轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的功能以前必須從成百上千個(gè)協(xié)同工作的行為中推斷出來
就像小船可以幫助乘客穿越河流一樣,運(yùn)輸者可以在細(xì)胞膜上移動(dòng)物質(zhì)。這個(gè)過程對(duì)于從細(xì)菌到人類的生命形式的細(xì)胞健康運(yùn)作至關(guān)重要。這些轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的功能以前必須從成百上千個(gè)協(xié)同工作的行為中推斷出來。今天發(fā)表在《自然》雜志上的新技術(shù)可以一次研究一種轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白。
如果您僅考慮整個(gè)船隊(duì)的綜合統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù),就想了解一艘特定船的位置,速度和乘客,那么這一強(qiáng)大的優(yōu)勢(shì)就會(huì)成為人們關(guān)注的焦點(diǎn)。
通過觀察單個(gè)分子的活性,我們闡明了轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白活性的潛在機(jī)制的一部分,這可能被證明對(duì)該家族中許多臨床相關(guān)蛋白的未來研究至關(guān)重要。
技術(shù)開辟了新的可能性
這項(xiàng)研究依賴于一種稱為單分子熒光共振能量轉(zhuǎn)移或smFRET的技術(shù)。該方法使研究人員能夠收集各個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白活動(dòng)的精確測(cè)量值。這種前沿技術(shù)是研究作用機(jī)制以及與疾病有關(guān)的突變的強(qiáng)大工具。它在全球的少數(shù)實(shí)驗(yàn)室中都可以使用。
先前的單分子技術(shù)具有測(cè)量所謂“離子通道”的活性的能力,該活性使帶電粒子能夠快速穿過細(xì)胞膜。這些單分子方法徹底改變了對(duì)通道的理解,但由于運(yùn)輸?shù)奈镔|(zhì)種類繁多且運(yùn)輸速度相對(duì)較慢,因此不適用于運(yùn)輸者。新的smFRET方法對(duì)各種運(yùn)輸工具都更有用。
逐步運(yùn)輸
神經(jīng)遞質(zhì):鈉共轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(NSS)是一類轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,最常見于大腦,能將分子移入或移出細(xì)胞。在人類中,神經(jīng)遞質(zhì)5-羥色胺和去甲腎上腺素的NSS是幾乎所有抗抑郁藥的靶標(biāo)。NSS中的多巴胺是苯丙胺和可卡因的主要靶標(biāo)。了解此類蛋白質(zhì)及其功能將為這些治療和濫用藥物的機(jī)理以及如何改善針對(duì)這些轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的療法提供新穎的見解。
研究人員應(yīng)用smFRET研究了NSS蛋白的細(xì)菌親戚:MhsT轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,其將氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)通過細(xì)胞膜。該小組想了解運(yùn)輸過程中最慢的部分,稱為限速步驟。研究人員驚訝地發(fā)現(xiàn),對(duì)于不同的貨物,MhsT運(yùn)輸機(jī)的限速步驟是不同的。
為了使分子穿過膜,轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白會(huì)改變其形狀,既吸收細(xì)胞外部的物質(zhì)又釋放細(xì)胞內(nèi)部的物質(zhì)。研究人員透露,周期最慢的部分是將形狀變回外部的過程,當(dāng)時(shí)運(yùn)輸者被認(rèn)為是空了一些貨物,但沒有其他貨物。
由于不同的貨物具有不同的緩慢步驟,研究結(jié)果表明“返回”步驟并不是空的,而是與轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白上二級(jí)結(jié)合位點(diǎn)的其他證據(jù)相符,這是調(diào)節(jié)其活性的關(guān)鍵。
更好地了解NSS蛋白質(zhì)家族中第二個(gè)結(jié)合位點(diǎn)的功能相關(guān)性,對(duì)于研究靶向這些轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的藥物的藥理學(xué)和功效至關(guān)重要。
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