基因驅(qū)動(dòng)修改為運(yùn)行等位差事
新的基因驅(qū)動(dòng)系統(tǒng)引入了非常適合傳遞相對(duì)輕微的遺傳變異的齒輪,即僅涉及一個(gè)或幾個(gè)堿基對(duì)的等位基因變體。典型的基因驅(qū)動(dòng)系統(tǒng)配置為復(fù)制相對(duì)較大的DNA貨物序列。新的基因驅(qū)動(dòng)系統(tǒng) - 或等位基因驅(qū)動(dòng)系統(tǒng) - 有利于或不利于選擇的等位基因,并有望加速?gòu)?fù)雜基因型的組裝,這些基因型可能包括“點(diǎn)突變等位基因與插入轉(zhuǎn)基因相結(jié)合,用于多種研究和應(yīng)用目的”。說(shuō)它的創(chuàng)造者。
等位基因驅(qū)動(dòng)來(lái)自加州大學(xué)圣地亞哥分校(UCSD)的細(xì)胞和發(fā)育生物學(xué)教授Ethan Bier博士的實(shí)驗(yàn)室。根據(jù)Bier及其同事的說(shuō)法,等位基因驅(qū)動(dòng)裝置配備了指導(dǎo)RNA(gRNA),該指導(dǎo)RNA指導(dǎo)CRISPR系統(tǒng)切割基因的不需要的變體,并用該基因的首選版本替換它。新驅(qū)動(dòng)器擴(kuò)展了科學(xué)家通過(guò)精確編輯修改生物種群的能力。
在其潛在應(yīng)用的一個(gè)實(shí)例中,已經(jīng)變得對(duì)殺蟲(chóng)劑具有抗性的農(nóng)業(yè)害蟲(chóng)中的特定基因可以被原始的天然遺傳變體替代,所述原始天然遺傳變體使用選擇性交換單個(gè)蛋白質(zhì)殘基(氨基酸)的同一性的等位基因驅(qū)動(dòng)賦予對(duì)殺蟲(chóng)劑的敏感性。
除了農(nóng)業(yè)應(yīng)用之外,攜帶疾病的昆蟲(chóng)可能成為等位基因驅(qū)動(dòng)的目標(biāo)。
“如果我們將這種正?;膅RNA整合到基因驅(qū)動(dòng)元件上,例如,設(shè)計(jì)用于免疫蚊子抵抗瘧疾,那么所產(chǎn)生的等位基因驅(qū)動(dòng)將通過(guò)群體傳播。當(dāng)這種雙重作用驅(qū)動(dòng)器遇到抗殺蟲(chóng)劑的等位基因時(shí),它將使用野生型易感等位基因進(jìn)行切割和修復(fù),“比爾說(shuō)。“結(jié)果是,幾乎所有新出現(xiàn)的后代都會(huì)對(duì)殺蟲(chóng)劑敏感,并且對(duì)瘧疾傳播不敏感。”
新系統(tǒng)的詳細(xì)信息出現(xiàn)在4月9日的自然通訊期刊上,標(biāo)題為“在果蠅中有效的等位基因驅(qū)動(dòng)。”這篇文章描述了比爾的團(tuán)隊(duì)如何測(cè)試等位驅(qū)動(dòng)的兩種配置:復(fù)制切割,其中一個(gè)非優(yōu)先等位基因選擇性地靶向Cas9 /指導(dǎo)RNA(gRNA)切割,以及更通用的方法,復(fù)制移植,其允許選擇性遺傳位于gRNA切割位點(diǎn)附近的所需等位基因。
“復(fù)制切割涉及Cas9-gRNA復(fù)合物選擇性切割一個(gè)等位基因變體,然后進(jìn)行同源定向修復(fù)(HDR)介導(dǎo)的修復(fù)和替換,用反式提供的同一基因的不可切割等位基因,”該文章的作者寫(xiě)道。“第二種,更普遍適用的等位基因驅(qū)動(dòng)形式,我們稱(chēng)之為復(fù)制移植,涉及復(fù)制短基因組間隔,其包含接近gRNA切割位點(diǎn)的有利等位基因。在拷貝嫁接的情況下,優(yōu)選的等位基因與抗gRNA切割的相鄰序列相關(guān)。
雖然在果蠅中得到證實(shí),但新技術(shù)還具有在昆蟲(chóng),哺乳動(dòng)物和植物中廣泛應(yīng)用的潛力。據(jù)研究人員稱(chēng),等位驅(qū)動(dòng)技術(shù)的幾種變異可以通過(guò)作物的有利特性組合來(lái)開(kāi)發(fā),例如,在貧瘠的土壤和干旱環(huán)境中茁壯成長(zhǎng),以幫助養(yǎng)活不斷增長(zhǎng)的世界人口。除了環(huán)境應(yīng)用,等位基因驅(qū)動(dòng)應(yīng)該使動(dòng)物模型的下一代工程能夠研究人類(lèi)疾病,并回答基礎(chǔ)科學(xué)中的重要問(wèn)題。
“迫使物種使用等位基因驅(qū)動(dòng)器恢復(fù)其自然敏感狀態(tài)將有助于打破不斷增加的環(huán)境破壞性農(nóng)藥過(guò)度使用的向下循環(huán),”加州大學(xué)圣地亞哥分校Bier實(shí)驗(yàn)室項(xiàng)目科學(xué)家Annabel Guichard博士指出,該論文第一作者。
“這項(xiàng)研究的一個(gè)意想不到的發(fā)現(xiàn)是,這種等位驅(qū)動(dòng)器產(chǎn)生的錯(cuò)誤不會(huì)傳遞給下一代,”她補(bǔ)充說(shuō)。“這些突變反而產(chǎn)生了一種不同尋常的殺傷力形式,被稱(chēng)為'致命鑲嵌現(xiàn)象'。這個(gè)過(guò)程通過(guò)立即消除基于CRISPR的驅(qū)動(dòng)器產(chǎn)生的不必要的突變,有助于提高等位基因驅(qū)動(dòng)器的效率。“
致命鑲嵌現(xiàn)象主要消除NHEJ誘導(dǎo)的突變并有利于功能性抗切割等位基因的遺傳。
比爾團(tuán)隊(duì)表示,他們的等位驅(qū)動(dòng)方法,通過(guò)致命鑲嵌現(xiàn)象和他們稱(chēng)之為陰影驅(qū)動(dòng)的跨代驅(qū)動(dòng)過(guò)程,可以“在改善健康和農(nóng)業(yè)方面具有廣泛的實(shí)際應(yīng)用,并大大擴(kuò)展了活躍的遺傳工具箱”。
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