極端微生物植物的基因組測(cè)序
Thellungiella parvula是一種能夠在惡劣條件和貧瘠資源的棲息地中生存的植物 - 極端微生物。來(lái)自美國(guó),沙特阿拉伯和韓國(guó)的一組研究人員使用新一代DNA測(cè)序工具來(lái)組裝該物種的基因組草圖,以了解它如何進(jìn)化出其強(qiáng)壯的性格。
研究人員將 T. parvula與 擬南芥(Arabidopsis thaliana)進(jìn)行了比較,擬南芥是一種近似相似的基因組,具有類似大小的基因組,但對(duì)其有壓力敏感性。他們?cè)贜ature Genetics上發(fā)表了他們的發(fā)現(xiàn) 。
這兩種植物的遺傳信息差異很大,主要是通過(guò)基因的串聯(lián)重復(fù)。許多這些重復(fù)的基因負(fù)責(zé)編碼在惡劣環(huán)境中T.plavula存活所必需的功能 。相比之下,擬南芥中存在的重復(fù)基因 適合潮濕,涼爽的環(huán)境。
這些重復(fù)基因的性質(zhì)意味著它們可能在T. parvula的進(jìn)化中起到了 耐受壓力的作用。研究人員認(rèn)為,詳細(xì)檢查基因組結(jié)構(gòu)及其復(fù)雜基因,分析重復(fù)基因編碼的酶,特別是與壓力敏感植物相比,可以幫助我們了解T. parvula如何 在惡劣條件下繁衍生息。這可以幫助科學(xué)家在作物植物中建立應(yīng)激防御,這種植物通常無(wú)法在壓力環(huán)境中生長(zhǎng)。
“植物的干旱和耐鹽性已經(jīng)研究了幾十年,基因工程對(duì)一些基因的修飾幾乎沒(méi)有取得進(jìn)展,”伊利諾伊大學(xué)厄巴納 - 香檳分校的植物生物學(xué)家Maheshi Dassanayake說(shuō)。該論文的作者。“通過(guò) T. parvula基因組,我們更接近于了解自然界對(duì)干旱,鹽度,寒冷和低營(yíng)養(yǎng)土壤的解決方案,并使成功的策略適應(yīng)我們的作物植物。”
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