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        短RNA分子在單細(xì)胞中定位

        Karolinska Institutet的研究人員測(cè)量了個(gè)體胚胎干細(xì)胞中短的非編碼RNA序列的絕對(duì)數(shù)量。新方法可以提高對(duì)我們的基因如何被調(diào)節(jié)和不同細(xì)胞類型發(fā)展的理解。當(dāng)我們使用基因中的信息時(shí),例如構(gòu)建蛋白質(zhì)時(shí),首先將其翻譯成信使RNA,其作為蛋白質(zhì)的藍(lán)圖。我們的細(xì)胞還含有非編碼的短RNA序列,這些序列對(duì)蛋白質(zhì)的形成沒(méi)有貢獻(xiàn),其功能部分未知。其中最著名的是微RNA(miRNA),它可以與信使RNA相互作用,從而調(diào)節(jié)基因和細(xì)胞功能。

        短RNA分子在單細(xì)胞中定位

        卡羅林斯卡醫(yī)學(xué)院的研究人員現(xiàn)在已經(jīng)在單個(gè)細(xì)胞中繪制了短RNA序列的存在。以前對(duì)短RNA分子的研究是基于對(duì)許多細(xì)胞的同時(shí)分析,使得研究其準(zhǔn)確的功能變得困難。“我們對(duì)短RNA分子功能的了解非常普遍。我們有一般機(jī)制的圖片,但不清楚這些分子在不同類型的細(xì)胞或疾病中發(fā)揮的具體作用,”Rickard Sandberg教授說(shuō)。細(xì)胞與分子生物學(xué)系,也隸屬于斯德哥爾摩路德維希癌癥研究中心。

        使用單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)進(jìn)行分析,該技術(shù)使得可以測(cè)量細(xì)胞中短RNA分子的絕對(duì)數(shù)量。使用兩種類型的胚胎干細(xì)胞,旨在模仿早期胚胎,在它附著于子宮內(nèi)膜之前和之后。

        研究人員可以檢測(cè)到兩種細(xì)胞狀態(tài)下的大量小RNA,包括miRNA以及功能在很大程度上未知的較短RNA片段(tRNA和snoRNA)。研究人員還發(fā)現(xiàn),大量的miRNA在兩種細(xì)胞狀態(tài)下表達(dá)不同。

        “這是基礎(chǔ)研究和示范,該方法有效,為進(jìn)一步研究提供了建議。在細(xì)胞中繪制短RNA分子水平是確定這些分子特定功能的第一步,”Omid Faridani說(shuō)。這項(xiàng)研究的主要作者。

        從長(zhǎng)遠(yuǎn)來(lái)看,Rickard Sandberg可以想象該方法的臨床應(yīng)用。

        “例如,我們對(duì)短RNA分子在胚胎發(fā)育過(guò)程中的作用感興趣。我們希望,通過(guò)更多的知識(shí),這種方法可以用來(lái)確定哪些胚胎有最好的發(fā)育機(jī)會(huì),然后用于改善目前的IVF治療,“他說(shuō)。

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