DNA測序儀有望徹底改變臨床診斷
在過去的二十年中,新的DNA測序方法一直在革新生物學(xué)。但是大部分的開發(fā)都是在高通量方法中產(chǎn)生許多短DNA讀數(shù),如果它包含重復(fù)序列,如通常在一些細(xì)菌病原體中側(cè)翼新獲得的抗生素抗性基因,那么基因組序列難以組裝。
由東安格利亞大學(xué)的Justin O'Grady領(lǐng)導(dǎo)的一組科學(xué)家的新報告使用了一種名為MinION的新型“長讀取”DNA測序裝置,以確定導(dǎo)致傷寒的細(xì)菌菌株如何變得耐藥多種抗生素。他們在自然生物技術(shù)1報道,該團隊,包括沙特阿拉伯利雅得國王費薩爾??漆t(yī)院和研究中心的Salvatore Rubino,在短短18個小時內(nèi)在傷寒沙門氏菌H58中發(fā)現(xiàn)了抗生素抗性基因島。
“由于基于實驗室的大量測序后分析,這種分析以前需要數(shù)月才能使用傳統(tǒng)方法,”O'Grady說。
MinION使用納米孔DNA測序技術(shù),其中DNA鏈通過嵌入膜中的孔蛋白,在膜上施加電壓。電流的微小波動表明通過孔的DNA堿基序列。Minion音序器只有USB記憶棒的大小,明年將售價650英鎊左右。
“這種技術(shù)使得下一代測序可供所有科學(xué)家使用,”奧格雷迪說。“MinION技術(shù)可能有助于細(xì)菌鑒定,傳染病的診斷以及在臨床需要時檢測耐藥性。”
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