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        蘋果基因組序列有助于育種新品種的發(fā)表

        本周的自然遺傳學由一個國際科學家團隊發(fā)表了一個高質(zhì)量的蘋果基因組序列,其中包括荷蘭瓦赫寧根大學和研究所的研究人員。該序列的出版有助于更快和更有針對性地培育具有增加的抗病性,改善的生產(chǎn)性狀和更好的果實品質(zhì)的新蘋果品種。有了這個,結果支持從環(huán)境和財務角度更可持續(xù)地生產(chǎn)蘋果果實。

        蘋果基因組序列有助于育種新品種的發(fā)表

        基因組序列由來自法國,意大利,德國,荷蘭和南非的國際研究機構聯(lián)合組織。基因組數(shù)據(jù)的高質(zhì)量,表明超過4.2萬個推定的基因,是使用最新測序技術的結果,這些技術產(chǎn)生了長鏈DNA序列,非常特定的蘋果品種,以及蘋果開發(fā)的信息量最大的遺傳連鎖圖譜在早期的研究中。

        基因組序列為蘋果基因組的組織提供了新的見解。已經(jīng)通過RNA測序驗證了42,000個推定基因中的93%。這些知識可用于鑒定控制目標性狀的基因,以及用于加速新品種育種的基于DNA的診斷測試的開發(fā)。

        使用所謂的二單倍體蘋果品種對本研究的成功至關重要。蘋果是一種異交物種,使其基因組雜合。此外,蘋果起源于兩個不同物種之間的雜交,其與全基因組復制相結合。因此,每種常規(guī)蘋果品種的每個DNA序列最多有四種變體。本研究中使用的二單倍體變種是特殊的,因為它每個序列只有兩個變體。這導致顯著的復雜性降低,這使得可以產(chǎn)生非常高質(zhì)量的基因組序列。

        蘋果基因組的新見解包括對蘋果17條染色體中重復模式的清晰認識。這有助于鑒定具有類似功能的基因拷貝。接下來,組裝了所謂的“重復區(qū)域”。迄今為止,這些尚未表征的蘋果基因組區(qū)域可能參與調(diào)節(jié)基因表達。最后,發(fā)現(xiàn)了一種新的重復序列,可能對著絲粒特異,這可能會導致染色體分裂和復制的新見解。

        該研究由INRA-Angers的Etienne Bucher協(xié)調(diào)。瓦赫寧根大學和研究所的研究人員為基因組測序,基因組圖譜和裝配做出了貢獻,運用他們在生物信息學方面的經(jīng)驗和技能,并盡早獲得了蘋果中高質(zhì)量的參考遺傳連鎖圖譜。

        瓦赫寧根大學和研究所開發(fā)了新的蘋果品種,產(chǎn)生了頂級品種'Elstar','Santana'和最近發(fā)布的'Natyra'。后兩者適用于生物生產(chǎn),因為這些品種具有抗病性。此外,'Santana'適合大多數(shù)患有輕微蘋果過敏的人食用。

        Wageningen將利用蘋果DNA中的新見解進行有針對性的新品種選育。

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