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        了解甘薯用蛋白質(zhì)組學(xué)方法
        
			
        
				2019-06-20 09:14:41
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        甜，淀粉，橙色甘薯是薯?xiàng)l，砂鍋和餡餅的美味和營(yíng)養(yǎng)成分。但是，盡管人類(lèi)幾千年來(lái)一直在種植甘薯，但科學(xué)家對(duì)蛋白質(zhì)的構(gòu)成仍然知之甚少。最近在A(yíng)CS的蛋白質(zhì)組研究雜志上發(fā)表的一項(xiàng)研究中，科學(xué)家分析了甘薯葉片和根的蛋白質(zhì)組，并在此過(guò)程中揭示了植物基因組的見(jiàn)解。
        

        了解甘薯用蛋白質(zhì)組學(xué)方法
        

        甘薯(Ipomoea batatas)是世界上一些地區(qū)的主食。它也常用于動(dòng)物飼料以及工業(yè)產(chǎn)品，如生物燃料。它的基因組令人驚訝地復(fù)雜 - 編碼比人類(lèi)基因組更多的預(yù)測(cè)基因 - 它具有復(fù)雜的化學(xué)成分。
        

        該團(tuán)隊(duì)使用兩種不同的方法從根和葉樣品中提取蛋白質(zhì)，然后將其切割成多肽。然后用液相色譜和質(zhì)譜分析樣品，研究小組在甘薯葉中鑒定出3,143種獨(dú)特蛋白，在根中鑒定出2,928種。甘薯的根(我們吃的部分)具有低蛋白質(zhì)含量，并且葉子具有許多次級(jí)代謝物。這使得提取足夠量的蛋白質(zhì)用于分析變得困難。密西西比州立大學(xué)的Sorina和George Popescu及其同事希望了解蛋白質(zhì)組學(xué)方法 - 同時(shí)分析蛋白質(zhì)和遺傳數(shù)據(jù) - 可以幫助他們更好地了解甘薯根和葉的成分。
        

        當(dāng)他們將蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)與甘薯基因組進(jìn)行比較時(shí)，他們確定了已發(fā)表的基因組序列的某些區(qū)域，其數(shù)據(jù)可以為其提供增強(qiáng)的信息。例如，該分析預(yù)測(cè)了741個(gè)新的蛋白質(zhì)編碼區(qū)域，這些區(qū)域以前不被認(rèn)為是基因。
        

        該組織表示，該結(jié)果可用于幫助進(jìn)一步表征和生物強(qiáng)化塊莖。
        
			

			
          
        
			
        
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