DNA的3-D包裝調(diào)節(jié)細(xì)胞身份
控制細(xì)胞如何形成身份如肌肉細(xì)胞或神經(jīng)細(xì)胞的基本機(jī)制尚不完全清楚。包括癌癥在內(nèi)的多種疾病與細(xì)胞在成熟過程中沿著錯誤的發(fā)育途徑相關(guān)聯(lián)。來自賓夕法尼亞大學(xué)佩雷??爾曼醫(yī)學(xué)院的一項新研究表明,干細(xì)胞分化為心肌(以及通過擴(kuò)展其他細(xì)胞類型)的能力取決于基因組的哪些部分可用于激活,這是受控的通過DNA在細(xì)胞核中的位置。
“這項研究的基礎(chǔ)是了解細(xì)胞對分子線索作出反應(yīng)的能力,以正確地成為一種或另一種細(xì)胞,”資深作者,心血管醫(yī)學(xué)助理教授Rajan Jain博士說。“我們想知道這是如何實現(xiàn)的,一步一步,因為干細(xì)胞能夠成為體內(nèi)的任何細(xì)胞類型,從而產(chǎn)生心肌細(xì)胞。”Jain和聯(lián)合資深作者,Penn Medicine執(zhí)行副院長兼首席科學(xué)官Jonathan A. Epstein博士本周在Cell發(fā)表了他們的研究結(jié)果。
該研究還表明,知道如何控制細(xì)胞在成熟過程中分化的速度對再生醫(yī)學(xué)具有重要意義?;蚪M的某些區(qū)域無法表達(dá),因為它們緊密地包裹在細(xì)胞核的內(nèi)膜上(椎板) )。這些隔離和沉默的DNA區(qū)域稱為Lamin Associated Domains,或LAD。該小區(qū)研究表明,外圍沉默DNA的特定區(qū)域有助于確定細(xì)胞的身份。例如,如果神經(jīng)細(xì)胞基因保持沉默為LAD,則它們不能表達(dá),因此細(xì)胞不會成為神經(jīng)元。然而,如果心臟細(xì)胞基因被釋放并且可以表達(dá),如在心臟發(fā)育期間發(fā)生的那樣,則那些細(xì)胞變成心肌。多年來,細(xì)胞生物學(xué)家已經(jīng)知道在內(nèi)核膜附近發(fā)現(xiàn)了一些DNA,但這種定位的功能尚不清楚。“我們的工作表明,細(xì)胞通過將難以接近的壁櫥存放在其成熟為另一種細(xì)胞類型所必需的關(guān)鍵基因和程序中來定義其身份,”Jain說。“換句話說,一個細(xì)胞是'誰',因為它已經(jīng)沉默了'誰'不是。”Penn團(tuán)隊發(fā)現(xiàn)一種名為組蛋白去乙酰化酶(Hdac3)的表觀遺傳酶將DNA連接到核周邊。“我們問:這種精心設(shè)計的DNA可用性控制是否會導(dǎo)致細(xì)胞變成某種類型?”耆那說。當(dāng)他們刪除Hdac3時干細(xì)胞在心臟細(xì)胞分化期間,它們不受限制的含有心臟特異性基因的DNA區(qū)域,允許這些基因被激活,從而導(dǎo)致早熟,過快的分化。
“這項研究的意義深遠(yuǎn),”愛潑斯坦說。“控制細(xì)胞分化以制造心臟組織或其他細(xì)胞類型的速度的能力對于再生醫(yī)學(xué)具有重要意義。”此外,在包括癌癥在內(nèi)的許多疾病中,細(xì)胞表達(dá)通常不會發(fā)生的基因,從而改變其身份。
該研究還探討了干細(xì)胞和發(fā)育生物學(xué)中稱為“能力”的經(jīng)典概念 - 細(xì)胞以特定方式對其環(huán)境作出反應(yīng)的能力。例如,一些肺細(xì)胞對香煙煙霧的反應(yīng)會變成癌癥,而另一些則不會。研究人員推測,這種差異可能是由于基因組區(qū)域可用于響應(yīng)與香煙煙霧相關(guān)的化學(xué)物質(zhì),或者因為在無核應(yīng)答細(xì)胞中這些相同基因的不可用性被鎖定在核周邊的沉默區(qū)域。
耆那教徒,愛潑斯坦和其他人正在努力確定核周邊的基因組域的變化,或者保留它們的分子系鏈?zhǔn)欠袷前┌Y易感性的原因。這種方法也可以應(yīng)用于其他疾病,例如由于椎板的遺傳性遺傳異常導(dǎo)致的幾種形式的肌營養(yǎng)不良,心力衰竭和過早衰老。“我們的目標(biāo)是確定這些突變是否會導(dǎo)致DNA的異常束縛以及基因表達(dá)和疾病的變化。”
在未來,研究人員計劃操縱DNA的空間組織以誘導(dǎo)細(xì)胞采用不同的身份,并詢問可能在與人體疾病相關(guān)的人類疾病中起什么作用,包括糖尿病,阿爾茨海默病,心力衰竭的形式和癌癥。該小組還在擴(kuò)大他們的工作,以研究核膜組分突變的患者。
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