阿拉伯羚羊基因組序列草案
卡塔爾的研究人員繪制了脆弱的阿拉伯羚羊的基因組圖譜。這種羚羊的角矛類似,它在動物園和自然保護區(qū)中幸存下來,在20世紀70年代被列為滅絕之后。2011年,經(jīng)過圈養(yǎng)育種計劃將該物種從邊緣帶回來后,它僅被國際自然保護聯(lián)盟重新歸類為“易受傷害”。
保護主義者和研究人員希望更好地了解現(xiàn)存羚羊種群的遺傳多樣性,因為羚羊之間數(shù)十年的密集雜交已經(jīng)縮小了遺傳多樣性并威脅了物種的長期生存。
在這項研究中測序的基因組是從保存在卡塔爾Al Wabra野生動物保護區(qū)的年輕雄性動物中檢索出來的,證實了環(huán)保主義者對遺傳多樣性確實非常低的擔憂。
在多哈的卡塔爾威爾康奈爾醫(yī)學院開展這項工作的首席遺傳學家喬爾·馬利克(Joel Malek)警告說,觀察到的低遺傳多樣性可能只在Al Wabra野生動物保護區(qū)的圈養(yǎng)人群中很明顯。唯一可靠的方法是對來自其他圈養(yǎng)種群的基因組進行測序。
“這當然是我們的下一步,”馬利克說。他希望從不同的畜群開始測序至少5-10個羚羊,以更好地了解遺傳現(xiàn)狀。然而,使第一次基因組作圖特別具有挑戰(zhàn)性的是缺乏任何羚羊基因組參考。
“這是一個從頭的序列和裝配,需要特殊的DNA庫和相當大的計算基礎設施,”他說。由于它們具有動物基因組的粗略草圖,因此對其他羚羊的基因組進行測序?qū)⒏尤菀缀捅阋?。雖然第一次測序成本約為300,000美元,但進一步的測序費用僅為10,000美元。
“我們希望盡快開始對它們進行排序,但我們正等待有關(guān)各方的資助,”Malek補充道。
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