研究描述了器官和組織再生過程中染色質(zhì)的動態(tài)變化

來自巴塞羅那大學(xué)遺傳學(xué)，微生物學(xué)和統(tǒng)計學(xué)系以及生物醫(yī)學(xué)研究所(UB)的研究人員與基因組調(diào)控中心(CRG)合作，描述了基因表達的基因和調(diào)控元素。組織和器官再生的過程。該研究發(fā)表在Genome Research，通過下一代測序?qū)⒔?jīng)典遺傳分析與染色質(zhì)的新研究技術(shù)相結(jié)合。

作者分析了不同再生時期黑腹果蠅翅膀中成像盤的轉(zhuǎn)錄組。通過對大規(guī)模RNA測序的分析，他們鑒定了在該過程中差異表達的那些基因。此外，他們發(fā)現(xiàn)超過30%的這些基因位于基因簇中。由于對其他物種(小鼠和斑馬魚)進行了比較分析，作者發(fā)現(xiàn)了一組參與再生的基因，這些基因在所有物種中都是保守的。“了解這些生物體共有哪些基因可以幫助我們了解在具有更多有限再生技能的生物體中激活這一過程所必需的東西，例如人類，”Elena Vizcaya-Molina指出。

“這項研究表明，組學(xué)和生物信息學(xué)越來越重要，以了解基本的生物過程，”博士后CRG研究員和UB講師Cecilia Klein指出。新的測序技術(shù)和生物信息學(xué)分析與實驗研究的結(jié)合使研究人員能夠在基因調(diào)控的理解方面取得進展，在這種情況下，再生。

再生中的監(jiān)管要素

在這項研究中，研究人員還發(fā)現(xiàn)了三種與再生相關(guān)的調(diào)節(jié)元素：那些在再生過程中增加活性的元素，從其他發(fā)育階段或其他組織中重復(fù)使用的元素，以及一組獨特的再生元素。“這些調(diào)控元件是能夠引導(dǎo)和塑造基因表達的DNA序列，”Elena Vizcaya說。作者還發(fā)現(xiàn)，這些元素可能被物種中的一些保守基因(蒼蠅，小鼠和斑馬魚)激活。“ 再生的特定調(diào)節(jié)元件的異位激活可能是提高器官不能再生的再生能力的關(guān)鍵工具，”Montserrat Corominas說。

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