大多數(shù)先前研究已經(jīng)在哺乳動物和細菌細胞中進行;關(guān)于該系統(tǒng)如何在植物中起作用的知之甚少。然而,植物必須具有有效的DNA修復(fù)系統(tǒng),因為它們不能輕易避免陽光照射,當然也需要它來生長。
在這項研究中,Oztas及其同事使用了他們最近開發(fā)的切除修復(fù)映射技術(shù),稱為XR-seq。該技術(shù)使他們能夠檢測和測序在切除修復(fù)過程中從染色體上切下的短長度的受損DNA。這些DNA片段的序列可以與參考基因組上相應(yīng)的DNA片段匹配,以精確定位DNA損傷正在修復(fù)的斑點。
UNC研究人員對紫外線照射的植物 - 擬南芥(Arabidopsis thaliana)進行了XR-seq掃描,擬南芥是植物研究的“實驗室大鼠”,也稱為擬南芥或小鼠耳水芹。得到的修復(fù)圖顯示,擬南芥中的切除修復(fù)對活躍的基因起作用更快?;钴S時的基因轉(zhuǎn)錄成RNA鏈,然后可以轉(zhuǎn)化為蛋白質(zhì),即細胞的主要機制。來自Sancar實驗室的先前研究表明,切除修復(fù)對于動物和細菌中的活躍轉(zhuǎn)錄基因更有效。這種被稱為轉(zhuǎn)錄偶聯(lián)修復(fù)的現(xiàn)象被認為已經(jīng)發(fā)展成為一種在最急需的地方進行DNA修復(fù)的方法。
“在這里,我們發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄偶聯(lián)修復(fù)效率的提高在植物中比在動物或細菌中更為明顯,”Oztas說。
Sancar的實驗室在24小時內(nèi)對UV暴露的擬南芥進行了XR-seq,以發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄偶聯(lián)修復(fù)的效率也根據(jù)“晝夜節(jié)律”日/夜周期的10%至30%的擬南芥基因而變化。這反映了這些基因中轉(zhuǎn)錄活性的正常日變化。
“結(jié)果表明植物的切除修復(fù)與其他生物體的修復(fù)方式大致相同 - 為了最大限度地提高效率,”Oztas說。
Sancar實驗室計劃跟進研究,旨在解決關(guān)于植物切除修復(fù)的兩個謎團。一個是敲除切除修復(fù)系統(tǒng)導(dǎo)致植物基因組突變的增加,即使植物保持在黑暗中,遠離紫外線或其他形式的光。
“這意味著需要進行切除修復(fù)以修復(fù)除紫外線以外的其他未知因素造成的DNA損傷,”Oztas說。“我們希望識別和表征這些未知因素,并找出切除修復(fù)如何修復(fù)它們造成的損害類型。”
植物切除修復(fù)系統(tǒng)還涉及與其他生物體中發(fā)現(xiàn)的修復(fù)蛋白質(zhì)略有不同的一組。UNC的科學(xué)家們希望確定為什么這樣,以及植物特有的一組切除修復(fù)蛋白如何協(xié)同工作以保持植物基因組的良好修復(fù)。
推薦內(nèi)容
-
生物信息學(xué)家研究了果蠅中破碎基因的進化
假基因失去了編碼蛋白質(zhì)的能力,這些蛋白質(zhì)不受自然選擇的影響,因為這些基因中沒有突變是有害的。由MSU(羅蒙諾索夫莫斯科國立大學(xué))生物工
-
前列腺癌預(yù)測看起來機器學(xué)習(xí)準確性提升
診斷前列腺癌(PCa)一直面臨難以克服的障礙。目前的診斷標準,前列腺特異性抗原或PSA檢測,有許多局限性 - 正如1970年P(guān)SA的發(fā)現(xiàn)者Richard
-
研究人員開發(fā)光聲測溫系統(tǒng)以幫助指導(dǎo)HIFU治療
高強度聚焦超聲(HIFU)治療是一種非侵入性方法,可通過將高強度超聲波從體外傳遞到病變部位來去除不健康的組織和腫瘤。它僅對病變周圍的正常
-
科治好:如何減少蔬菜上的農(nóng)藥殘留?
現(xiàn)代農(nóng)業(yè)離不開農(nóng)藥,因此在吃蔬菜之前一定要徹底清洗,盡量減少蔬菜上的農(nóng)藥殘留??浦魏锰嵝眩耗男┦卟宿r(nóng)藥殘留高?1 有特殊香味的蔬菜農(nóng)
-
微管橋組織早期胚胎細胞的細胞骨架
A * STAR的科學(xué)家們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了新生胚胎中的細胞如何組織構(gòu)成骨骼的骨骼,即微管。雖然這一發(fā)現(xiàn)解決了一個謎團,但它也提出了一系列新問題
-
旅行 超級細菌 增加了常見程序的感染風(fēng)險
昆士蘭大學(xué)的研究人員說,接觸抗生素抗性細菌的旅行者可能會改變依賴有效抗生素的普通醫(yī)療程??序。昆士蘭大學(xué)昆士蘭分校臨床研究中心...
-
研究揭示了晚期胰腺癌的新亞型
安大略癌癥研究所(OICR)和大學(xué)健康網(wǎng)絡(luò)(UHN)的研究人員發(fā)現(xiàn)了有關(guān)胰腺癌亞型的詳細新信息。更好地了解疾病組可能會導(dǎo)致新的治療選擇...
-
研究評估了不成對的1基因過表達對果蠅壽命的影響
Alexey Moskalev,博士,金保護和輻射防護技術(shù)實驗室主任,以及RAS科米科學(xué)中心生物學(xué)研究所的共同作者宣布發(fā)表一篇名為未配對的1基因過表
-
硫酸鹽有助于植物應(yīng)對水資源短缺
植物從地下水中吸收硫酸鹽。由海德堡大學(xué)科學(xué)家領(lǐng)導(dǎo)的一個國際研究小組發(fā)現(xiàn)了硫酸鹽如何控制植物中干旱脅迫激素ABA的產(chǎn)生,從而有助于它們
-
重磅品種過評后這家藥企被賣了
近日,據(jù)經(jīng)七緯五康策消息,根據(jù)上市藥品目錄集更新信息,興安藥業(yè)的阿托伐他汀鈣片10mg按化學(xué)藥品新注冊分類獲批,視同通過一致性評價。據(jù)