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        計算機模型將基因位點轉變?yōu)榧膊C制
        
			
        
				2018-12-06 15:17:06
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			  來源：
			
        
		
        
				
		
        
			
        雖然全基因組關聯(lián)研究(GWAS)已被證明在揭示與疾病相關的基因位點方面具有無可估量的價值，但確定這些基因座內(nèi)確切的致病變體以及變體如何引起疾病仍然是一項挑戰(zhàn)?，F(xiàn)在，來自德國，卡塔爾，美國和挪威的國際研究團隊開發(fā)了一種基于計算機的模型，稱為系統(tǒng)發(fā)育模塊復雜性分析(PMCA)，用于跟蹤人類基因組中引起疾病??的遺傳變異。
        

        研究人員利用PMCA確定了非編碼基因組區(qū)域的遺傳變異，這些變異結合了轉錄因子以調(diào)節(jié)基因表達，展示了它們?nèi)绾闻c疾病機制相關聯(lián)，并在Cell中發(fā)表了他們的研究結果。
        

        計算機模型將基因位點轉變?yōu)榧膊C制
        

        為了測試PMCA，研究人員將其應用于一組47個2型糖尿病(T2D)風險基因座，在計算機模擬研究中引起胰島素抵抗和胰島素分泌受損等并發(fā)癥。他們發(fā)現(xiàn)基因組中基因調(diào)控的變異導致DNA-蛋白結合增加3.1到101倍。
        

        為了在實驗上測試他們的發(fā)現(xiàn)，研究人員將人類脂肪基質(zhì)細胞中PPARG基因非編碼區(qū)的單堿基變異歸為一類。這種變異阻斷了PPARG2蛋白的活性，PPARG2蛋白在脂肪酸儲存中起作用，破壞葡萄糖代謝并引發(fā)T2D。
        

        他們認為PMCA可用于各種疾病，如癌癥，心肌梗塞和甲狀腺激素抵抗。該研究的共同作者Melina Claussnitzer說：“這些結果為開發(fā)更好的診斷手段和針對各種遺傳疾病的定制療法提供了巨大的希望。”
        
			

			
          
        
			
        
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