DNA修復(fù)酶映射在原子細(xì)節(jié)
英國最受好評的生物科學(xué)大學(xué)鄧迪大學(xué)的研究人員已經(jīng)在原子細(xì)節(jié)中繪制了一種對我們細(xì)胞中DNA修復(fù)過程至關(guān)重要的酶。DNA修復(fù)在癌癥等人類疾病中起著關(guān)鍵作用。研究人員表示,揭示參與這一過程的關(guān)鍵酶的三維分子結(jié)構(gòu)可能是開發(fā)未來藥物的重要一步。
DNA是細(xì)胞的遺傳“文庫”,非常重要,必須在受損時(shí)進(jìn)行修復(fù)。它是細(xì)胞中唯一一種受到這種修復(fù)的分子。在一個(gè)這樣的過程中,DNA暫時(shí)形成互連,稱為連接,大部分由特殊的酶處理,包括一個(gè)叫做GEN1的酶,現(xiàn)在已由Dundee團(tuán)隊(duì)繪制。
“GEN1是這些蛋白質(zhì)中第一個(gè)被鑒定出來的,而且僅在最近才發(fā)現(xiàn),”鄧迪大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院的David Lilley教授說,他領(lǐng)導(dǎo)了這項(xiàng)新工作。“我們現(xiàn)在已經(jīng)詳細(xì)確定了GEN1的分子結(jié)構(gòu)。這是了解DNA修復(fù)的重要一步,以及我們將來如何開發(fā)能夠影響它的藥物。”
為了理解酶如何在細(xì)胞中發(fā)揮作用,確定其分子的結(jié)構(gòu)非常重要。這意味著要弄清楚其所有組成原子如何位于3D空間中。
這是通過獲得蛋白質(zhì)的小晶體來實(shí)現(xiàn)的,然后散射由巨大粒子加速器產(chǎn)生的X射線,稱為同步加速器。可以使用數(shù)學(xué)從得到的衍射X射線圖案重建蛋白質(zhì)分子的3D結(jié)構(gòu)。
Lilley教授補(bǔ)充說:“在這項(xiàng)研究中,我們使用了一種來自一種生活在高溫下的酵母的GEN1酶。這種酶與人類蛋白質(zhì)密切相關(guān),但具有更好的研究特性。這使我們能夠詳細(xì)研究其生化特性,然后通過X射線晶體學(xué)確定其結(jié)構(gòu)。“
得到的分子結(jié)構(gòu)圖像顯示GEN1與DNA緊密結(jié)合,兩個(gè)分子之間有廣泛的接觸。
“蛋白質(zhì)的整個(gè)形狀已經(jīng)演變?yōu)樽R別DNA連接的不尋常形狀,”Lilley教授說。
該研究由英國癌癥研究中心資助,該研究為Lilley教授的實(shí)驗(yàn)室提供了20多年的支持。
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