對(duì)于抵御病毒的微生物 快速響應(yīng)意味著更好的防御
在細(xì)菌之間的戰(zhàn)斗中,開放射擊通常是注射。一種旨在感染微生物的病毒刺穿細(xì)胞的保護(hù)壁并插入其自身的遺傳密碼。洛克菲勒大學(xué)的一項(xiàng)新研究揭示了微生物如何迅速采取行動(dòng)來(lái)抵御使用CRISPR的傳染威脅,CRISPR是一種細(xì)菌免疫系統(tǒng),也是編輯基因組的有力工具。這項(xiàng)發(fā)現(xiàn)在3月29日的“ 自然”雜志上有所描述,它回答了一個(gè)關(guān)于CRISPR如何工作的長(zhǎng)期問(wèn)題。
科學(xué)家已經(jīng)了解了基礎(chǔ)知識(shí):當(dāng)細(xì)菌細(xì)胞被病毒DNA侵入時(shí),其CRISPR 系統(tǒng)會(huì)捕獲它的片段并對(duì)這些DNA片段進(jìn)行編目。如果同一病毒再次出現(xiàn),系統(tǒng)將很快識(shí)別出來(lái)。“大約十年來(lái),我們已經(jīng)知道CRISPR通過(guò)獲取病毒DNA片段而起作用,但在感染過(guò)程中發(fā)生CRISPR免疫的關(guān)鍵步驟時(shí),它確實(shí)是一個(gè)謎,”實(shí)驗(yàn)室負(fù)責(zé)人Luciano A. Marraffini說(shuō)。細(xì)菌學(xué),在其天然細(xì)菌中研究CRISPR系統(tǒng)。
在他的實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行的實(shí)驗(yàn)表明,當(dāng)病毒注入細(xì)胞時(shí),CRISPR會(huì)早期起作用。
為了確定時(shí)間安排,研究小組設(shè)計(jì)了一個(gè)實(shí)驗(yàn)來(lái)阻止不同時(shí)間點(diǎn)的病毒生命周期。博士后Joshua W. Modell和研究生Wenyan Jiang隨后檢查了CRISPR系統(tǒng),了解他們何時(shí)以及如何從病毒中獲取間隔物。
只有任何DNA都不適用于CRISPR; 以前的研究表明,它有利于DNA的松散末端的間隔物。這種偏好縮小了選擇范圍,因?yàn)椴《綝NA僅在感染的某些點(diǎn)上呈線性形式; 剩下的時(shí)間它的兩端粘在一起,形成一個(gè)圓圈。
該團(tuán)隊(duì)在三點(diǎn)停止感染。但不管他們什么時(shí)候停止它,CRISPR繼續(xù)獲得間隔物,表明它在開始時(shí)將它們撿起來(lái),當(dāng)病毒將其基因組注入細(xì)胞時(shí)。
早期防守
這個(gè)時(shí)間很重要。通過(guò)從病毒的第一部分取出間隔物進(jìn)入細(xì)胞,CRISPR確保它會(huì)在下次出現(xiàn)時(shí)立即攻擊病毒。當(dāng)研究人員改變CRISPR系統(tǒng)以包含與病毒基因組末端的序列匹配的間隔物時(shí),最后一部分是注射的,微生物難以增殖。“事實(shí)證明,CRISPR系統(tǒng)非常聰明,”Modell說(shuō)。“利用病毒感染周期的細(xì)微差別,盡早停止感染。”
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