關(guān)于關(guān)鍵流感蛋白的第一個(gè)綜合結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)
甲型流感病毒催生了流行病,全球大流行病和大規(guī)模捕殺鳥類的大規(guī)模爆發(fā),但現(xiàn)在只有流感科學(xué)家才能獲得關(guān)于流感病毒生存關(guān)鍵蛋白質(zhì)的全面,高分辨率結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)。
突出的蛋白質(zhì)是RNA聚合酶,其轉(zhuǎn)錄并復(fù)制宿主細(xì)胞核中的病毒基因組。
牛津大學(xué)的Ervin Fodor博士及其同事在開創(chuàng)性研究中揭示了這種蛋白質(zhì)的新亮點(diǎn),該研究還揭示了抗病毒藥物的新網(wǎng)站,這些藥物可以針對(duì)RNA聚合酶中的易受攻擊的目標(biāo),蛋白質(zhì)Fodor稱之為FluPolA。
“所有這些網(wǎng)站都是保存完好的地區(qū),”福多在一封電子郵件中說(shuō),他指的是可能在多種流感病毒中起作用的新型流感藥物目標(biāo)。“FluPolA是一般流感中最保守的蛋白質(zhì)之一。因此,它是抗病毒藥物開發(fā)的良好靶標(biāo)。”
FluPolA是流感感染過(guò)程的主要驅(qū)動(dòng)因素。沒(méi)有它,流感病毒就無(wú)法復(fù)制其遺傳信息并占據(jù)宿主細(xì)胞的遺傳信息。但多年來(lái)收集的更多數(shù)據(jù)來(lái)自于在蝙蝠之間流行的甲型流感病毒導(dǎo)致的FluPolA結(jié)構(gòu),F(xiàn)odor發(fā)現(xiàn),而H3N2中的FluPolA經(jīng)常影響人群中的大量糞便。H5N1的FluPolA結(jié)構(gòu)信息也不多,這是一種值得注意的鳥類流感威脅。
Fodor和他的牛津同事現(xiàn)在通過(guò)揭示H3N2和H5N1的關(guān)鍵蛋白質(zhì)中原子的排列,對(duì)FluPolA及其多種功能投下了鮮明的亮點(diǎn)。通過(guò)使用X射線晶體學(xué)和低溫電子顯微鏡,該團(tuán)隊(duì)對(duì)兩種病毒的FluPolA結(jié)構(gòu)有了新的見(jiàn)解。
在最近一期“ 自然 ”雜志上寫道,福多將FluPolA研究中涉及的病毒定義為人類流感病毒A / 1968 / H3N2,這種病毒在51年前在香港流感大流行中環(huán)繞全球。團(tuán)隊(duì)獲得高分辨率結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的另一個(gè)FluPolA是A / duck / Fujian / H5N1,2002株 - 一種特別討厭的馴養(yǎng)鳥類殺手。
Nature論文透露,必須克服新的障礙,為H3N2和H5N1提供大量有關(guān)FluPolA的數(shù)據(jù)。
“要克服許多技術(shù)難題,”福多說(shuō)。“甲型流感病毒聚合酶-FluPolA難以大量表達(dá)和純化。一個(gè)問(wèn)題是三個(gè)亞基需要共表達(dá)和純化。第二個(gè)問(wèn)題是FluPolA特別不穩(wěn)定,它具有高度靈活的結(jié)構(gòu)域,使基于結(jié)晶的方法非常困難。
“我們選擇使用H3N2聚合酶作為人類流感病毒的代表; H3N2菌株目前在人群中傳播,盡管我們從1968年開始研究一種舊菌株,我們的研究小組之前研究過(guò)這種菌株,”他說(shuō)。
“我們選擇了H5N1禽流感FluPolA,因?yàn)槲覀兿胍容^禽流感和人類甲型流感病毒聚合酶 - 我們之前也研究過(guò)這種特殊的禽流感病毒。人和禽流感FluPolA序列不同,我們想知道這些差異究竟是如何影響結(jié)構(gòu)的。 Avod FluPolA在人體細(xì)胞中效果不佳,禽流感病毒需要適應(yīng)哺乳動(dòng)物細(xì)胞環(huán)境,這涉及FluPolA中的適應(yīng)性突變,“Fodor說(shuō)。
甲型流感病毒以及它們的B對(duì)應(yīng)物具有由8個(gè)RNA片段組成的基因組。這些鏈帶有流感病毒在宿主中復(fù)制所需的所有信息。RNA片段通過(guò)RNA聚合酶復(fù)制。
流感是人類呼吸道疾病,可由A或B病毒引起。B型流感僅在人類中引起感染。這兩種類型都可能導(dǎo)致嚴(yán)重的呼吸系 甲型流感病毒已引發(fā)重大流行病和全球性流行病。致命的1918年流感,有史以來(lái)最嚴(yán)重的流感,是由甲型流感病毒引起的。
美國(guó)疾病控制和預(yù)防中心的統(tǒng)計(jì)人員估計(jì),由于季節(jié)性流感相關(guān)并發(fā)癥,全世界每年有291,000至646,000人死亡。
H5N1,通常被稱為HPAI或高致病性禽流感,主要影響鳥類。其他高致病性禽流感也會(huì)影響鳥類。H5N1的傳播在家禽中是致命的,可能會(huì)產(chǎn)生巨大的經(jīng)濟(jì)后果。全球健康專家說(shuō),了解結(jié)構(gòu)如何影響功能的更多信息可以導(dǎo)致破壞人類和鳥類感染過(guò)程的新方法。
在甲型流感病毒中潛在的抗病毒靶標(biāo)的易感部位中,有一些取決于牛津研究中的關(guān)鍵發(fā)現(xiàn):FluPolA作為單體或二聚體,小分子或分子復(fù)合物存在。
“我們確定了幾個(gè)位點(diǎn),包括FluPolA二聚化界面和病毒RNA的結(jié)合位點(diǎn),”Fodor談到了可能的抗病毒位點(diǎn)。“這些位點(diǎn)可能被小化合物靶向。這個(gè)想法是,如果這些化合物阻止FluPolA二聚化或RNA結(jié)合,這些將起到抗病毒藥物的作用,”他說(shuō)。
“我們還鑒定了一種納米抗體,一種小抗體,可以在FluPolA的特定位點(diǎn)結(jié)合,阻止FluPolA二聚化。當(dāng)我們?cè)诩?xì)胞中表達(dá)這種納米抗體時(shí),細(xì)胞產(chǎn)生的病毒就會(huì)減少,這表明它是抑制性的。”
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