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        第一個微生物專家來自數(shù)千篇論文
        
			
        
				2019-06-23 14:45:04
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        雖然最近的報告顯示存在超過114,000,000份已發(fā)表的科學(xué)文獻的文件，但找到一種方法來改善對這種知識的獲取并有效地綜合它成為一個日益緊迫的問題。
        

        第一個微生物專家來自數(shù)千篇論文
        

        為了解決這個問題，英國科學(xué)家Ross Mounce和劍橋大學(xué)的Peter Murray-Rust以及巴斯大學(xué)的Matthew Wills使用公布的人物圖像中的機器專門提取的數(shù)據(jù)進行了世界上第一次自動化超級建筑的嘗試。他們的研究結(jié)果發(fā)表在開放科學(xué)期刊Research Ideas and Outcomes(RIO)上。
        

        在他們的研究中，研究人員選擇了國際系統(tǒng)學(xué)和進化微生物學(xué)雜志(IJSEM) - 唯一一個托管所有新的有效描述的原核分類群的存儲庫，因此，它是測試自動和半自動合成系統(tǒng)的最佳選擇。已發(fā)表的系統(tǒng)發(fā)育。據(jù)作者稱，IJSEM每年發(fā)布的系統(tǒng)發(fā)育樹圖像數(shù)量超過任何其他期刊。
        

        系統(tǒng)地下載了可追溯到2003年1月的11年篇文章，以便提取系統(tǒng)發(fā)育樹形圖的所有圖像文件進行分析。然后，計算機視覺技術(shù)允許將圖像自動轉(zhuǎn)換回可重復(fù)使用的，可計算的系統(tǒng)發(fā)育數(shù)據(jù)，并用于所有證據(jù)的正式超樹合成。
        

        在他們的研究過程中，科學(xué)家們必須克服版權(quán)所帶來的各種挑戰(zhàn)，正式涵蓋他們?yōu)楣ぷ髂康乃璧膸缀跛形募?。在這一點上，他們面臨著一個相當矛盾的問題 - 雖然科學(xué)文獻中出版的數(shù)據(jù)的易于訪問和重復(fù)使用得到普遍支持和強烈推動，但是通用版權(quán)實踐使得科學(xué)家在將先前編譯的數(shù)據(jù)合并到自己的數(shù)據(jù)時很難有信心。工作。作者討論了英國版權(quán)法的最新變化，這些變化使他們的工作能夠看到光明的一天。因此，他們將其輸出作為事實提供，并使用Creative Commons的CC0豁免將其分配到公共??領(lǐng)域，以使任何人無憂無慮地重復(fù)使用。
        

        “我們現(xiàn)在處于這樣一個階段：沒有人有時間閱讀所有已發(fā)表論文的標題，更不用說摘要了，”作者評論道。
        

        “我們相信機器現(xiàn)在必不可少，使我們能夠理解已發(fā)表科學(xué)的流程，本文還討論了實現(xiàn)這一目標所固有的幾個關(guān)鍵問題。”
        

        “我們故意選擇文獻的一個小節(jié)(限于一個期刊)來減少體積，速度和變化，主要集中在有效性上。我們要問，從半結(jié)構(gòu)化科學(xué)文獻中提取數(shù)據(jù)的高通量機器是否可行和有價值。 “
        
			

			
          
        
			
        
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