基因可以揭示我們的來源
研究人員已經(jīng)制作了一種生物地理算法,該算法利用遺傳信息可靠地推斷出一個人的原籍國。由英國謝菲爾德大學(xué)的Eran Elhaik領(lǐng)導(dǎo)的國際研究團隊,包括貝魯特黎巴嫩美國大學(xué)的Pierre Zalloua,對超過1,650名患者的樣本測試了地理人口結(jié)構(gòu)(GPS)算法。以前是基因分型。
該算法在Nature Communications中提出,準確地將83%的個人放在他們的原籍國內(nèi),并將一些人精確定位到他們的城市。
研究人員將GPS與空間祖先分析(SPA)進行了比較,該算法于2012年在Nature Genetics上發(fā)表。只適用于歐洲血統(tǒng)已知的人。Elhaik解釋說,這首先擊敗了該工具的目的。包含一個非歐洲人將使整個隊列的預(yù)測準確度降至零。
“相比之下,全球定位系統(tǒng)使用的是固定參考人口面板并且與樣本無關(guān)。單獨分析樣本或與10,000個其他樣本分析樣本總會產(chǎn)生相同的結(jié)果,”Elhaik補充道。
“如果研究的目的是了解空間遺傳變異的模式,那么SPA將更有用,”SPA算法的共同作者Eleazar Eskin說。“另一方面,GPS是一種專門用于預(yù)測個體位置的方法。如果可以獲得具有已知位置的高精度參考樣本,那么GPS將更準確。”
“全球定位系統(tǒng)的新穎性在于實現(xiàn)群體遺傳學(xué)的新范例,其中所有種群都被認為是混合的,因此可以用混合系數(shù)來表示,而不像其他工具模擬群體作為兩種群體的混合物,”Elhaik說。
創(chuàng)建該算法以精確定位個體的位置;但是當談到混合社區(qū)時;它在跟蹤他們的祖先方面比在精確定位新鮮遷移和現(xiàn)今居住方面更精確。Elhaik建議,17%沒有妥善安置在他們的祖國,可能是因為他們的遷徙歷史。
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