海灣鮭魚(yú)基因組測(cè)序
來(lái)自俄勒岡大學(xué)和德克薩斯A&M大學(xué)的一組科學(xué)家對(duì)墨西哥灣海草床中豐富的魚(yú)類(lèi)物種海灣尖嘴魚(yú)(Syngnathus scovelli)的基因組進(jìn)行了測(cè)序和探索。該團(tuán)隊(duì)于12月20日在Genome Biology期刊上發(fā)表了研究結(jié)果。
海灣尖嘴魚(yú)屬于稱(chēng)為Syngnathidae(pipe魚(yú),海馬和seadragons)的魚(yú)類(lèi),其歷史可追溯到至少5000萬(wàn)年。
這個(gè)家庭的物種有很長(zhǎng)的鼻子,這有助于他們的抽吸式喂養(yǎng)行為。他們有骨質(zhì)的防彈衣。它們?nèi)狈桥桷?,肋骨和牙齒,并且在雄性中形成了獨(dú)特的胎盤(pán)樣結(jié)構(gòu),用于培育后代的育雛。
“從進(jìn)化基因的角度來(lái)看,這組物種的新奇性尚未得到很好的理解,”共同作者,俄勒岡大學(xué)生態(tài)與進(jìn)化研究所博士后研究員Clay Small博士說(shuō)。
“Syngnathidae家族是研究這些衍生結(jié)構(gòu)特征的非常好的模型分支,因?yàn)閺乃麄儶?dú)特的身體計(jì)劃來(lái)看,它們是如此奇怪。”
“最終,我們有興趣確定與整個(gè)家族中這些新特征的演變有關(guān)的遺傳變化。”
海灣尖嘴魚(yú)基因組的出版發(fā)布一周后,虎尾海馬的基因組(海馬來(lái)了),Syngnathidae的另一個(gè)成員,在自然雜志上宣布。
俄勒岡大學(xué)的資深作者威廉克雷斯科教授表示,“這兩篇論文幾乎同時(shí)發(fā)表,對(duì)這一非同尋常的魚(yú)群進(jìn)行了巨大的基因組分析。”
“兩個(gè)基因組顯示特定基因或基因功能的損失和變化可能是進(jìn)化創(chuàng)新的原因,”Small博士補(bǔ)充道。
“通過(guò)進(jìn)化,與遠(yuǎn)緣?mèng)~類(lèi)祖先相比,尖嘴魚(yú)和海馬基因組遺失了遺傳因素。這些可能解釋了身體排列和骨盆鰭丟失的一些變化,這些變化與人類(lèi)脊椎動(dòng)物血統(tǒng)中的腿相對(duì)應(yīng)。“
團(tuán)隊(duì)努力的一個(gè)重要部分集中在雄性海灣尖嘴魚(yú)在其育雛袋中孕育胚胎的能力。
“海灣尖嘴魚(yú)是一種在各種尖嘴魚(yú)種類(lèi)中發(fā)現(xiàn)的最精細(xì)的胎盤(pán)結(jié)構(gòu)的例子,”共同作者,同樣來(lái)自俄勒岡大學(xué)的Susan Bassham博士說(shuō)。
在男性懷孕期間,大約1,000個(gè)基因在小袋中表達(dá)不同,以控制發(fā)育過(guò)程,營(yíng)養(yǎng)交換,穩(wěn)定性和免疫力。
在對(duì)懷孕和未懷孕的雄性尖嘴魚(yú)進(jìn)行的比較分析中,作者發(fā)現(xiàn)了一個(gè)表現(xiàn)異常的基因家族。
這個(gè)基因家族patristacins包含一些在懷孕期間開(kāi)啟的成員,以及其他在懷孕期間被抑制的成員。這組基因可能是syngnathid魚(yú)類(lèi)獨(dú)有的,它們?cè)诤qR中表現(xiàn)相似。
研究人員還發(fā)現(xiàn),海灣尖嘴魚(yú)的兩條染色體比大多數(shù)鰭魚(yú)都少。
“通過(guò)觀察基因在基因組中的位置模式,這種差異很可能僅僅是由于四個(gè)祖先染色體融合成兩個(gè),”Bassham博士說(shuō)。
“大多數(shù)魚(yú)有24條染色體,但海灣尖嘴魚(yú)有22條。”
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