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        低細(xì)胞數(shù)的表觀基因組分析的有前景的方法
        
			
        
				2019-02-21 10:16:19
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        九州大學(xué)和日本東京工業(yè)大學(xué)的科學(xué)家開發(fā)出一種技術(shù)，可以使用極少量的細(xì)胞(100到1,000)分析DNA-蛋白質(zhì)相互作用。他們的方法可以捕獲以前未經(jīng)檢查的表觀基因組信息，促進(jìn)生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)，并開辟精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的新途徑。
        

        低細(xì)胞數(shù)的表觀基因組分析的有前景的方法
        

        九州大學(xué)，東京工業(yè)大學(xué)，早稻田大學(xué)，東京大學(xué)和大阪大學(xué)的研究人員開展的一項合作研究，開發(fā)了一種獨(dú)特的表觀基因組分析方法，涉及使用比現(xiàn)有方法更少的細(xì)胞。
        

        這項名為染色質(zhì)整合標(biāo)記測序(ChIL-seq)的技術(shù)可以為科學(xué)家們研究稀缺細(xì)胞類型和其他短缺細(xì)胞樣本開辟新的機(jī)會。ChIL-seq僅需要一小部分起始細(xì)胞材料。在一系列評估ChIL-seq性能的實驗中，研究人員成功地證明了使用100至1,000個細(xì)胞檢測組蛋白修飾和DNA結(jié)合因子。
        

        在過去的十年中，染色質(zhì)免疫沉淀測序(ChIP-seq)一直是分析表觀基因組數(shù)據(jù)和鑒定DNA相關(guān)蛋白的重要結(jié)合位點(diǎn)的主要技術(shù)。然而，一個限制是ChIP-seq需要至少10,000個或通常數(shù)百萬個細(xì)胞開始，主要是由于樣品在兩個關(guān)鍵步驟中往往丟失：染色質(zhì)制備和免疫沉淀。
        

        由東京工業(yè)大學(xué)創(chuàng)新研究所的Hiroshi Kimura和九州大學(xué)生物調(diào)節(jié)醫(yī)學(xué)研究所的Okauyuki Ohkawa共同領(lǐng)導(dǎo)的研究小組通過用免疫染色取代上述兩個步驟克服了樣品丟失的問題，適用于分析組織標(biāo)本的非破壞性方法。
        

        使用ChIL-seq，該團(tuán)隊還在單細(xì)胞水平上檢測到與組蛋白標(biāo)記相關(guān)的基因組區(qū)域 - 這一成就使生物學(xué)家更接近建立單細(xì)胞分析的長期目標(biāo)。
        

        ChIL-seq可以在細(xì)胞分解之前“放大”靶分子附近的基因組序列，這對于研究貼壁細(xì)胞特別有用，即保持附著于培養(yǎng)板和免疫熒光后的全細(xì)胞。
        

        目前世界各地正在開發(fā)許多不同類型的表觀基因組分析方法。每個都有其優(yōu)點(diǎn)和局限。研究人員指出，ChIL-seq也需要精煉。例如，在其目前的形式中，它對異染色質(zhì)區(qū)域的敏感性低，并且可能需要三到四天才能完成該過程。
        

        總體而言，他們相信ChIL-seq由于其精確性而具有前景，這使其適用于單細(xì)胞應(yīng)用及其靈活性，這意味著未來可將其與其他強(qiáng)大的測序技術(shù)相結(jié)合。
        
			

			
          
        
			
        
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