大象內(nèi)皮皰疹病毒4的完整基因組測(cè)序
大象內(nèi)皮藥物皰疹病毒4的完整基因組,稱為EEHV4(Baylor),已被貝勒醫(yī)學(xué)院和約翰霍普金斯醫(yī)學(xué)院的研究人員測(cè)序,揭示了這種特殊種類的大象內(nèi)皮皰疹病毒的獨(dú)特特征 - 這導(dǎo)致了致命的在管理式護(hù)理和自由放養(yǎng)環(huán)境中影響亞洲大象的疾病。
該研究結(jié)果發(fā)表在美國(guó)微生物學(xué)會(huì)的mSphere當(dāng)前版本中。“這種疾病的致命形式主要與EEHV1有關(guān),但是更溫和的疾病是由EEHV5或EEHV4引起的,其中已知的較少,”貝勒博士分子病毒學(xué)和微生物學(xué)副教授Paul Ling博士說(shuō)。“在這里,我們已經(jīng)確定了完整的基因組DNA序列,由Baylor的人類基因組測(cè)序中心完成,這是一種EEHV4物種,它是從患有EEHV4后從幸存的亞洲象小牛采集的樹(shù)干洗滌樣本中獲得的。”
這只特殊的小牛是休斯頓動(dòng)物園受監(jiān)測(cè)群體的一部分,該動(dòng)物園受益于動(dòng)物園,貝勒,約翰霍普金斯和華盛頓國(guó)家動(dòng)物園之間的研究合作,研究EEHV。該團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了一種快速診斷測(cè)試,可以定期進(jìn)行血液和軀干清洗。
由于這些篩查,研究人員發(fā)現(xiàn),牛群中的一些大象經(jīng)歷了不同種類的EEHV(包括EEHV4)的連續(xù)輕度感染。“很可能牛群最終會(huì)感染多種EEHV物種和亞型,因此了解分子組成并更多地了解不同物種之間的遺傳關(guān)系將提供可能導(dǎo)致控制疾病的信息,”Ling說(shuō)。
研究人員已經(jīng)對(duì)EEHV1A,EEHV1B和EEHV5進(jìn)行了測(cè)序。在EEHV4(Baylor)中,他們發(fā)現(xiàn)了25個(gè)新的或缺失的基因 - 一些存在于EEHV4(Baylor)中但不存在于其他基因中,以及存在于其他基因中但在EEHV4(Baylor)中缺失的基因。
鑒定的另一個(gè)特征是存在26個(gè)旁系同源的跨膜蛋白家族的旁系同源物(來(lái)自同一基因)成員。有關(guān)這些發(fā)現(xiàn)的更詳細(xì)描述可以在隨附的手稿中找到,該手稿目前也在mSphere中發(fā)布。
研究人員還能夠確定這種病毒物種的兩種不同亞型的存在,稱為EEHV4A和EEHV4B。
“仍然存在圍繞EEHV致病性的問(wèn)題,需要更多的研究,”約翰霍普金斯大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Gary S. Hayward博士說(shuō)。“一旦更好地理解了許多物種及其各自亞型的發(fā)病機(jī)制差異,所有基因組類型的序列和基因內(nèi)容的詳細(xì)比較將有望為將來(lái)的診斷,評(píng)估和潛在的疫苗或抗病毒診斷方法提供重要和有用的信息。 ,治療和控制EEHV相關(guān)疾病。“
這是該組測(cè)序的第二個(gè)完整的EEHV基因組,另一個(gè)是2013年的EEHV1A(Kimba)。
參與這項(xiàng)研究的其他人包括:Simon Y. Long,Sarah Y. Heaggans,以及約翰霍普金斯大學(xué)醫(yī)學(xué)院; Angela Fuery,彭榮生,貝勒醫(yī)學(xué)院; Xiang Qin,Kim C. Worley,Shannon Dugan,
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