人類癌癥中癌癥突變的不斷擴(kuò)大的景觀
表觀遺傳途徑中的突變是常見(jiàn)的致癌驅(qū)動(dòng)因子。組蛋白是染色質(zhì)修飾和重塑酶的基本底物,在包括神經(jīng)膠質(zhì)瘤,肉瘤,頭頸癌和癌肉瘤的腫瘤中發(fā)生突變。
經(jīng)典的“癌基因組”突變發(fā)生在組蛋白H3的N-末端尾部,并影響多梳抑制因子復(fù)合物1和2(PRC1和PRC2)的功能。然而,組蛋白突變?cè)谄渌[瘤背景中的流行和功能尚不清楚。在這里,我們顯示體細(xì)胞組蛋白突變發(fā)生在不同腫瘤類型和組蛋白蛋白質(zhì)關(guān)鍵區(qū)域的約4%(保守估計(jì))。
突變發(fā)生在所有四個(gè)核心組蛋白中,在N-末端尾部和球狀組蛋白折疊結(jié)構(gòu)域中,以及在含有重要翻譯后修飾的殘基處或附近。許多球狀結(jié)構(gòu)域突變與酵母突變體同源,其消除了對(duì)SWI / SNF功能的需要,發(fā)生在組蛋白H2A和H2B的關(guān)鍵調(diào)節(jié)“酸性斑塊”中,或預(yù)測(cè)會(huì)破壞H2B-H4界面。
組蛋白突變數(shù)據(jù)集和這里提出的關(guān)于突變對(duì)重要染色質(zhì)功能的影響的假設(shè)應(yīng)該作為染色質(zhì)和癌癥生物學(xué)領(lǐng)域的資源和起點(diǎn),探索組蛋白突變?cè)诎┌Y中的擴(kuò)展作用。
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