研究人員設(shè)計(jì)出新的方法來(lái)辨別微生物的食用方式

北卡羅來(lái)納州立大學(xué)和卡爾加里大學(xué)的研究人員設(shè)計(jì)的一項(xiàng)新技術(shù)，可以更深入地了解微生物群落中的新陳代謝和生理學(xué) - 微生物，如細(xì)菌，病毒和我們體內(nèi)的其他微小生命形式。整個(gè)自然。具體而言，新技術(shù)提供了更直接的方式來(lái)確定某種微生物消耗的食物來(lái)源或基質(zhì)。

研究人員使用質(zhì)譜儀以非常高的精度測(cè)量來(lái)自社區(qū)微生物的分子質(zhì)量。然后他們使用新開發(fā)的軟件程序，允許他們將微生物與其底物連接起來(lái)。

連接微生物和底物的基礎(chǔ)是所謂的碳穩(wěn)定同位素比 - 天然存在形式的碳與不同質(zhì)量之間的比率。大自然包含碳-12(最豐富的形式)和碳-13(碳-13)比碳-12還多一個(gè)中子。每種材料具有這兩種同位素的非常特定的比例，其基本上可以用作材料的指紋或特征。新算法將給定環(huán)境中可用于微生物的底物的碳同位素比率與微生物本身中發(fā)現(xiàn)的比率聯(lián)系起來(lái)。

Manuel Kleiner是植物和微生物生物學(xué)系的NC州助理教授，也是報(bào)告該研究的論文的通訊作者，他說(shuō)，理解微生物群落對(duì)于更好地理解動(dòng)植物健康和疾病以及重要的環(huán)境過(guò)程是必要的。例如土壤和海洋中有機(jī)物的分解和養(yǎng)分循環(huán)。

“我們的方法基于你所吃的概念，”克萊納說(shuō)。“如果有一個(gè)具有特定同位素特征的食物來(lái)源，我們發(fā)現(xiàn)具有相同特定同位素特征的微生物，我們可以將兩者聯(lián)系起來(lái)?？脊湃祟悓W(xué)家實(shí)際上使用了類似的技術(shù)，他們可以確定飲食的類型一個(gè)人通過(guò)分析頭發(fā)或骨頭碎片的同位素比率來(lái)吃東西。“

人發(fā)對(duì)于工作技術(shù)至關(guān)重要。克萊納在理發(fā)后將頭發(fā)包裹起來(lái)讓他的理發(fā)師感到驚訝。

“我們必須通過(guò)使用校準(zhǔn)標(biāo)準(zhǔn)來(lái)校正質(zhì)譜過(guò)程中發(fā)生的某些錯(cuò)誤。事實(shí)證明，人發(fā)是校準(zhǔn)儀器的絕佳材料，”Kleiner說(shuō)。

為了測(cè)試新算法，研究人員采集了20個(gè)純培養(yǎng)樣品，并顯示該軟件提供的測(cè)量結(jié)果與質(zhì)譜標(biāo)準(zhǔn)一致。研究人員還將具有不同微生物的復(fù)雜樣本放在一起，并測(cè)試復(fù)雜社區(qū)內(nèi)不同物種的個(gè)體特征。最后，研究人員研究了一種無(wú)腸海洋蠕蟲，它攜帶許多細(xì)菌，并使用該軟件測(cè)試這種共生關(guān)系的代謝。

Kleiner補(bǔ)充說(shuō)，該研究的所有數(shù)據(jù)都是公開的，因此其他研究人員可以測(cè)試和使用新軟件。

鄭重聲明：本文版權(quán)歸原作者所有，轉(zhuǎn)載文章僅為傳播更多信息之目的，如有侵權(quán)行為，請(qǐng)第一時(shí)間聯(lián)系我們修改或刪除，多謝。

推薦內(nèi)容