不同的真菌分泌相似的分解酶組
土壤真菌分泌多種酶,這些酶在生物燃料生產(chǎn)和金屬污染土壤和水的生物修復(fù)中發(fā)揮重要作用。最近的一項(xiàng)研究表明,盡管這些酶的氨基酸序列存在物種特異性差異,但不同的真菌物種分泌了豐富的具有相似功能的酶。該研究增強(qiáng)了對(duì)真菌在土壤中發(fā)生的過(guò)程中所起作用的理解。該研究可用于設(shè)計(jì)真菌酶用于生物燃料生產(chǎn)和生物修復(fù)工作。
真菌分泌多種多樣的酶,可以分解頑強(qiáng)的植物材料。這些強(qiáng)效酶降解植物細(xì)胞壁成分例如纖維素和木質(zhì)素,導(dǎo)致二氧化碳從含有死植物材料的土壤釋放到大氣中。因此,真菌酶不僅是氣候動(dòng)力學(xué)的關(guān)鍵驅(qū)動(dòng)因素,而且還有望從生物質(zhì)中經(jīng)濟(jì)有效地開(kāi)發(fā)替代運(yùn)輸燃料。此外,可以利用某些真菌物種的錳[Mn(II)] - 氧化能力來(lái)去除污染的土壤和水中的有毒金屬。然而,很少有研究表征由在環(huán)境中常見(jiàn)的各種Mn(II)氧化真菌分泌的酶。最近,一組研究人員使用液相色譜 - 串聯(lián)質(zhì)譜(LC-MS / MS),基因組分析和生物信息學(xué)分析來(lái)表征和比較四種Mn(II)氧化子囊菌屬物種分泌的酶。
研究人員在環(huán)境分子科學(xué)實(shí)驗(yàn)室(EMSL),能源部(DOE)科學(xué)辦公室用戶(hù)設(shè)施中使用線(xiàn)性離子阱四極桿Orbitrap Velos質(zhì)譜儀進(jìn)行了基于LC-MS / MS的比較蛋白質(zhì)組學(xué)研究。該分析揭示了真菌分泌豐富但功能相似的酶組,盡管這些酶的氨基酸序列存在物種特異性差異。這些發(fā)現(xiàn)增強(qiáng)了對(duì)子囊菌屬物種在生物地球化學(xué)和氣候動(dòng)力學(xué)中的作用的理解,并揭示了可用于可再生能源生產(chǎn)或金屬污染水的生物修復(fù)的木質(zhì)纖維素降解酶。
這項(xiàng)研究代表了哈佛大學(xué),EMSL,太平洋西北國(guó)家實(shí)驗(yàn)室,史密森學(xué)會(huì),美國(guó)能源部聯(lián)合基因組研究所(JGI),國(guó)家科學(xué)研究中心和明尼蘇達(dá)大學(xué)阿卜杜勒阿齊茲國(guó)王大學(xué)Aix-MarseilleUniversit的科學(xué)家之間的合作,以及伍茲霍爾海洋研究所。
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